Difference between revisions of "News"

From Japanese society for quantitative biology
(34 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 9: Line 9:
  
 
=== 研究費などのお知らせ ===
 
=== 研究費などのお知らせ ===
====<span style="color: red">New!!</span> JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度研究提案の募集(第1期)について====
 
 
このたびJSTは、戦略的創造研究推進事業「CREST」「さきがけ」において、平成27年度の研究提案を募集(第1期)いたします。
 
詳細につきましては、募集要項および研究提案募集をご覧ください。
 
URL: http://www.senryaku.jst.go.jp/teian.html
 
 
■応募締切
 
  CREST:平成27年5月19日(火)正午 厳守
 
  さきがけ:平成27年5月12日(火)正午 厳守
 
※余裕を持って、お早めの提出をいただくようお願いいたします。
 
 
■研究提案を募集する研究領域
 
〔CREST〕
 
*「現代の数理科学と連携するモデリング手法の構築」(研究総括:坪井 俊)
 
*「人間と調和した創造的協働を実現する知的情報処理システムの構築」(研究総括:萩田 紀博)
 
*「統合1細胞解析のための革新的技術基盤」(研究総括:菅野 純夫)
 
*「二次元機能性原子・分子薄膜の創製と利用に資する基盤技術の創出」(研究総括:黒部 篤)
 
*「再生可能エネルギーからのエネルギーキャリアの製造とその利用のための革新的基盤技術の創出」(※CREST・さきがけ複合領域)」(研究総括:江口 浩一)
 
*「素材・デバイス・システム融合による革新的ナノエレクトロニクスの創成」(※CREST・さきがけ複合領域)(研究総括:桜井 貴康、副研究総括:横山 直樹)
 
*「超空間制御に基づく高度な特性を有する革新的機能素材等の創製」(研究総括:瀬戸山 亨)
 
*「科学的発見・社会的課題解決に向けた各分野のビッグデータ利活用推進のための次世代アプリケーション技術の創出・高度化」(研究総括:田中 譲)
 
*「ビッグデータ統合利活用のための次世代基盤技術の創出・体系化」(※CREST・さきがけ複合領域)(研究総括:喜連川 優、副研究総括:柴山 悦哉)
 
 
〔さきがけ〕
 
*「社会的課題の解決に向けた数学と諸分野の協働」(研究総括:國府 寛司)
 
*「社会と調和した情報基盤技術の構築」(研究総括:安浦 寛人)
 
*「統合1細胞解析のための革新的技術基盤」(研究総括:浜地 格)
 
*「再生可能エネルギーからのエネルギーキャリアの製造とその利用のための革新的基盤技術の創出」(※CREST・さきがけ複合領域)」(研究総括:江口 浩一)
 
*「素材・デバイス・システム融合による革新的ナノエレクトロニクスの創成」(※CREST・さきがけ複合領域)(研究総括:桜井 貴康、副研究総括:横山 直樹)
 
*「疾患における代謝産物の解析および代謝制御に基づく革新的医療基盤技術の創出」(研究総括:小田 吉哉)
 
*「超空間制御と革新的機能創成」(研究総括:黒田 一幸)
 
*「ビッグデータ統合利活用のための次世代基盤技術の創出・体系化」(※CREST・さきがけ複合領域)(研究総括:喜連川 優、副研究総括:柴山 悦哉)<br>
 
 
■研究提案募集ホームページ(随時更新)について:
 
募集要項のダウンロード、各研究領域の募集説明会や面接選考日に関する情報の掲載など、最新情報を発信しています。応募をお考えの方はぜひご覧ください。<br>
 
URL: http://www.senryaku.jst.go.jp/teian.html
 
 
■研究提案募集に関するお問い合わせ先:
 
※研究提案募集ホームページのお問い合わせフォームをご利用ください。<br>
 
 独立行政法人科学技術振興機構(JST)戦略研究推進部
 
 (募集専用)E-mail:rp-info@jst.go.jp
 
 (募集専用)TEL 03-3512-3530
 
  
 
==== これまでに掲載したお知らせ====
 
==== これまでに掲載したお知らせ====
 +
* JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度研究提案の募集(第1期)について
 
*JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度CREST・さきがけ研究提案募集(第1期)の予告及び説明会の開催について
 
*JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度CREST・さきがけ研究提案募集(第1期)の予告及び説明会の開催について
 
* CREST「生命動態」領域 H26年度領域説明会の御案内
 
* CREST「生命動態」領域 H26年度領域説明会の御案内
Line 61: Line 20:
  
 
=== 研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ ===
 
=== 研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ ===
 +
==== <span style="color: red">New!! </span>CDBシンポジウム2018参加者募集中!====
 +
テーマ: Dynamic Homeostasis: From Development to Aging
 +
日時: 2018年3月26日(月)~28日(水)
 +
場所: 理化学研究所 多細胞システム形成研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド)
 +
言語: 英語
 +
参加費: 無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)
 +
昼食代: 3,000円(3日間)
 +
懇親会費: 一般5,000円/学生1,000円
 +
参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み
 +
締め切り: 2017年12月15日(金)
 +
URL:http://www.cdb.riken.jp/sympo2018/
  
====<span style="color: red">New!! </span> 第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内====
+
内容・概要:
【開催日】
+
組織恒常性は、その言葉の持つイメージとは裏腹に動的に制御されています。細胞や組織は、その維持・成熟・再生の過程で高度に適応しながら様々な環境変化に応答し、損傷の際にはその内外に存在する制御システムを動員して修復に当たります。このような組織のロバストネスや可塑性の制御には、幹細胞機構、組織内・組織間のシステミック調節、エピジェネティクス制御といった様々なシステムが関与しています 。動的恒常性機能の欠陥は発生異常に直結する一方、老化現象はそのゆるやかな機能低下と捉えることもできます。本シンポジウムでは、動的恒常性に関して細胞レベルから個体レベルまで幅広いトピックスを網羅し、将来展望しつつ新たな切り口を模索することを目指します。
2015年9月8 日(火), 9日(水)
 
 
 
【開催地】
 
理化学研究所 多細胞システム形成研究センター (RIKEN CDB)
 
 
 
【URL】
 
http://www.cdb.riken.jp/mechanistic2015/
 
 
 
【参加・演題〆切】 
 
2015年7月17日(金)
 
 
 
【参加費】
 
一般:4,000円
 
学生:1,000円
 
 
 
【言語】
 
英語
 
 
 
【基調講演】
 
Frank Jülicher (Max Planck Institute for the Physics of Complex Systems, Germany)
 
濱田博司 (理研CDB & 大阪大学)
 
Pierre-François Lenne (Institute for Developmental Biology of Marseille, France)
 
 
 
【招待講演】
 
Yu-Chiun Wang (理研CDB)
 
石東博 (基礎生物学研究所)
 
水野大介 (九州大学)
 
豊田雄介 (久留米大学)
 
武部貴則 (横浜市立大学 & Stanford University, USA)
 
藤本仰一 (大阪大学)
 
永樂元次  (理研CDB)
 
奥田覚  (理研CDB)
 
 
 
【概要】
 
本会議では、多細胞の発生・再生現象について、形態観察・力計測・再構成・モデリングの4つの観点から概観し、その理解に関する今後の展開について議論するものであります。このような力学的・工学的なアプローチを、これまでに蓄積された分子遺伝学的・細胞生物学的なアプローチと合わせることにより、発生・再生現象の基本原理についての理解を深めることを期待しております。
 
 
 
本会のトピックは以下のものを予定しています。
 
1) Observations of morphological dynamics in embryogenesis
 
2) Quantitative measurements of active and passive cell behaviors
 
3) In vitro reconstructions and controls of multicellular structures
 
4) Computational simulations of multicellular systems
 
 
 
本会では、世界的な研究者たちと次世代の研究を切り開く若手研究者や学生が一堂に会して議論を深めることにより、新たな知見を生み出し、人的交流が促進されることを期待しております。
 
活発な情報交換の場を設けるため、一般参加者によるポスター発表を募り、いくつかの演題には口頭発表をお願いする予定です。若手研究者や大学院生を含む、多くの方々からのご応募をお待ちしております。
 
 
 
【お問い合わせ】
 
CDBミーティング事務局
 
多細胞システム形成研究センター 研究推進室内
 
〒650-0047神戸市中央区港島南町2-2-3
 
E-mail: mechanistic2015@cdb.riken.jp
 
 
 
====The 26th CDB Meeting Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization====
 
 
 
【Date】
 
Sept. 8 (Thu) - 9 (Wed), 2015
 
 
 
【Venue】
 
RIKEN Center for Developmental Biology (CDB), Kobe, Japan
 
 
 
【URL】
 
http://www.cdb.riken.jp/mechanistic2015/
 
 
 
【Deadline for registration and abstract submission】
 
July 17 (Fri), 2015
 
 
 
【Participation Fee】
 
General Participant: 4,000 JPY
 
Student: 1,000 JPY
 
 
 
【Language】
 
English
 
 
 
【Keynote Speakers】
 
Frank Jülicher (Max Planck Institute for the Physics of Complex Systems, Germany)
 
Hiroshi Hamada (RIKEN Center for Developmental Biology & Osaka University, Japan)
 
Pierre-François Lenne (Institute for Developmental Biology of Marseille, France)
 
 
 
【Confirmed Speakers】
 
Yu-Chiun Wang (RIKEN Center for Developmental Biology, Japan)
 
Shi Dongbo (National Institute for Basic Biology, Japan)
 
Daisuke Mizuno (Kyushu University, Japan)
 
Yusuke Toyoda (Kurume University, Japan)
 
Takanori Takebe (Yokohama City University, Japan & Stanford University, USA)
 
Koichi Fujimoto (Osaka University, Japan)
 
Mototsugu Eiraku (RIKEN Center for Developmental Biology, Japan)
 
Satoru Okuda (RIKEN Center for Developmental Biology, Japan)
 
+ Several selected speakers from Poster Session
 
  
【Outline】
+
トピックスとしては、以下のものを予定しています。
This meeting aims to discuss multicellular dynamics and its regulation by exploring the interface between biology and mechanics. The understanding of development has been greatly advanced by discoveries in genetics, which have identified molecular factors underlying characteristic morphologies and functions. We are now trying to bridge our understanding at the genetic and molecular levels to that of integrated multicellular systems. This meeting will focus on mechanical aspects of multicellular organization to open up a more comprehensive understanding of such systems.
+
(1) Maintenance of tissue integrity, (2) Homeostatic disorder, (3) Systemic control and metabolism, (4) Aging, (5) Chromosomal and epigenetic control, (6) Cell lineage and single cell analysis
  
We will address biological and mechanical aspects of multicellular morphogenesis, including the following topics.
+
本シンポジウムでは、世界的な研究者たちと次世代の研究を切り開く若手研究者や学生が一堂に会して議論を深めることにより、新たな知見を生み出し人的交流が促進されることを期待しております。
1) Observations of morphological dynamics in embryogenesis
 
2) Quantitative measurements of active and passive cell behaviors
 
3) In vitro reconstructions and controls of multicellular structures
 
4) Computational simulations of multicellular systems
 
  
The program will include both oral and poster sessions. We encourage the submission of abstracts for the poster session from scientists in various fields to increase opportunities for lively and exciting discussion. Several abstracts will be selected for oral presentations. We welcome exciting new topics from young investigators as well as established scientists. We hope you will honor us with your attendance.
+
本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、一部の演題には口頭発表をお願いする予定です。また、海外からの参加者(大学院生、研究員)を対象としたTravel Fellowshipを用意し、国内外からの多数の参加申込をお待ちいたしております。
  
【Contact】
+
連絡先:
CDB Meeting Office
+
CDBシンポジウム2018事務局
RIKEN Center for Developmental Biology
+
国立研究開発法人 理化学研究所 多細胞システム形成研究センター
2-2-3 Minatojima-minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan
+
学術集会担当
E-mail: mechanistic2015@cdb.riken.jp
+
〒650-0047 神戸市中央区港島南町2-2-3
 +
TEL: 078-306-3009 / FAX: 078-306-3090
 +
E-mail: sympo2018@cdb.riken.jp
  
 
====これまでに掲載したお知らせ====
 
====これまでに掲載したお知らせ====
 +
*4th International Workshop on Quantitative Biology (IWQB2017) Registration Open
 +
*CDBシンポジウム2017参加者募集中!
 +
*第28回CDBミーティング “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”開催のご案内
 +
*The 28th CDB Meeting “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions” Call for Application and Abstract Submission!
 +
*第27回CDBミーティング Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces のお知らせ
 +
*The 27th CDB Meeting. Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces
 +
*CDBシンポジウム2016/CDB Symposium 2016 参加者募集中!
 +
*第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内
 
* CDBシンポジウム2015案内
 
* CDBシンポジウム2015案内
 
* 2015年度「統合データベース講習会」受入れ機関募集
 
* 2015年度「統合データベース講習会」受入れ機関募集
Line 178: Line 67:
  
 
=== 求人情報のお知らせ ===
 
=== 求人情報のお知らせ ===
====<span style="color: red">New!!</span> ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)====
 
発生生物学かコンピューターモデルの経験があり、ショウジョウバエの翅のコンピューターモデルのプロジェクトに興味のある方を募集中。詳細はPDFをご覧下さい。
 
[[Media:ECDev_postdoc.pdf]]
 
 
====JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト研究員募集====
 
JST・ERATO「佐藤ライブ予測制御プロジェクト」予測制御データ解析グループで
 
は、ライフサイエンスの諸問題を対象に統計科学や機械学習の研究を行う研究員
 
1名を募集します。細胞分子イメージング等のリアルタイム計測を活用し、生体
 
システムの時空間動態を適応的に予測制御する問題にチャレンジします。研究内
 
容・雇用形態等につきまして、詳細はこちらhttp://daweb.ism.ac.jp/yoshidalab/erato/CFP201403.pdf
 
 
■プロジェクト:
 
 JST・ERATO佐藤ライブ予測制御プロジェクト
 
 代表:佐藤 匠徳  株式会社 国際電気通信基礎技術研究所
 
 期間:平成31年3月31日
 
 http://www.jst.go.jp/erato/research_area/ongoing/sly_PJ.html
 
 
■研究内容:
 
細胞・分子イメージング計測等のリアルタイムデータと統計科学の手法を組み合
 
わせ、生体システムの時空間動態を適応的に予測制御する。この問題を解く基盤
 
技術が、ベイズ統計学とデータ同化である。データ同化は、気象予報などの地球
 
科学の分野で生まれたデータと数理モデルの統合解析手法であり、さまざまなタ
 
イプの逆問題の解法を与える。例えば、モデルに含まれる物理パラメータや初期
 
場の推定、部分観測データからシステム全体の内部状態を推定する目的に用いら
 
れる。データ同化の理論基盤を担うのがベイズ統計学であり、現在は統計科学の
 
研究対象となり技術革新が展開されている。本グループは、ベイズ統計学とデー
 
タ同化を方法論の基軸として、細胞・分子イメージング技術、オミックスデータ
 
解析、モデリング、シミュレーション、アルゴリズム、並列計算等の方法論を構
 
築し、生体システムのライブ予測制御の概念実証を示す。さらにデータサイエン
 
ス独自の視点からバイオサイエンスの問題に対するユニークな切り口を発見し、
 
新しい戦略応用分野を開拓する。
 
 
■勤務地:
 
 京都府相楽郡精華町光台 2 丁目2-2(けいはんな学研都市)
 
 (株) 国際電気通信基礎技術研究所  http://www.atr.jp/index.html
 
 
■職種:
 
 研究員(ポスドク相当)
 
 
■勤務/雇用形態:
 
 常勤(任期あり)(単年度契約)
 
 任期:採用日から平成 27 年 3 月 31 日
 
 但し雇用期間は最長で、平成 31 年 3 月 31 日までとする。
 
 
■募集人員:
 
 1 名
 
 
■選考方法:
 
 書類審査と面接による
 
 
■採否の決定:
 
 メール等により個別に連絡
 
 
■応募書類:
 
 1.履歴書(書式自由)
 
 2.研究業績リスト(書式自由)
 
 3.これまでの研究概要(A4二枚以内)
 
 4.候補者の研究能力・実績と人格に関して評価できる2名の連絡先
 
 ※提出書類は返却いたしませんので、ご了承下さい。
 
 
■書類送付先: 〒190-8562 東京都立川市緑町10-3
 
 情報・システム研究機構 統計数理研究所
 
 (JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト・グループリーダー)
 
 吉田 亮<br>
 
 TEL: 050-5533-8534
 
 研究室HP: http://daweb.ism.ac.jp/yoshidalab/
 
 E-mail: yoshidar@ism.ac.jp
 
 ※E-mail (PDF, Wordファイル) による応募も受け付けます
 
 
==== JST・CREST 研究員募集====
 
生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員を募集致します。
 
 
業務内容: JST CESTプロジェクト「細胞間接着・骨格の秩序形成メカニズムの解明と上皮バリア操作技術の開発」の趣旨にそって、実験との共同研究のもと、上皮細胞系の細胞構造の形成過程、およびin vitro構成系実験の数理モデリングと解析を行う。研究内容の詳細に関しては、本研究課題に関する内容で、応募者の専門分野等を考慮して議論の上で決定致します。詳細は石原(shuji@complex.c.u-tokyo.ac.jp)までお問い合わせください。物理学,統計科学,数理生物学などの関連分野の専門性をもつ方で、生命科学分野において理論と実験との共同研究をとおした新規分野の開拓に興味があるかたのご応募をお待ちします。なお、本プロジェクトは研究代表者である月田早智子研究室(大阪大学•in vivo実験)、分担研究者である大岩和弘研究室(NICT•構成系実験)、米村重信研究室(理研CDB•培養系)との共同研究です。
 
 
応募資格:着任時期までに博士号を取得していること。
 
 
着任時期は2014年1月以降のできるだけ早い時期。待遇は東京大学特任研究員の規定に準じます。任期は年度毎更新で、評価によりプロジェクト終了(2018年3月末予定)まで再更新可能。適任者が決まり次第締め切ります。
 
 
件名に「PD募集」と明記し、以下の書類を添付して石原(shuji@complex.c.u-tokyo.ac.jp)までメールをしてください。
 
①履歴書
 
②主要な業績のリスト
 
③主要論文3本以内のPDF
 
④応募理由書 研究経歴や当研究課題で貢献できること (A4 2枚程度) 
 
⑤応募者について照会可能な研究者の方のemailアドレス
 
  
書類審査結果をメールでお知らせ致します。書類審査通過者に対しては、面接を実施致します。
+
==== <span style="color: red">New!! </span> 京大「大規模脳神経3次元回路抽出から計算論的神経科学へ」研究員募集 ====
 +
京都大学 大学院情報学研究科 論理生命学分野では博士研究員を募集しております。
  
==== 京大情・論理生命学研・研究員募集====
+
(1)CREST「光の特性を活用した生命機能の時空間制御技術の開発と応用」
京都大学 大学院情報学研究科 論理生命学分野では博士研究員を募集しております。システム同定/システム制御, 物理学, 統計科学, 脳科学, 計算論的神経科学, 数理モデリング, 顕 微鏡画像処理, システム生物学,バイオインフォマティクス以上いずれかについての専門性を持つかたで, 新しい分野へのチャレンジに興味をお持ちのかたのご応募をお待ちいたし ております.
+
大規模脳画像から3次元神経回路の抽出を行い、神経回路シミュレーションにより記憶にかかわる神経回路メカニズムを解明することを目的としたプロジェクトにご参加いただける方を募集いたします。当プロジェクトでは、第一に東京大学医学部河西研究室と共同で神経画像を取得し、3次元画像処理により神経回路の抽出を試みます。したがって、[1]三次元画像処理、[2]神経回路シミュレーション、[3]神経生理/分子生物学のうち、[1]を専門とされる方で[2]や[3]に挑戦したい方、あるいは[2]や[3]を専門とされる方で[1]に一定のスキルを有される方を希望いたします。非常に野心的、かつ最先端の研究に挑まれる気概のある方の募集をお待ちしております!
  
また, 皆様の身の回りに適任者おられましたらぜひ声をおかけください!
+
(2)「人工知能・脳神経系シミュレーション」
 +
人工知能・脳神経系シミュレーション・ハイパフォーマンスコンピューティング、あるいは関連分野に専門性を持つかたのご応募をお待ちいたしております。スーパーコンピューターを用いたハイパフォーマンス・コンピューティングによる脳神経系大規模画像データの処理、あるいは人の脳の柔軟な機能を模倣する脳型人工知能の計算機実装を対象とし、創造力と協調性を持って研究を進めていただける方を希望いたします。
  
詳細はこちら:http://hawaii.sys.i.kyoto-u.ac.jp/home/news/78147a7654e152df96c6no
+
皆様の身の回りに適任者がおられましたらぜひ声をおかけください!
  
研究分野:
+
●プロジェクト:
1.生化学反応システムのモデリングと制御
+
(1)平成28年度~33年度 戦略的創造研究推進事業(CREST)
2.脳機能コネクトミクスおよび、情動系神経回路のシミュレーション研究
+
研究領域:「光の特性を活用した生命機能の時空間制御技術の開発と応用」
 +
河西春郎 代表「記憶構造を解明する新しい光操作・画像法の開発」
 +
http://www.jst.go.jp/kisoken/crest/news/2016/160916/160916.html
  
プロジェクト1:
+
(2)文部科学省「ポスト「京」で重点的に取り組むべき社会的・科学的課題に関するアプリケーション開発・研究開発」萌芽的課題
 JST-CREST 研究領域「生命動態の理解と制御のための基礎技術の創出」
+
「脳のビッグデータ解析、全脳シミュレーションと脳型人工知能アーキテクチャ」
 研究課題名「時間情報コードによる細胞制御システムの解明」
+
(沖縄科学技術大学院大学、京都大学、理化学研究所、電気通信大学、東京大学の共同プロジェクト)
 平成24年10月1日から平成30年3月31日まで
 
  
プロジェクト2:
+
平成28年10月1日から平成30年3月31日まで(調査研究・準備研究フェイズ)
 文部科学省-JSTプロジェクト「脳科学研究戦略推進プログラム」
+
プロジェクトの審査により、さらに、
 研究課題名「情動の制御機構を解明するための神経情報基盤の構築(課題G)」
+
平成30年4月1日から平成32年3月31日まで(本格実施フェイズ)
 平成24年度1月20日から平成28年3月31日まで
 
  
給与:
+
●給与:
 京都大学特定研究員の規定によります。
+
京都大学特定研究員の規定によります。
 
(年俸制。年俸は経験、職務などを考慮決定)
 
(年俸制。年俸は経験、職務などを考慮決定)
 詳細は担当までお問い合わせ下さい。
+
詳細は担当までお問い合わせ下さい。
  
勤務形態:
+
●勤務形態:
 常勤(任期あり)
+
常勤(任期あり)
 裁量労働制で週38時間45分相当
+
裁量労働制で週38時間45分相当
 任期1年、更新可(最長上記各プロジェクト完了まで)
+
任期1年、更新可(最長上記プロジェクト完了まで)
  
人数:若干名
+
●人数:若干名
  
着任時期;
+
●着任時期;
 平成25年10月1日以降の早い時期。現在博士後期課程に在籍中の方で、平成25年度10月あるいは平成26年3月に修了見込みの方はその旨をご明記下さい。
+
プロジェクト1:平成29年4月1日
 +
プロジェクト2:平成28年11月1日以降のなるべく早い時期
 +
ただし、着任時期については相談にのりますのでお申し出ください。
  
ご応募方法:
+
●ご応募方法:
 
・履歴書(写真貼り付け、電子メールアドレスを明記)
 
・履歴書(写真貼り付け、電子メールアドレスを明記)
 
・研究業績リスト
 
・研究業績リスト
 
・主要論文のコピー(最大3件程度まで、各一部)
 
・主要論文のコピー(最大3件程度まで、各一部)
・これまでの研究の要約およびこれからの研究に関する展望
+
・これまでの研究の要約(A4用紙1枚~2枚程度)
(A4用紙1枚~2枚程度、プロジェクト1, 2の希望を明記してください)
+
プロジェクト1:プロジェクトに関係するスキル・実績に関する自己アピールを含めてください。
 +
プロジェクト2:プログラミングやソフトウェア開発のスキル・実績に関する自己アピールを含めてください。
 +
 
 
・応募者についての意見を伺える方1~2名のご氏名と連絡先
 
・応募者についての意見を伺える方1~2名のご氏名と連絡先
 
以上を電子ファイルの形で添付したE-mailを
 
以上を電子ファイルの形で添付したE-mailを
seimei2013 [at] sys.i.kyoto-u.ac.jpまでお送りください。
+
kanae [at] sys.i.kyoto-u.ac.jpまでお送りください。
  
もしくは、紙ベースでの送付を望まれる方は担当の
+
もしくは、郵送にてのご応募を希望される方は
 石井信 611-0011 京都府宇治市五ヶ庄
+
石井 信 〒606-8501京都市左京区吉田本町36-1工学部1号館421号室
まで博士研究員応募書類在中と明記した封筒を
+
まで博士研究員応募書類在中と明記した封筒をお送りください。
お送りいただければ受理できます.
 
  
その他お問い合わせは
+
●お問い合わせ:
seimei2013 [at] sys.i.kyoto-u.ac.jp
+
kanae [at] sys.i.kyoto-u.ac.jp
までお送りください。
+
までお気軽にお問合せください。
  
募集期間と選考方法:
+
●募集期間と選考方法:
募集期間は平成25年9月1日までとします。
+
募集期間は ** 平成28年12月18日 ** とします。
書類選考のうえ、面接により選考を行います。詳細は別途連絡します。
+
書類選考のうえ、面接により選考を行います。詳細は別途連絡したします。
適任者が決まり次第、募集を終了します。
+
適任者が決まり次第、募集を終了いたします。
  
 +
==============
  
当研究室には、2013年7月現在、
+
当研究室には、平成28年4月現在、
石井信(数理工学)
+
石井 信(数理工学)
 
大羽成征(バイオインフォマティクス、統計科学)
 
大羽成征(バイオインフォマティクス、統計科学)
 
前田新一(情報理論、機械学習)、
 
前田新一(情報理論、機械学習)、
浦久保秀俊 (計算神経科学、システム生物学)
+
浦久保秀俊 (計算神経科学)
 
 
 
近藤洋平(数理生物学)
 
近藤洋平(数理生物学)
中江 健(統計科学、計算神経科学)
+
ヘンリク・スキッべ(画像情報学)
山尾将隆 (システム生物学)
+
中江 健(統計科学、計算神経科学)
の各研究者が在籍し、数理工学から脳神経科学、システム生物学、ブレインマシンインターフェースなどへの融合領域への研究展開を、ATR脳情報研究所、理化学研究所、沖縄科学技術大学院大学、New York Universityなどの研究 機関との連携の下で、実施しております。
+
村上 陽平(システム生物学)
 
+
川瀬貴士(生物画像処理)
 +
メシギ・クーロシ(画像工学、人工知能)
 +
トーステン・ブルマン(計算神経科学)
 +
の各研究者が在籍し、数理工学から脳神経科学、システム生物学、ブレインマシンインターフェースなどへの融合領域への研究展開を、沖縄科学技術大学院 (OIST)、ATR認知機構研究所、理化学研究所脳科 学総合研究センターなどの研究機関との連携の下で実施しております。
  
 
研究室のホームページ
 
研究室のホームページ
Line 343: Line 156:
 
http://www.sys.i.kyoto-u.ac.jp/index.html
 
http://www.sys.i.kyoto-u.ac.jp/index.html
  
====独立行政法人理化学研究所、統合生命医科学研究センター統合ゲノミクスグループ 研究員または特別研究員の公募====
 
募集職種
 
研究員または特別研究員 1名
 
  
職務内容:
+
==== <span style="color: red">New!! </span> 国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募 ====
 分子生物学的手法、シークエンス技術、光学顕微鏡、マイクロチップ技術など
+
募集職種:研究員または特別研究員 1名
を基にして、単一細胞や少数細胞を対象にした新しい計測方法の開発を行いま
 
す。また、開発した方法を用いて、医科学的に重要な試料を測定し、新しい切り
 
口でサイエンスや医科学に貢献することを目指します。
 
  
勤務地:
+
職務内容:細胞生物学的手法、分子生物学的手法、免疫学的手法、シークエンス技術、光学顕微鏡、マイクロチップ技術、Bioinformaticsなどを基にして、単一細胞や少数
独立行政法人理化学研究所 統合生命医科学研究センター
+
細胞、組織を対象にした(各種免疫系細胞、腸内細菌など)新しい定量計測法の
(神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22)
+
開発を行います。また、開発した方法を用いて、医科学的に重要な試料を測定
 +
し、新しい切り口でサイエンスや医科学に貢献することを目指します。
  
着任時期:
+
勤務地:独立行政法人理化学研究所 統合生命医科学研究センター 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
平成25年7月1日以降、できるだけ早い時期(応相談)
+
 
 +
着任時期:応相談
  
 
研究内容についての問合せ先:
 
研究内容についての問合せ先:
独立行政法人理化学研究所統合生命医科学研究センター
+
国立研究開発法人理化学研究所統合生命医科学研究センター
統合ゲノミクス研究グループ  城口克之
+
オミクス研究ラボ  城口克之
 
E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ
 
E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ
 
さい。
 
さい。
  
 
公募の詳細:
 
公募の詳細:
http://www.riken.go.jp/careers/researchers/20130627/
+
http://www.riken.jp/careers/researchers/20150909/
 +
 
 +
==== <span style="color: red">New!! </span>Seeking Research Scientist or Postdoctoral Researcher, Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences====
 +
 
 +
Available Positions: Research Scientist or Postdoctoral Researcher, one person, full-time.
 +
 
 +
Job Descriptions: A successful candidate will develop new method(s) to measure parameters quantitatively from single cells, a few cells, or cells from tissues (immunological cells, microbiome, etc) based on techniques of cell
 +
biology, molecular biology, immunology, sequencing, optical microscope,
 +
microchip, and/or bioinfomatics. Using the developed method(s), she/he
 +
will measure cells which are medically significant, and intend to contribute to science and medical science from a novel point of view.
 +
 
 +
Work location: RIKEN Center for Integrative Medical Sciences. 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama-shi, Kanagawa 230-0045 Japan
 +
 
 +
Start of Employment: Negotiable
 +
 
 +
Inquiries for research contents
 +
Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical
 +
Sciences
 +
Katsuyuki Shiroguchi
 +
Email: katsuyuki.shiroguchi[at]riken.jp
 +
 
 +
Details:http://www.riken.jp/en/careers/researchers/20150909/
  
 
====これまでに掲載したお知らせ====
 
====これまでに掲載したお知らせ====
 +
*明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募
 +
*ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)
 +
*JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト研究員募集
 +
*JST CRESTプロジェクト「細胞間接着・骨格の秩序形成メカニズムの解明と上皮バリア操作技術の開発」研究員募集
 +
*京大情・論理生命学研・研究員募集
 +
*独立行政法人理化学研究所、統合生命医科学研究センター統合ゲノミクスグループ 研究員または特別研究員の公募
 
*自然科学研究機構新分野創成センター特任研究員の公募  
 
*自然科学研究機構新分野創成センター特任研究員の公募  
 
*沖縄科学技術大学院大学学園(OIST)バイオインフォマティシャンの求人の募集  
 
*沖縄科学技術大学院大学学園(OIST)バイオインフォマティシャンの求人の募集  

Revision as of 08:35, 10 November 2017

News

定量生物学に関わる研究者間の情報交換を促進するために、新しく News page を設けました。

情報掲載に関する問い合わせ先

当ページへの情報の掲載を希望される方は、ご所属、連絡先、掲載内容及びいつまでに情報を掲載してほしいかを明記の上、下記メールアドレスまでご連絡頂きますようよろしくお願い致します。世話人が掲載手続きを進めさせて頂きます。尚、定量生物学の会のメンバーでなくても情報の掲載を受け付けますので、ぜひ積極的にご活用下さい。

連絡先:q.biology at gmail.com (迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください)

研究費などのお知らせ

これまでに掲載したお知らせ

  • JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度研究提案の募集(第1期)について
  • JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度CREST・さきがけ研究提案募集(第1期)の予告及び説明会の開催について
  • CREST「生命動態」領域 H26年度領域説明会の御案内
  • 「統合データベース講習会」受入れ機関募集のお知らせ
  • ライフサイエンスデータベース統合推進事業「統合データ解析トライアル」平成25年度研究開発提案募集
  • 戦略的創造研究推進事業 (CREST、さきがけ)  平成25年度研究提案の募集開始
  • 独立行政法人科学技術振興機構(JST) 平成25年度CREST・さきがけ研究提案募集説明会のご案内

研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ

New!! CDBシンポジウム2018参加者募集中!

テーマ: Dynamic Homeostasis: From Development to Aging 日時: 2018年3月26日(月)~28日(水) 場所: 理化学研究所 多細胞システム形成研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド) 言語: 英語 参加費: 無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途) 昼食代: 3,000円(3日間) 懇親会費: 一般5,000円/学生1,000円 参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み 締め切り: 2017年12月15日(金) URL:http://www.cdb.riken.jp/sympo2018/

内容・概要: 組織恒常性は、その言葉の持つイメージとは裏腹に動的に制御されています。細胞や組織は、その維持・成熟・再生の過程で高度に適応しながら様々な環境変化に応答し、損傷の際にはその内外に存在する制御システムを動員して修復に当たります。このような組織のロバストネスや可塑性の制御には、幹細胞機構、組織内・組織間のシステミック調節、エピジェネティクス制御といった様々なシステムが関与しています 。動的恒常性機能の欠陥は発生異常に直結する一方、老化現象はそのゆるやかな機能低下と捉えることもできます。本シンポジウムでは、動的恒常性に関して細胞レベルから個体レベルまで幅広いトピックスを網羅し、将来展望しつつ新たな切り口を模索することを目指します。

トピックスとしては、以下のものを予定しています。 (1) Maintenance of tissue integrity, (2) Homeostatic disorder, (3) Systemic control and metabolism, (4) Aging, (5) Chromosomal and epigenetic control, (6) Cell lineage and single cell analysis

本シンポジウムでは、世界的な研究者たちと次世代の研究を切り開く若手研究者や学生が一堂に会して議論を深めることにより、新たな知見を生み出し人的交流が促進されることを期待しております。

本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、一部の演題には口頭発表をお願いする予定です。また、海外からの参加者(大学院生、研究員)を対象としたTravel Fellowshipを用意し、国内外からの多数の参加申込をお待ちいたしております。

連絡先: CDBシンポジウム2018事務局 国立研究開発法人 理化学研究所 多細胞システム形成研究センター 学術集会担当 〒650-0047 神戸市中央区港島南町2-2-3 TEL: 078-306-3009 / FAX: 078-306-3090 E-mail: sympo2018@cdb.riken.jp

これまでに掲載したお知らせ

  • 4th International Workshop on Quantitative Biology (IWQB2017) Registration Open
  • CDBシンポジウム2017参加者募集中!
  • 第28回CDBミーティング “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”開催のご案内
  • The 28th CDB Meeting “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions” Call for Application and Abstract Submission!
  • 第27回CDBミーティング Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces のお知らせ
  • The 27th CDB Meeting. Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces
  • CDBシンポジウム2016/CDB Symposium 2016 参加者募集中!
  • 第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内
  • CDBシンポジウム2015案内
  • 2015年度「統合データベース講習会」受入れ機関募集
  • バイオイメージデータ解析の公開講座のご案内
  • 数理生物学サマーレクチャーコース第2回~データ解析入門~」のお知らせ
  • 京都大学生命科学研究科特別講義のお知らせ
  • 光イメージング若手研究会「光塾」のお知らせ

求人情報のお知らせ

New!! 京大「大規模脳神経3次元回路抽出から計算論的神経科学へ」研究員募集

京都大学 大学院情報学研究科 論理生命学分野では博士研究員を募集しております。

(1)CREST「光の特性を活用した生命機能の時空間制御技術の開発と応用」 大規模脳画像から3次元神経回路の抽出を行い、神経回路シミュレーションにより記憶にかかわる神経回路メカニズムを解明することを目的としたプロジェクトにご参加いただける方を募集いたします。当プロジェクトでは、第一に東京大学医学部河西研究室と共同で神経画像を取得し、3次元画像処理により神経回路の抽出を試みます。したがって、[1]三次元画像処理、[2]神経回路シミュレーション、[3]神経生理/分子生物学のうち、[1]を専門とされる方で[2]や[3]に挑戦したい方、あるいは[2]や[3]を専門とされる方で[1]に一定のスキルを有される方を希望いたします。非常に野心的、かつ最先端の研究に挑まれる気概のある方の募集をお待ちしております!

(2)「人工知能・脳神経系シミュレーション」 人工知能・脳神経系シミュレーション・ハイパフォーマンスコンピューティング、あるいは関連分野に専門性を持つかたのご応募をお待ちいたしております。スーパーコンピューターを用いたハイパフォーマンス・コンピューティングによる脳神経系大規模画像データの処理、あるいは人の脳の柔軟な機能を模倣する脳型人工知能の計算機実装を対象とし、創造力と協調性を持って研究を進めていただける方を希望いたします。

皆様の身の回りに適任者がおられましたらぜひ声をおかけください!

●プロジェクト: (1)平成28年度~33年度 戦略的創造研究推進事業(CREST) 研究領域:「光の特性を活用した生命機能の時空間制御技術の開発と応用」 河西春郎 代表「記憶構造を解明する新しい光操作・画像法の開発」 http://www.jst.go.jp/kisoken/crest/news/2016/160916/160916.html

(2)文部科学省「ポスト「京」で重点的に取り組むべき社会的・科学的課題に関するアプリケーション開発・研究開発」萌芽的課題 「脳のビッグデータ解析、全脳シミュレーションと脳型人工知能アーキテクチャ」 (沖縄科学技術大学院大学、京都大学、理化学研究所、電気通信大学、東京大学の共同プロジェクト)

平成28年10月1日から平成30年3月31日まで(調査研究・準備研究フェイズ) プロジェクトの審査により、さらに、 平成30年4月1日から平成32年3月31日まで(本格実施フェイズ)

●給与: 京都大学特定研究員の規定によります。 (年俸制。年俸は経験、職務などを考慮決定) 詳細は担当までお問い合わせ下さい。

●勤務形態: 常勤(任期あり) 裁量労働制で週38時間45分相当 任期1年、更新可(最長上記プロジェクト完了まで)

●人数:若干名

●着任時期; プロジェクト1:平成29年4月1日 プロジェクト2:平成28年11月1日以降のなるべく早い時期 ただし、着任時期については相談にのりますのでお申し出ください。

●ご応募方法: ・履歴書(写真貼り付け、電子メールアドレスを明記) ・研究業績リスト ・主要論文のコピー(最大3件程度まで、各一部) ・これまでの研究の要約(A4用紙1枚~2枚程度) プロジェクト1:プロジェクトに関係するスキル・実績に関する自己アピールを含めてください。 プロジェクト2:プログラミングやソフトウェア開発のスキル・実績に関する自己アピールを含めてください。

・応募者についての意見を伺える方1~2名のご氏名と連絡先 以上を電子ファイルの形で添付したE-mailを kanae [at] sys.i.kyoto-u.ac.jpまでお送りください。

もしくは、郵送にてのご応募を希望される方は 石井 信 〒606-8501京都市左京区吉田本町36-1工学部1号館421号室 まで博士研究員応募書類在中と明記した封筒をお送りください。

●お問い合わせ: kanae [at] sys.i.kyoto-u.ac.jp までお気軽にお問合せください。

●募集期間と選考方法: 募集期間は ** 平成28年12月18日 ** とします。 書類選考のうえ、面接により選考を行います。詳細は別途連絡したします。 適任者が決まり次第、募集を終了いたします。

==============

当研究室には、平成28年4月現在、 石井 信(数理工学) 大羽成征(バイオインフォマティクス、統計科学) 前田新一(情報理論、機械学習)、 浦久保秀俊 (計算神経科学) 近藤洋平(数理生物学) ヘンリク・スキッべ(画像情報学) 中江 健(統計科学、計算神経科学) 村上 陽平(システム生物学) 川瀬貴士(生物画像処理) メシギ・クーロシ(画像工学、人工知能) トーステン・ブルマン(計算神経科学) の各研究者が在籍し、数理工学から脳神経科学、システム生物学、ブレインマシンインターフェースなどへの融合領域への研究展開を、沖縄科学技術大学院 (OIST)、ATR認知機構研究所、理化学研究所脳科 学総合研究センターなどの研究機関との連携の下で実施しております。

研究室のホームページ http://ishiilab.jp 京都大学情報学研究科システム科学専攻のホームページ http://www.sys.i.kyoto-u.ac.jp/index.html


New!! 国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募

募集職種:研究員または特別研究員 1名

職務内容:細胞生物学的手法、分子生物学的手法、免疫学的手法、シークエンス技術、光学顕微鏡、マイクロチップ技術、Bioinformaticsなどを基にして、単一細胞や少数 細胞、組織を対象にした(各種免疫系細胞、腸内細菌など)新しい定量計測法の 開発を行います。また、開発した方法を用いて、医科学的に重要な試料を測定 し、新しい切り口でサイエンスや医科学に貢献することを目指します。

勤務地:独立行政法人理化学研究所 統合生命医科学研究センター 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22

着任時期:応相談

研究内容についての問合せ先: 国立研究開発法人理化学研究所統合生命医科学研究センター オミクス研究ラボ  城口克之 E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ さい。

公募の詳細: http://www.riken.jp/careers/researchers/20150909/

New!! Seeking Research Scientist or Postdoctoral Researcher, Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences

Available Positions: Research Scientist or Postdoctoral Researcher, one person, full-time.

Job Descriptions: A successful candidate will develop new method(s) to measure parameters quantitatively from single cells, a few cells, or cells from tissues (immunological cells, microbiome, etc) based on techniques of cell biology, molecular biology, immunology, sequencing, optical microscope, microchip, and/or bioinfomatics. Using the developed method(s), she/he will measure cells which are medically significant, and intend to contribute to science and medical science from a novel point of view.

Work location: RIKEN Center for Integrative Medical Sciences. 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama-shi, Kanagawa 230-0045 Japan

Start of Employment: Negotiable

Inquiries for research contents Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences Katsuyuki Shiroguchi Email: katsuyuki.shiroguchi[at]riken.jp

Details:http://www.riken.jp/en/careers/researchers/20150909/

これまでに掲載したお知らせ

  • 明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募
  • ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)
  • JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト研究員募集
  • JST CRESTプロジェクト「細胞間接着・骨格の秩序形成メカニズムの解明と上皮バリア操作技術の開発」研究員募集
  • 京大情・論理生命学研・研究員募集
  • 独立行政法人理化学研究所、統合生命医科学研究センター統合ゲノミクスグループ 研究員または特別研究員の公募
  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任研究員の公募
  • 沖縄科学技術大学院大学学園(OIST)バイオインフォマティシャンの求人の募集
  • 「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域の「時間情報コードによる細胞制御システムの解明」(代表者:黒田真也(東京大学))研究員の募集
  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任助教等の公募
  • 東京大学黒田研 特任助教募集募集
  • Biology/Genetics/Evolution Postdoctoral Fellow Position, Fred Hutchinson Cancer Research Center (091006)