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From Japanese society for quantitative biology
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=== 研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ ===
 
=== 研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ ===
==== 案内:The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -:国際シンポジウム参加者およびポスター発表者の募集 ====
 
・テーマ: The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -<br/>
 
・日時:  2020年2月27日(木)~28日(金)<br/>
 
・場所:  (株)国際電気通信基礎技術研究所(ATR)京都府相楽郡精華町光台二丁目2-2(けいはんな学研都市)<br/>
 
・言語:  英語<br/>
 
・参加費:  アカデミック参加者 無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)<br/>
 
・昼食代:  1,000円(28日のみ)<br/>
 
・懇親会費:  7,000円<br/>
 
・参加申し込み・ポスター演題提出: ホームページより事前申し込み<br/>
 
・締め切り:  2020年2月13日(木)<br/>
 
・URL: https://human-informatix.atr.jp/ <br/>
 
・内容
 
近年の生命科学の分野は、従来のバイオや医学のみの概念や手法だけではなく、数理科学、計算科学、情報科学、工学、物理学などの概念や手法を取り入れ、全身全細胞全遺伝子レベルで統合的にとらえる研究が活発に行われている。
 
また、これらの異分野融合的なアプローチにより、破壊的技術革新による新たな医療産業が生まれようとしている。そこで、本シンポジウムは、国内外よりシステムバイオロジー、バイオインフォマティクス、機械学習の分野で活躍するトップレベルの研究者を演者として招聘し、関連分野の最先端の研究を発表していただく。
 
それにより、国内外の産官学の機関で研究開発や事業に携わる方々に当該分野の勉強および分野を超えた交流の場を提供する。さらに、本研究分野は(特に国内)現状、女性研究者が極度のUnderrepresentedである。したがって、招待講演者の半分を女性のトップレベル研究者にすることで、この分野における女性研究者の活性化(特に国内)を促進する。本シンポジウムではV-iCliniXに関連する発表を中心にプログラムを構成し、2日目にはERATO佐藤ライブ予測制御プロジェクトの最終成果を含め、様々な情報を社会に発信し報告する機会を設ける。<br/>
 
・連絡先 シンポジウム事務局:tns-sec@atr.jp<br/>
 
 
  
 
====これまでに掲載したお知らせ====
 
====これまでに掲載したお知らせ====
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*案内:The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -:国際シンポジウム参加者およびポスター発表者の募集
 
* 案内:BDRシンポジウム2020:参加・演題申し込み募集中!
 
* 案内:BDRシンポジウム2020:参加・演題申し込み募集中!
 
*3 Days Exploration of Reinforcement Learning & Biological Intelligence
 
*3 Days Exploration of Reinforcement Learning & Biological Intelligence

Revision as of 04:48, 11 September 2020

News

定量生物学に関わる研究者間の情報交換を促進するために、新しく News page を設けました。

情報掲載に関する問い合わせ先

当ページへの情報の掲載を希望される方は、ご所属、連絡先、掲載内容及びいつまでに情報を掲載してほしいかを明記の上、下記メールアドレスまでご連絡頂きますようよろしくお願い致します。世話人が掲載手続きを進めさせて頂きます。尚、定量生物学の会のメンバーでなくても情報の掲載を受け付けますので、ぜひ積極的にご活用下さい。

連絡先:q.biology at gmail.com (迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください)

研究費などのお知らせ

2020年度 CREST・さきがけ・ACT-X公募スケジュールについて

公募のスケジュール JSTは、戦略目標の達成に向けた研究領域及び研究総括を選定し、以下のスケジュールで戦略的創造研究推進事業(CREST・さきがけ・ACT-X)の2020年度研究課題の公募・選定等を行う予定です。 2020年度の研究課題の公募・選定は、2018年度、2019年度に発足した研究領域(以下、「既存研究領域」と称します)と2020年度に発足する新規研究領域(以下、「新規研究領域」と称します)とで、期間を2回に分けて行います。 なお、本研究提案募集の予告は、国会における令和2年度政府予算の成立を前提として行っています。

<第1期(既存研究領域)スケジュール>  ・3月下旬~5月中旬 研究課題の公募  ・5月下旬~9月中旬 研究課題の選定  ・10月1日(予定) 研究の開始

<第2期(新規研究領域)スケジュール>  ・4月中旬~6月中旬 研究課題の公募  ・6月下旬~11月中旬 研究課題の選定  ・12月1日(予定) 研究の開始

(注)以上のスケジュールは現時点での予定であり予告無く変更することがありますので、予めご了承ください。

公募に関する情報は下記webページで随時更新しておりますのでご覧ください。 https://www.jst.go.jp/kisoken/boshuu/teian.html

●問合せ先  国立研究開発法人科学技術振興機構 戦略研究推進部[募集専用]  E-mail:rp-info@jst.go.jp 問合せは必ず左記メールアドレスにお願い致します。  電話番号:03-3512-3530(受付時間:10:00~12:00/13:00~17:00)   ※土曜日、日曜日、祝日を除く 電話でご質問いただいた場合でも、電子メールでの対応をお願いすることがあります

これまでに掲載したお知らせ

  • JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度研究提案の募集(第1期)について
  • JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度CREST・さきがけ研究提案募集(第1期)の予告及び説明会の開催について
  • CREST「生命動態」領域 H26年度領域説明会の御案内
  • 「統合データベース講習会」受入れ機関募集のお知らせ
  • ライフサイエンスデータベース統合推進事業「統合データ解析トライアル」平成25年度研究開発提案募集
  • 戦略的創造研究推進事業 (CREST、さきがけ)  平成25年度研究提案の募集開始
  • 独立行政法人科学技術振興機構(JST) 平成25年度CREST・さきがけ研究提案募集説明会のご案内

研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ

これまでに掲載したお知らせ

  • 案内:The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -:国際シンポジウム参加者およびポスター発表者の募集
  • 案内:BDRシンポジウム2020:参加・演題申し込み募集中!
  • 3 Days Exploration of Reinforcement Learning & Biological Intelligence
  • BDRシンポジウム2019参加者募集中!
  • CDBシンポジウム2018のご案内
  • 4th International Workshop on Quantitative Biology (IWQB2017) Registration Open
  • CDBシンポジウム2017参加者募集中!
  • 第28回CDBミーティング “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”開催のご案内
  • The 28th CDB Meeting “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions” Call for Application and Abstract Submission!
  • 第27回CDBミーティング Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces のお知らせ
  • The 27th CDB Meeting. Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces
  • CDBシンポジウム2016/CDB Symposium 2016 参加者募集中!
  • 第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内
  • CDBシンポジウム2015案内
  • 2015年度「統合データベース講習会」受入れ機関募集
  • バイオイメージデータ解析の公開講座のご案内
  • 数理生物学サマーレクチャーコース第2回~データ解析入門~」のお知らせ
  • 京都大学生命科学研究科特別講義のお知らせ
  • 光イメージング若手研究会「光塾」のお知らせ

求人情報のお知らせ

New!! 北海道大学大学院 先端生命科学研究院 助教の公募

[募集の背景] 北海道大学大学院先端生命科学研究院では細胞生物学分野の新たな研究展開を目指す助教(テニュアトラック)を公募します。細胞装置学研究室では,根源的な生命現象である細胞複製・ゲノム安定性制御に関する研究を,様々な実験モデルや手法を用いて展開しています(https://altair.sci.hokudai.ac.jp/uehara_lab/)。同研究室のスタッフと協力しながら,独自の研究技術を持ち込んで,自由な発想で研究教育活動を設計,推進できる方を募集します。専門性の垣根を越えた研究展開のために,幅広い研究分野からの応募を希望しております。      

[所  属] 大学院先端生命科学研究院

[専門分野] 細胞生物学,分子生物学,発生生物学,生物物理学

[職務内容] 大学院先端生命科学研究院,大学院生命科学院及び理学部(全学教育を含む)に係る教育研究に従事するとともに,全学及び研究院等における各種委員会委員等の管理運営業務に従事

[担当科目] 大学院では生命科学院生命科学専攻生命融合科学コースおよびソフトマター専攻における生物系の講義科目を担当(英語による講義を含む),学部では理学部生物科学科(高分子機能学)における専門科目および学科・学部共通科目,その他全学教育科目を担当します。

[募集人員] 助教 1名(常勤・テニュアトラック(任期5年))。在職期間(最大5年)の間に中間評価及びテニュア審査を行い,その結果により任期なしの助教への移行が可能です。

[勤務地住所等] 札幌市北区北10条西8丁目

[着任時期] 2021年4月1日以降のできるだけ早い時期

[応募資格] (1)博士号を有するか,採用時までに取得見込みの方。 (2)生命科学分野(動植物・菌類などを用いた細胞生物学,分子生物学,発生生物学,生物物理学)において優れた研究能力と実績を有している方。

[提出期限] 2020年10月30日(金)必着

[提出書類] (1)履歴書(様式任意,賞罰を含む,顔写真添付)※平成25年4月1日以降,北海道大学に在職経験(非常勤講師,TA,TF,RA,短期支援員等すべての職種を含む。)のある者は,当該職歴を漏れなく記載すること。 (2)研究業績リスト: a)原著論文(査読有のみ)(責任著者に*印を記すとともに,被引用件数と,当該雑誌のインパクトファクターを付記すること),b) 総説・解説,c)著書,d) 特許(出願・登録,国内・国際の区分を明記すること),e) 外部資金取得実績(代表と分担の区別を明記すること),f) その他,社会貢献等,g) 応募者のh-index(使用したデータベース名を明記すること)。 (3)これまでの研究の概要(A4用紙2ページ以内) (4)今後の研究と教育に対する抱負(A4用紙2ページ以内) (5)所見を求めうる方2名の氏名と連絡先 (6)主要論文別刷り3編以内(コピー可)。 提出書類作成要領の詳細につきましては,北海道大学先端生命科学研究院ホームページ・採用情報 (https://life.sci.hokudai.ac.jp/fa/jobs) に掲載の補足説明を参考にしてください。

[選考方法] 書類審査に合格した場合,面接を実施します。 尚,その際の交通費等は応募者の負担となりますことをあらかじめご了承願います。

[応募方法] 郵送または電子メール ※応募書類は選考目的以外に使用しません。選考後に本学の責任において処分いたします。

[書類送付先・問い合わせ先] 〒060-0810 札幌市北区北10条西8丁目  北海道大学大学院先端生命科学研究院 人事選考委員長 出村誠 E-mail: advlfsci_apply@sci.hokudai.ac.jp ※郵送の場合には簡易書留で「先端生命科学研究院・教員応募書類在中(細胞装置学)」と朱書 ※電子メールの場合にはタイトルを「先端生命科学研究院・教員応募(細胞装置学)」とし,上記記載の応募書類を合計20MB以下の添付PDF(パスワード設定)にして下さい。応募書類の内容確認後,「受付」の返信メッセージをお送りします。 [応募内容の問い合わせ先] 北海道大学大学院先端生命科学研究院 細胞装置学研究室 上原亮太 E-mail:ruehara@sci.hokudai.ac.jp 備 考  北海道大学では,多様な人材による教育・研究活動の推進,男女共同参画推進に努めており,女性の積極的な応募を歓迎します。また,教育・研究活動と生活の両立支援,能力発揮・活躍環境整備に努めています。本公募により採用するテニュアトラック教員は,本学先端生命科学研究院の定めにより中間評価,テニュア審査等を行います。

Updated!! Systems Human Biology and Medicine, Several Postdoctoral Fellows and Senior Scientists Positions Available

The Thomas N. Sato BioMEC-X Laboratories, Advanced Telecommunications Research Institute International, Kyoto, JAPAN
Website:http://www.tnsl.atr.jp/en/index.html

We take integrative approaches toward deciphering human body homeostasis, diseases and longevity. We combine molecular/cellular biology and genomics approaches with informatics, machine learning, mathematics and computer sciences using both animal models (mouse and zebrafish) and clinical subjects/data. Using these inter-disciplinary methods and concepts, we aim to understand how human physiology works and how human disease onset, progression and also longevity is regulated. We also conduct multiple large-scale multi-feature (multi-omics, physiology, clinical) studies with both healthy and disease human subjects.
Our ultimate goal is to develop mathematical models capturing the human’s whole-body level comprehensive physiology and disease and aging processes in the computer.
We are looking for several self-motivated and interdisciplinary-minded scientists who are willing to take challenges to tackle ambitious projects by joining our international and inter-disciplinary team.

Preferred backgrounds and skills:
PhD, MD, or MD/PhD in informatics, mathematics, data sciences, physics, computer sciences, biological sciences, medical sciences, or other related areas. (Some BS or MS levels are also considered for engineers or programmers positions that are also available in our lab)

Applications:
Please send/email CV (including the publication list) to: Thomas N. Sato, Ph.D. The Thomas N. Sato BioMEC-X Laboratories, ATR 2-2-2 Hikaridai, Seika-cho, Soraku-gun, Kyoto, Japan 619-0288 Email: island1005@gmail.com

References:
T. Akanuma, C. Chen, T. Sato, R.M.H. Merks, T.N. Sato (2016) Memory of cell shape biases stochastic fate decision-making despite mitotic rounding. Nature Communications, 7:11963.

S. Kozawa, T. Akanuma, T. Sato, Y.D. Sato, K. Ikeda, T.N. Sato (2016) Read-time prediction of cell division timing in developing zebrafish embryo. Scientific Reports, 6:32962.

N. Takada, M. Omae, F. Sagawa, N.C. Chi, S. Endo, S. Kozawa, T.N. Sato (2017) Re-evaluating the functional landscape of the cardiovascular system during development. Biology Open, 6: 1756-1770.

S. Kozawa, R. Ueda, K. Urayama, F. Sagawa, S. Endo, K. Shizaki, H. Kurosu, G. Almeida, S.M. Hasan, K. Nakazato, S. Ozaki, Y. Yamashita, M. Kuro-o, T.N. Sato (2018). The body-wide transcriptome landscape of disease models. iScience (Cell Press), 2, 238-268.

S. Kozawa, F. Sagawa, S. Endo, G. M. De Almeida, Y. Mitsuishi, T. N.Sato (2020) Predicting Human Clinical Outcomes using Mouse Multi−Organ Transcriptome. iScience (Cell Press) doi: 10.1016/j.isci.2019.100791

理化学研究所細胞システム動態予測研究チーム研究員募集

国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 細胞システム動態予測研究チーム(PI:城口克之)

募集職種: 研究員 1名

研究室の概要: 当研究室では、細胞システム動態の理解、予測、制御を目指し、新しい計測システムを構築することで、これまでに知られていない生命現象の発見、解明を試みています。特に、顕微鏡観察、オミックス計測(網羅的遺伝子発現解析など)などを組み合わせて、各細胞の特徴や内部状態を同定し、それらの細胞がシステム全体にどのような影響を与えるかなどについて研究しています。また、これらの研究により医科学への貢献も目指しています。

参考URL http://www.bdr.riken.jp/jp/research/labs/shiroguchi-k/

職務内容: 顕微鏡観察、1細胞操作、遺伝子配列・発現解析(次世代シークエンサ)、画像解析、機械・深層学習などに関連した技術や装置を開発・改良しながら、免疫、発生、再生、老化研究など(のいずれか)を実施する。

勤務地: 国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 大阪府吹田市古江台6-2-3

着任時期: 早目(応相談)

研究内容についての問合せ先: 国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター 城口克之 E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ さい。 お気軽にご相談ください。

公募の詳細: https://www.riken.jp/careers/researchers/20190603/

Seeking a Research Scientist, Laboratory for Prediction of Cell Systems Dynamics (PI: Katsuyuki Shiroguchi), RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research

Available Position: Research Scientist, one person, full-time.

Our lab: We want to develop new techniques to "see" something unknown, in order to understand biological systems and to contribute to medical science and our understanding of diseases. Especially, we are focusing on visualizing the distribution of cell states by accurate system-wide measurements with single molecule and/or single cell resolution. We are also developing a new system to study cell systems dynamics and to predict the cell fate by live imaging, cell manipulation, sequencing, etc. Biological targets may be development, differentiation, regeneration, immune system, etc.

Reference: http://www.bdr.riken.jp/en/research/labs/shiroguchi-k/index.html

Job Descriptions: A successful candidate will develop new method(s), including instruments, to measure parameters quantitatively from single cells, a few cells, or cells from tissues based on techniques of optical microscope, microfluidics, cell biology, and/or molecular biology, bioinformatics, machine learning, and will measure samples which are important in biology and medical sciences. Biological targets may be organoids, tissues, immune cells, etc, to study development, differentiation, regeneration, aging, immune system, etc.

Work location: RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, 6-2-3 Furuedai Suita Osaka 565-0874 Japan

Start of Employment: Earlier is better (Negotiable)

Inquiries for research contents Katsuyuki Shiroguchi Email: katsuyuki.shiroguchi[at]riken.jp Laboratory for Prediction of Cell Systems Dynamics RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research

Details:https://www.riken.jp/en/careers/researchers/20190603/

これまでに掲載したお知らせ

  • 京大「大規模脳神経3次元回路抽出から計算論的神経科学へ」研究員募集
  • 国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募
  • Seeking Research Scientist or Postdoctoral Researcher, Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
  • 明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募
  • ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)
  • JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト研究員募集
  • JST CRESTプロジェクト「細胞間接着・骨格の秩序形成メカニズムの解明と上皮バリア操作技術の開発」研究員募集
  • 京大情・論理生命学研・研究員募集
  • 独立行政法人理化学研究所、統合生命医科学研究センター統合ゲノミクスグループ 研究員または特別研究員の公募
  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任研究員の公募
  • 沖縄科学技術大学院大学学園(OIST)バイオインフォマティシャンの求人の募集
  • 「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域の「時間情報コードによる細胞制御システムの解明」(代表者:黒田真也(東京大学))研究員の募集
  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任助教等の公募
  • 東京大学黒田研 特任助教募集募集
  • Biology/Genetics/Evolution Postdoctoral Fellow Position, Fred Hutchinson Cancer Research Center (091006)