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From Japanese society for quantitative biology

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定量生物学に関わる研究者間の情報交換を促進するために、新しく News page を設けました。

情報掲載に関する問い合わせ先

当ページへの情報の掲載を希望される方は、ご所属、連絡先、掲載内容及びいつまでに情報を掲載してほしいかを明記の上、下記メールアドレスまでご連絡頂きますようよろしくお願い致します。世話人が掲載手続きを進めさせて頂きます。尚、定量生物学の会のメンバーでなくても情報の掲載を受け付けますので、ぜひ積極的にご活用下さい。

連絡先:q.biology at gmail.com (迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください)

研究費などのお知らせ

New!! JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度研究提案の募集(第1期)について

このたびJSTは、戦略的創造研究推進事業「CREST」「さきがけ」において、平成27年度の研究提案を募集(第1期)いたします。 詳細につきましては、募集要項および研究提案募集をご覧ください。 URL: http://www.senryaku.jst.go.jp/teian.html

■応募締切   CREST:平成27年5月19日(火)正午 厳守   さきがけ:平成27年5月12日(火)正午 厳守 ※余裕を持って、お早めの提出をいただくようお願いいたします。

■研究提案を募集する研究領域 〔CREST〕

  • 「現代の数理科学と連携するモデリング手法の構築」(研究総括:坪井 俊)
  • 「人間と調和した創造的協働を実現する知的情報処理システムの構築」(研究総括:萩田 紀博)
  • 「統合1細胞解析のための革新的技術基盤」(研究総括:菅野 純夫)
  • 「二次元機能性原子・分子薄膜の創製と利用に資する基盤技術の創出」(研究総括:黒部 篤)
  • 「再生可能エネルギーからのエネルギーキャリアの製造とその利用のための革新的基盤技術の創出」(※CREST・さきがけ複合領域)」(研究総括:江口 浩一)
  • 「素材・デバイス・システム融合による革新的ナノエレクトロニクスの創成」(※CREST・さきがけ複合領域)(研究総括:桜井 貴康、副研究総括:横山 直樹)
  • 「超空間制御に基づく高度な特性を有する革新的機能素材等の創製」(研究総括:瀬戸山 亨)
  • 「科学的発見・社会的課題解決に向けた各分野のビッグデータ利活用推進のための次世代アプリケーション技術の創出・高度化」(研究総括:田中 譲)
  • 「ビッグデータ統合利活用のための次世代基盤技術の創出・体系化」(※CREST・さきがけ複合領域)(研究総括:喜連川 優、副研究総括:柴山 悦哉)

〔さきがけ〕

  • 「社会的課題の解決に向けた数学と諸分野の協働」(研究総括:國府 寛司)
  • 「社会と調和した情報基盤技術の構築」(研究総括:安浦 寛人)
  • 「統合1細胞解析のための革新的技術基盤」(研究総括:浜地 格)
  • 「再生可能エネルギーからのエネルギーキャリアの製造とその利用のための革新的基盤技術の創出」(※CREST・さきがけ複合領域)」(研究総括:江口 浩一)
  • 「素材・デバイス・システム融合による革新的ナノエレクトロニクスの創成」(※CREST・さきがけ複合領域)(研究総括:桜井 貴康、副研究総括:横山 直樹)
  • 「疾患における代謝産物の解析および代謝制御に基づく革新的医療基盤技術の創出」(研究総括:小田 吉哉)
  • 「超空間制御と革新的機能創成」(研究総括:黒田 一幸)
  • 「ビッグデータ統合利活用のための次世代基盤技術の創出・体系化」(※CREST・さきがけ複合領域)(研究総括:喜連川 優、副研究総括:柴山 悦哉)

■研究提案募集ホームページ(随時更新)について: 募集要項のダウンロード、各研究領域の募集説明会や面接選考日に関する情報の掲載など、最新情報を発信しています。応募をお考えの方はぜひご覧ください。
URL: http://www.senryaku.jst.go.jp/teian.html

■研究提案募集に関するお問い合わせ先: ※研究提案募集ホームページのお問い合わせフォームをご利用ください。
 独立行政法人科学技術振興機構(JST)戦略研究推進部  (募集専用)E-mail:rp-info@jst.go.jp  (募集専用)TEL 03-3512-3530

これまでに掲載したお知らせ

  • JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度CREST・さきがけ研究提案募集(第1期)の予告及び説明会の開催について
  • CREST「生命動態」領域 H26年度領域説明会の御案内
  • 「統合データベース講習会」受入れ機関募集のお知らせ
  • ライフサイエンスデータベース統合推進事業「統合データ解析トライアル」平成25年度研究開発提案募集
  • 戦略的創造研究推進事業 (CREST、さきがけ)  平成25年度研究提案の募集開始
  • 独立行政法人科学技術振興機構(JST) 平成25年度CREST・さきがけ研究提案募集説明会のご案内

研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ

第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内

【開催日】 2015年9月8 日(火), 9日(水)

【開催地】 理化学研究所 多細胞システム形成研究センター (RIKEN CDB)

【URL】 http://www.cdb.riken.jp/mechanistic2015/

【参加・演題〆切】  2015年7月17日(金)

【参加費】 一般:4,000円 学生:1,000円

【言語】 英語

【基調講演】 Frank Jülicher (Max Planck Institute for the Physics of Complex Systems, Germany) 濱田博司 (理研CDB & 大阪大学) Pierre-François Lenne (Institute for Developmental Biology of Marseille, France)

【招待講演】 Yu-Chiun Wang (理研CDB) 石東博 (基礎生物学研究所) 水野大介 (九州大学) 豊田雄介 (久留米大学) 武部貴則 (横浜市立大学 & Stanford University, USA) 藤本仰一 (大阪大学) 永樂元次 (理研CDB) 奥田覚 (理研CDB)

【概要】 本会議では、多細胞の発生・再生現象について、形態観察・力計測・再構成・モデリングの4つの観点から概観し、その理解に関する今後の展開について議論するものであります。このような力学的・工学的なアプローチを、これまでに蓄積された分子遺伝学的・細胞生物学的なアプローチと合わせることにより、発生・再生現象の基本原理についての理解を深めることを期待しております。

本会のトピックは以下のものを予定しています。 1) Observations of morphological dynamics in embryogenesis 2) Quantitative measurements of active and passive cell behaviors 3) In vitro reconstructions and controls of multicellular structures 4) Computational simulations of multicellular systems

本会では、世界的な研究者たちと次世代の研究を切り開く若手研究者や学生が一堂に会して議論を深めることにより、新たな知見を生み出し、人的交流が促進されることを期待しております。 活発な情報交換の場を設けるため、一般参加者によるポスター発表を募り、いくつかの演題には口頭発表をお願いする予定です。若手研究者や大学院生を含む、多くの方々からのご応募をお待ちしております。

【お問い合わせ】 CDBミーティング事務局 多細胞システム形成研究センター 研究推進室内 〒650-0047神戸市中央区港島南町2-2-3 E-mail: mechanistic2015@cdb.riken.jp

The 26th CDB Meeting Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization

【Date】 Sept. 8 (Thu) - 9 (Wed), 2015

【Venue】 RIKEN Center for Developmental Biology (CDB), Kobe, Japan

【URL】 http://www.cdb.riken.jp/mechanistic2015/

【Deadline for registration and abstract submission】 July 17 (Fri), 2015

【Participation Fee】 General Participant: 4,000 JPY Student: 1,000 JPY

【Language】 English

【Keynote Speakers】 Frank Jülicher (Max Planck Institute for the Physics of Complex Systems, Germany) Hiroshi Hamada (RIKEN Center for Developmental Biology & Osaka University, Japan) Pierre-François Lenne (Institute for Developmental Biology of Marseille, France)

【Confirmed Speakers】 Yu-Chiun Wang (RIKEN Center for Developmental Biology, Japan) Shi Dongbo (National Institute for Basic Biology, Japan) Daisuke Mizuno (Kyushu University, Japan) Yusuke Toyoda (Kurume University, Japan) Takanori Takebe (Yokohama City University, Japan & Stanford University, USA) Koichi Fujimoto (Osaka University, Japan) Mototsugu Eiraku (RIKEN Center for Developmental Biology, Japan) Satoru Okuda (RIKEN Center for Developmental Biology, Japan) + Several selected speakers from Poster Session

【Outline】 This meeting aims to discuss multicellular dynamics and its regulation by exploring the interface between biology and mechanics. The understanding of development has been greatly advanced by discoveries in genetics, which have identified molecular factors underlying characteristic morphologies and functions. We are now trying to bridge our understanding at the genetic and molecular levels to that of integrated multicellular systems. This meeting will focus on mechanical aspects of multicellular organization to open up a more comprehensive understanding of such systems.

We will address biological and mechanical aspects of multicellular morphogenesis, including the following topics. 1) Observations of morphological dynamics in embryogenesis 2) Quantitative measurements of active and passive cell behaviors 3) In vitro reconstructions and controls of multicellular structures 4) Computational simulations of multicellular systems

The program will include both oral and poster sessions. We encourage the submission of abstracts for the poster session from scientists in various fields to increase opportunities for lively and exciting discussion. Several abstracts will be selected for oral presentations. We welcome exciting new topics from young investigators as well as established scientists. We hope you will honor us with your attendance.

【Contact】 CDB Meeting Office RIKEN Center for Developmental Biology 2-2-3 Minatojima-minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan E-mail: mechanistic2015@cdb.riken.jp

これまでに掲載したお知らせ

  • CDBシンポジウム2015案内
  • 2015年度「統合データベース講習会」受入れ機関募集
  • バイオイメージデータ解析の公開講座のご案内
  • 数理生物学サマーレクチャーコース第2回~データ解析入門~」のお知らせ
  • 京都大学生命科学研究科特別講義のお知らせ
  • 光イメージング若手研究会「光塾」のお知らせ

求人情報のお知らせ

New!! ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)

発生生物学かコンピューターモデルの経験があり、ショウジョウバエの翅のコンピューターモデルのプロジェクトに興味のある方を募集中。詳細はPDFをご覧下さい。 Media:ECDev_postdoc.pdf

JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト研究員募集

JST・ERATO「佐藤ライブ予測制御プロジェクト」予測制御データ解析グループで は、ライフサイエンスの諸問題を対象に統計科学や機械学習の研究を行う研究員 1名を募集します。細胞分子イメージング等のリアルタイム計測を活用し、生体 システムの時空間動態を適応的に予測制御する問題にチャレンジします。研究内 容・雇用形態等につきまして、詳細はこちらhttp://daweb.ism.ac.jp/yoshidalab/erato/CFP201403.pdf

■プロジェクト:  JST・ERATO佐藤ライブ予測制御プロジェクト  代表:佐藤 匠徳 株式会社 国際電気通信基礎技術研究所  期間:平成31年3月31日  http://www.jst.go.jp/erato/research_area/ongoing/sly_PJ.html

■研究内容: 細胞・分子イメージング計測等のリアルタイムデータと統計科学の手法を組み合 わせ、生体システムの時空間動態を適応的に予測制御する。この問題を解く基盤 技術が、ベイズ統計学とデータ同化である。データ同化は、気象予報などの地球 科学の分野で生まれたデータと数理モデルの統合解析手法であり、さまざまなタ イプの逆問題の解法を与える。例えば、モデルに含まれる物理パラメータや初期 場の推定、部分観測データからシステム全体の内部状態を推定する目的に用いら れる。データ同化の理論基盤を担うのがベイズ統計学であり、現在は統計科学の 研究対象となり技術革新が展開されている。本グループは、ベイズ統計学とデー タ同化を方法論の基軸として、細胞・分子イメージング技術、オミックスデータ 解析、モデリング、シミュレーション、アルゴリズム、並列計算等の方法論を構 築し、生体システムのライブ予測制御の概念実証を示す。さらにデータサイエン ス独自の視点からバイオサイエンスの問題に対するユニークな切り口を発見し、 新しい戦略応用分野を開拓する。

■勤務地:  京都府相楽郡精華町光台 2 丁目2-2(けいはんな学研都市)  (株) 国際電気通信基礎技術研究所 http://www.atr.jp/index.html

■職種:  研究員(ポスドク相当)

■勤務/雇用形態:  常勤(任期あり)(単年度契約)  任期:採用日から平成 27 年 3 月 31 日  但し雇用期間は最長で、平成 31 年 3 月 31 日までとする。

■募集人員:  1 名

■選考方法:  書類審査と面接による

■採否の決定:  メール等により個別に連絡

■応募書類:  1.履歴書(書式自由)  2.研究業績リスト(書式自由)  3.これまでの研究概要(A4二枚以内)  4.候補者の研究能力・実績と人格に関して評価できる2名の連絡先  ※提出書類は返却いたしませんので、ご了承下さい。

■書類送付先: 〒190-8562 東京都立川市緑町10-3  情報・システム研究機構 統計数理研究所  (JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト・グループリーダー)  吉田 亮
 TEL: 050-5533-8534  研究室HP: http://daweb.ism.ac.jp/yoshidalab/  E-mail: yoshidar@ism.ac.jp  ※E-mail (PDF, Wordファイル) による応募も受け付けます

JST・CREST 研究員募集

生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員を募集致します。

業務内容: JST CESTプロジェクト「細胞間接着・骨格の秩序形成メカニズムの解明と上皮バリア操作技術の開発」の趣旨にそって、実験との共同研究のもと、上皮細胞系の細胞構造の形成過程、およびin vitro構成系実験の数理モデリングと解析を行う。研究内容の詳細に関しては、本研究課題に関する内容で、応募者の専門分野等を考慮して議論の上で決定致します。詳細は石原(shuji@complex.c.u-tokyo.ac.jp)までお問い合わせください。物理学,統計科学,数理生物学などの関連分野の専門性をもつ方で、生命科学分野において理論と実験との共同研究をとおした新規分野の開拓に興味があるかたのご応募をお待ちします。なお、本プロジェクトは研究代表者である月田早智子研究室(大阪大学•in vivo実験)、分担研究者である大岩和弘研究室(NICT•構成系実験)、米村重信研究室(理研CDB•培養系)との共同研究です。

応募資格:着任時期までに博士号を取得していること。

着任時期は2014年1月以降のできるだけ早い時期。待遇は東京大学特任研究員の規定に準じます。任期は年度毎更新で、評価によりプロジェクト終了(2018年3月末予定)まで再更新可能。適任者が決まり次第締め切ります。

件名に「PD募集」と明記し、以下の書類を添付して石原(shuji@complex.c.u-tokyo.ac.jp)までメールをしてください。 ①履歴書 ②主要な業績のリスト ③主要論文3本以内のPDF ④応募理由書 研究経歴や当研究課題で貢献できること (A4 2枚程度)  ⑤応募者について照会可能な研究者の方のemailアドレス

書類審査結果をメールでお知らせ致します。書類審査通過者に対しては、面接を実施致します。

京大情・論理生命学研・研究員募集

京都大学 大学院情報学研究科 論理生命学分野では博士研究員を募集しております。システム同定/システム制御, 物理学, 統計科学, 脳科学, 計算論的神経科学, 数理モデリング, 顕 微鏡画像処理, システム生物学,バイオインフォマティクス以上いずれかについての専門性を持つかたで, 新しい分野へのチャレンジに興味をお持ちのかたのご応募をお待ちいたし ております.

また, 皆様の身の回りに適任者おられましたらぜひ声をおかけください!

詳細はこちら:http://hawaii.sys.i.kyoto-u.ac.jp/home/news/78147a7654e152df96c6no

研究分野: 1.生化学反応システムのモデリングと制御 2.脳機能コネクトミクスおよび、情動系神経回路のシミュレーション研究

プロジェクト1:  JST-CREST 研究領域「生命動態の理解と制御のための基礎技術の創出」  研究課題名「時間情報コードによる細胞制御システムの解明」  平成24年10月1日から平成30年3月31日まで

プロジェクト2:  文部科学省-JSTプロジェクト「脳科学研究戦略推進プログラム」  研究課題名「情動の制御機構を解明するための神経情報基盤の構築(課題G)」  平成24年度1月20日から平成28年3月31日まで

給与:  京都大学特定研究員の規定によります。 (年俸制。年俸は経験、職務などを考慮決定)  詳細は担当までお問い合わせ下さい。

勤務形態:  常勤(任期あり)  裁量労働制で週38時間45分相当  任期1年、更新可(最長上記各プロジェクト完了まで)

人数:若干名

着任時期;  平成25年10月1日以降の早い時期。現在博士後期課程に在籍中の方で、平成25年度10月あるいは平成26年3月に修了見込みの方はその旨をご明記下さい。

ご応募方法: ・履歴書(写真貼り付け、電子メールアドレスを明記) ・研究業績リスト ・主要論文のコピー(最大3件程度まで、各一部) ・これまでの研究の要約およびこれからの研究に関する展望 (A4用紙1枚~2枚程度、プロジェクト1, 2の希望を明記してください) ・応募者についての意見を伺える方1~2名のご氏名と連絡先 以上を電子ファイルの形で添付したE-mailを seimei2013 [at] sys.i.kyoto-u.ac.jpまでお送りください。

もしくは、紙ベースでの送付を望まれる方は担当の  石井信 611-0011 京都府宇治市五ヶ庄 まで博士研究員応募書類在中と明記した封筒を お送りいただければ受理できます.

その他お問い合わせは seimei2013 [at] sys.i.kyoto-u.ac.jp までお送りください。

募集期間と選考方法: 募集期間は平成25年9月1日までとします。 書類選考のうえ、面接により選考を行います。詳細は別途連絡します。 適任者が決まり次第、募集を終了します。


当研究室には、2013年7月現在、 石井信(数理工学) 大羽成征(バイオインフォマティクス、統計科学) 前田新一(情報理論、機械学習)、 浦久保秀俊 (計算神経科学、システム生物学)

近藤洋平(数理生物学) 中江 健(統計科学、計算神経科学) 山尾将隆 (システム生物学) の各研究者が在籍し、数理工学から脳神経科学、システム生物学、ブレインマシンインターフェースなどへの融合領域への研究展開を、ATR脳情報研究所、理化学研究所、沖縄科学技術大学院大学、New York Universityなどの研究 機関との連携の下で、実施しております。


研究室のホームページ http://ishiilab.jp 京都大学情報学研究科システム科学専攻のホームページ http://www.sys.i.kyoto-u.ac.jp/index.html

独立行政法人理化学研究所、統合生命医科学研究センター統合ゲノミクスグループ 研究員または特別研究員の公募

募集職種 研究員または特別研究員 1名

職務内容:  分子生物学的手法、シークエンス技術、光学顕微鏡、マイクロチップ技術など を基にして、単一細胞や少数細胞を対象にした新しい計測方法の開発を行いま す。また、開発した方法を用いて、医科学的に重要な試料を測定し、新しい切り 口でサイエンスや医科学に貢献することを目指します。

勤務地: 独立行政法人理化学研究所 統合生命医科学研究センター (神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22)

着任時期: 平成25年7月1日以降、できるだけ早い時期(応相談)

研究内容についての問合せ先: 独立行政法人理化学研究所統合生命医科学研究センター 統合ゲノミクス研究グループ  城口克之 E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ さい。

公募の詳細: http://www.riken.go.jp/careers/researchers/20130627/

これまでに掲載したお知らせ

  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任研究員の公募
  • 沖縄科学技術大学院大学学園(OIST)バイオインフォマティシャンの求人の募集
  • 「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域の「時間情報コードによる細胞制御システムの解明」(代表者:黒田真也(東京大学))研究員の募集
  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任助教等の公募
  • 東京大学黒田研 特任助教募集募集
  • Biology/Genetics/Evolution Postdoctoral Fellow Position, Fred Hutchinson Cancer Research Center (091006)