年会2009チュートリアル2 - Revision history

Crmind: /* 導入：画像解析技術紹介 */

2008-12-24T09:57:02Z

導入：画像解析技術紹介

← Older revision		Revision as of 09:57, 24 December 2008
Line 18:		Line 18:

	== 発表内容 ==		== 発表内容 ==
	===導入： ~~画像解析技術紹介~~===		===導入：高度な画像解析で何ができるのか？===
	*講演者：小林徹也		*講演者：小林徹也
	*所属：東京大学生産技術研究所		*所属：東京大学生産技術研究所
	* アブストラクト here		:画像解析は定量的な生命科学研究を遂行するためのコアとなるドライ技術です。具体的には画像解析によって、（１）現象の客観化、（２）無数のデータの自動取得、（３）視覚でとらえにくい特性の発見、の３つが少なくとも可能になると考えられます。本発表ではこの３つを概説するとともに、３人のメイン講演者の紹介をかねて、その関係性を話したいと思います。

	===顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例===		===顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例===

Crmind: /* 導入：画像解析技術紹介 */

2008-12-17T06:46:40Z

導入：画像解析技術紹介

← Older revision		Revision as of 06:46, 17 December 2008
Line 20:		Line 20:
	===導入：画像解析技術紹介===		===導入：画像解析技術紹介===
	*講演者：小林徹也		*講演者：小林徹也
			*所属：東京大学生産技術研究所
	* アブストラクト here		* アブストラクト here

Crmind: /* 顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例 */

2008-12-16T11:03:27Z

顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例

← Older revision		Revision as of 11:03, 16 December 2008
Line 26:		Line 26:
	*所属：1: 東大・院新領域,2: JST BIRD		*所属：1: 東大・院新領域,2: JST BIRD
	:バイオイメージングは多様な生命現象を網羅する研究手法である．近年，生体分子や細胞内構造の可視化法，撮像系の進歩，画像データベースの構築などが進展する一方，得られた画像に対しては定性的で主観的な評価を行なうに留まっている場合が多い．私たちは植物細胞の研究において，画像の持つ情報を活かした定量的で客観的な解析を実現するため，画像処理手法の導入に取り組んできた．本発表では，植物細胞の形態制御のモデル系として気孔の開閉を例にとり，連続共焦点像からの立体再構築を介したオルガネラと細胞骨格系の形状解析，細胞骨格系の配向パターンの定量，画像クラスタリングによる細胞内構造の状態分類について紹介する．		:バイオイメージングは多様な生命現象を網羅する研究手法である．近年，生体分子や細胞内構造の可視化法，撮像系の進歩，画像データベースの構築などが進展する一方，得られた画像に対しては定性的で主観的な評価を行なうに留まっている場合が多い．私たちは植物細胞の研究において，画像の持つ情報を活かした定量的で客観的な解析を実現するため，画像処理手法の導入に取り組んできた．本発表では，植物細胞の形態制御のモデル系として気孔の開閉を例にとり，連続共焦点像からの立体再構築を介したオルガネラと細胞骨格系の形状解析，細胞骨格系の配向パターンの定量，画像クラスタリングによる細胞内構造の状態分類について紹介する．

			=== ショウジョウバエ器官形成の in vivo imaging ===
			* 講演者: 加藤輝，林茂生
			* 所属：RIKEN CDB
			:動物の胚発生において，多数の細胞の秩序立った運動の結果として精緻な器官が構築される．ショウジョウバエ気管は，管状上皮が体中を網羅する立体的なネットワークであり，その基本的な構造は，胚発生期における気管前駆細胞の運動と，細胞接着を介した新たな管腔の開通によって構築される．我々は，これらの細胞の挙動及びその動的な変化を司る基盤を解明するため，気管細胞における細胞骨格系及び接着分子の動態とそれらが気管構築に与える影響について解析を行っている．本発表では，ショウジョウバエ生体胚内部の空間を移動する気管細胞及びその周囲の組織由来の細胞との関係について観察を行う，個体イメージング系の開発及びその結果について紹介する．

	=== 時系列画像からの形態変化の定量・・・問題と解決方法===		=== 時系列画像からの形態変化の定量・・・問題と解決方法===
	*講演者：塚田　祐基		*講演者：塚田　祐基
	:アブストラクト：細胞の形態変化と、それを制御する分子シグナルの関係は非常に動的である。この関係を調べるためには、形態変化と分子シグナルを定量しなければならないが、形の変化や空間的な分子シグナルを一般的に定量し、関連付けることは難しい。これに対し、時系列画像から細胞形態の変化とその系譜を定量する画像処理技術(Edge Evolution Tracking: EET)を開発した。本発表では、EETの扱う問題と、アルゴリズムの概要、実際のデータに対して行った解析結果を紹介する。解析したデータは、分子活性を可視化する蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)により得られた、Rho GTPases活性分布の時系列画像であり、生データを見ただけでは明確にできなかったRho GTPases活性シグナルと形態変化の動的な関係を定量解析により明らかにする。		:アブストラクト：細胞の形態変化と、それを制御する分子シグナルの関係は非常に動的である。この関係を調べるためには、形態変化と分子シグナルを定量しなければならないが、形の変化や空間的な分子シグナルを一般的に定量し、関連付けることは難しい。これに対し、時系列画像から細胞形態の変化とその系譜を定量する画像処理技術(Edge Evolution Tracking: EET)を開発した。本発表では、EETの扱う問題と、アルゴリズムの概要、実際のデータに対して行った解析結果を紹介する。解析したデータは、分子活性を可視化する蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)により得られた、Rho GTPases活性分布の時系列画像であり、生データを見ただけでは明確にできなかったRho GTPases活性シグナルと形態変化の動的な関係を定量解析により明らかにする。

Crmind: /* 発表内容 */

2008-11-20T10:17:30Z

発表内容

← Older revision		Revision as of 10:17, 20 November 2008
Line 21:		Line 21:
	*講演者：小林徹也		*講演者：小林徹也
	* アブストラクト here		* アブストラクト here

	~~=== 時系列画像からの形態変化の定量・・・問題と解決方法===~~
	*講演者：塚田　祐基
	:アブストラクト：細胞の形態変化と、それを制御する分子シグナルの関係は非常に動的である。この関係を調べるためには、形態変化と分子シグナルを定量しなければならないが、形の変化や空間的な分子シグナルを一般的に定量し、関連付けることは難しい。これに対し、時系列画像から細胞形態の変化とその系譜を定量する画像処理技術(Edge Evolution Tracking: EET)を開発した。本発表では、EETの扱う問題と、アルゴリズムの概要、実際のデータに対して行った解析結果を紹介する。解析したデータは、分子活性を可視化する蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)により得られた、Rho GTPases活性分布の時系列画像であり、生データを見ただけでは明確にできなかったRho GTPases活性シグナルと形態変化の動的な関係を定量解析により明らかにする。

	===顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例===		===顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例===
Line 30:		Line 26:
	*所属：1: 東大・院新領域,2: JST BIRD		*所属：1: 東大・院新領域,2: JST BIRD
	:バイオイメージングは多様な生命現象を網羅する研究手法である．近年，生体分子や細胞内構造の可視化法，撮像系の進歩，画像データベースの構築などが進展する一方，得られた画像に対しては定性的で主観的な評価を行なうに留まっている場合が多い．私たちは植物細胞の研究において，画像の持つ情報を活かした定量的で客観的な解析を実現するため，画像処理手法の導入に取り組んできた．本発表では，植物細胞の形態制御のモデル系として気孔の開閉を例にとり，連続共焦点像からの立体再構築を介したオルガネラと細胞骨格系の形状解析，細胞骨格系の配向パターンの定量，画像クラスタリングによる細胞内構造の状態分類について紹介する．		:バイオイメージングは多様な生命現象を網羅する研究手法である．近年，生体分子や細胞内構造の可視化法，撮像系の進歩，画像データベースの構築などが進展する一方，得られた画像に対しては定性的で主観的な評価を行なうに留まっている場合が多い．私たちは植物細胞の研究において，画像の持つ情報を活かした定量的で客観的な解析を実現するため，画像処理手法の導入に取り組んできた．本発表では，植物細胞の形態制御のモデル系として気孔の開閉を例にとり，連続共焦点像からの立体再構築を介したオルガネラと細胞骨格系の形状解析，細胞骨格系の配向パターンの定量，画像クラスタリングによる細胞内構造の状態分類について紹介する．

			=== 時系列画像からの形態変化の定量・・・問題と解決方法===
			*講演者：塚田　祐基
			:アブストラクト：細胞の形態変化と、それを制御する分子シグナルの関係は非常に動的である。この関係を調べるためには、形態変化と分子シグナルを定量しなければならないが、形の変化や空間的な分子シグナルを一般的に定量し、関連付けることは難しい。これに対し、時系列画像から細胞形態の変化とその系譜を定量する画像処理技術(Edge Evolution Tracking: EET)を開発した。本発表では、EETの扱う問題と、アルゴリズムの概要、実際のデータに対して行った解析結果を紹介する。解析したデータは、分子活性を可視化する蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)により得られた、Rho GTPases活性分布の時系列画像であり、生データを見ただけでは明確にできなかったRho GTPases活性シグナルと形態変化の動的な関係を定量解析により明らかにする。

Crmind: /* 顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例 */

2008-11-20T10:16:50Z

顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例

← Older revision		Revision as of 10:16, 20 November 2008
Line 29:		Line 29:
	*講演者：朽名夏麿1,2)，桧垣匠1)，佐野俊夫1,2)，馳澤盛一郎1,2)		*講演者：朽名夏麿1,2)，桧垣匠1)，佐野俊夫1,2)，馳澤盛一郎1,2)
	*所属：1: 東大・院新領域,2: JST BIRD		*所属：1: 東大・院新領域,2: JST BIRD
	:バイオイメージングは多様な生命現象を網羅する研究手法である．近年，生体分子や細胞内構造の可視化法，撮像系の進歩，画像データベースの構築などが進展する一方，得られた画像に対しては定性的で主観的な評価を行なうに留まっている場合が多い．私たちは植物細胞の研究において，画像の持つ情報を活かした定量的で客観的な解析を実現するため，画像処理手法の導入に取り組んできた．本発表では，植物細胞の形態制御のモデル系として気孔の開閉を例にとり，連続共焦点像からの立体再構築を介したオルガ		:バイオイメージングは多様な生命現象を網羅する研究手法である．近年，生体分子や細胞内構造の可視化法，撮像系の進歩，画像データベースの構築などが進展する一方，得られた画像に対しては定性的で主観的な評価を行なうに留まっている場合が多い．私たちは植物細胞の研究において，画像の持つ情報を活かした定量的で客観的な解析を実現するため，画像処理手法の導入に取り組んできた．本発表では，植物細胞の形態制御のモデル系として気孔の開閉を例にとり，連続共焦点像からの立体再構築を介したオルガネラと細胞骨格系の形状解析，細胞骨格系の配向パターンの定量，画像クラスタリングによる細胞内構造の状態分類について紹介する．
	~~ネラと細胞骨格系の形状解析，細胞骨格系の配向パターンの定量，画像クラスタリングによる細胞内構造の状態分類について紹介する．~~

Crmind: /* 顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例 */

2008-11-20T10:16:41Z

顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例

← Older revision		Revision as of 10:16, 20 November 2008
Line 29:		Line 29:
	*講演者：朽名夏麿1,2)，桧垣匠1)，佐野俊夫1,2)，馳澤盛一郎1,2)		*講演者：朽名夏麿1,2)，桧垣匠1)，佐野俊夫1,2)，馳澤盛一郎1,2)
	*所属：1: 東大・院新領域,2: JST BIRD		*所属：1: 東大・院新領域,2: JST BIRD
	:バイオイメージングは多様な生命現象を網羅する研究手法である．近年，生体分子や細胞内構造の可視化法，撮像系の進歩，画像データベースの構築などが進展する一方，得られた画像に対しては定性的で主観的な評価を行なうに留まっている場合が多い．私たち		:バイオイメージングは多様な生命現象を網羅する研究手法である．近年，生体分子や細胞内構造の可視化法，撮像系の進歩，画像データベースの構築などが進展する一方，得られた画像に対しては定性的で主観的な評価を行なうに留まっている場合が多い．私たちは植物細胞の研究において，画像の持つ情報を活かした定量的で客観的な解析を実現するため，画像処理手法の導入に取り組んできた．本発表では，植物細胞の形態制御のモデル系として気孔の開閉を例にとり，連続共焦点像からの立体再構築を介したオルガ
	は植物細胞の研究において，画像の持つ情報を活かした定量的で客観的な解析を実現するため，画像処理手法の導入に取り組んできた．本発表では，植物細胞の形態制御のモデル系として気孔の開閉を例にとり，連続共焦点像からの立体再構築を介したオルガ
	ネラと細胞骨格系の形状解析，細胞骨格系の配向パターンの定量，画像クラスタリングによる細胞内構造の状態分類について紹介する．		ネラと細胞骨格系の形状解析，細胞骨格系の配向パターンの定量，画像クラスタリングによる細胞内構造の状態分類について紹介する．

Crmind: /* 顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例 */

2008-11-20T10:16:31Z

顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例

← Older revision		Revision as of 10:16, 20 November 2008
Line 29:		Line 29:
	*講演者：朽名夏麿1,2)，桧垣匠1)，佐野俊夫1,2)，馳澤盛一郎1,2)		*講演者：朽名夏麿1,2)，桧垣匠1)，佐野俊夫1,2)，馳澤盛一郎1,2)
	*所属：1: 東大・院新領域,2: JST BIRD		*所属：1: 東大・院新領域,2: JST BIRD
	* バイオイメージングは多様な生命現象を網羅する研究手法である．		:バイオイメージングは多様な生命現象を網羅する研究手法である．近年，生体分子や細胞内構造の可視化法，撮像系の進歩，画像データベースの構築などが進展する一方，得られた画像に対しては定性的で主観的な評価を行なうに留まっている場合が多い．私たち
	~~近年，生体分子や細胞内構造の可視化法，撮像系の進歩，画像デー~~		は植物細胞の研究において，画像の持つ情報を活かした定量的で客観的な解析を実現するため，画像処理手法の導入に取り組んできた．本発表では，植物細胞の形態制御のモデル系として気孔の開閉を例にとり，連続共焦点像からの立体再構築を介したオルガ
	~~タベースの構築などが進展する一方，得られた画像に対しては定~~		ネラと細胞骨格系の形状解析，細胞骨格系の配向パターンの定量，画像クラスタリングによる細胞内構造の状態分類について紹介する．
	~~性的で主観的な評価を行なうに留まっている場合が多い．私たち~~
	~~は植物細胞の研究において，画像の持つ情報を活かした定量的で~~
	~~客観的な解析を実現するため，画像処理手法の導入に取り組んで~~
	~~きた．本発表では，植物細胞の形態制御のモデル系として気孔の~~
	~~開閉を例にとり，連続共焦点像からの立体再構築を介したオルガ~~
	~~ネラと細胞骨格系の形状解析，細胞骨格系の配向パターンの定量，~~
	~~画像クラスタリングによる細胞内構造の状態分類について紹介す~~
	る．

Crmind: /* 時系列画像からの形態変化の定量・・・問題と解決方法 */

2008-11-20T10:16:02Z

時系列画像からの形態変化の定量・・・問題と解決方法

← Older revision		Revision as of 10:16, 20 November 2008
Line 24:		Line 24:
	=== 時系列画像からの形態変化の定量・・・問題と解決方法===		=== 時系列画像からの形態変化の定量・・・問題と解決方法===
	*講演者：塚田　祐基		*講演者：塚田　祐基
	* アブストラクト：細胞の形態変化と、それを制御する分子シグナルの関係は非常に動的である。この関係を調べるためには、形態変化と分子シグナルを定量しなければならないが、形の変化や空間的な分子シグナルを一般的に定量し、関連付けることは難しい。これに対し、時系列画像から細胞形態の変化とその系譜を定量する画像処理技術(Edge Evolution Tracking: EET)を開発した。本発表では、EETの扱う問題と、アルゴリズムの概要、実際のデータに対して行った解析結果を紹介する。解析したデータは、分子活性を可視化する蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)により得られた、Rho GTPases活性分布の時系列画像であり、生データを見ただけでは明確にできなかったRho GTPases活性シグナルと形態変化の動的な関係を定量解析により明らかにする。		:アブストラクト：細胞の形態変化と、それを制御する分子シグナルの関係は非常に動的である。この関係を調べるためには、形態変化と分子シグナルを定量しなければならないが、形の変化や空間的な分子シグナルを一般的に定量し、関連付けることは難しい。これに対し、時系列画像から細胞形態の変化とその系譜を定量する画像処理技術(Edge Evolution Tracking: EET)を開発した。本発表では、EETの扱う問題と、アルゴリズムの概要、実際のデータに対して行った解析結果を紹介する。解析したデータは、分子活性を可視化する蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)により得られた、Rho GTPases活性分布の時系列画像であり、生データを見ただけでは明確にできなかったRho GTPases活性シグナルと形態変化の動的な関係を定量解析により明らかにする。

	===顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例===		===顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例===

Crmind: /* 発表内容 */

2008-11-20T10:14:29Z

発表内容

← Older revision		Revision as of 10:14, 20 November 2008
Line 18:		Line 18:

	== 発表内容 ==		== 発表内容 ==
			===導入：画像解析技術紹介===
			*講演者：小林徹也
			* アブストラクト here

	=== 時系列画像からの形態変化の定量・・・問題と解決方法===		=== 時系列画像からの形態変化の定量・・・問題と解決方法===
	*講演者：塚田　祐基		*講演者：塚田　祐基
	* アブストラクト：細胞の形態変化と、それを制御する分子シグナルの関係は非常に動的である。この関係を調べるためには、形態変化と分子シグナルを定量しなければならないが、形の変化や空間的な分子シグナルを一般的に定量し、関連付けることは難しい。これに対し、時系列画像から細胞形態の変化とその系譜を定量する画像処理技術(Edge Evolution Tracking: EET)を開発した。本発表では、EETの扱う問題と、アルゴリズムの概要、実際のデータに対して行った解析結果を紹介する。解析したデータは、分子活性を可視化する蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)により得られた、Rho GTPases活性分布の時系列画像であり、生データを見ただけでは明確にできなかったRho GTPases活性シグナルと形態変化の動的な関係を定量解析により明らかにする。		* アブストラクト：細胞の形態変化と、それを制御する分子シグナルの関係は非常に動的である。この関係を調べるためには、形態変化と分子シグナルを定量しなければならないが、形の変化や空間的な分子シグナルを一般的に定量し、関連付けることは難しい。これに対し、時系列画像から細胞形態の変化とその系譜を定量する画像処理技術(Edge Evolution Tracking: EET)を開発した。本発表では、EETの扱う問題と、アルゴリズムの概要、実際のデータに対して行った解析結果を紹介する。解析したデータは、分子活性を可視化する蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)により得られた、Rho GTPases活性分布の時系列画像であり、生データを見ただけでは明確にできなかったRho GTPases活性シグナルと形態変化の動的な関係を定量解析により明らかにする。

	===~~導入：画像解析技術紹介~~===		===顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例===
	*~~講演者：小林徹也~~		*講演者：朽名夏麿1,2)，桧垣匠1)，佐野俊夫1,2)，馳澤盛一郎1,2)
	* ~~アブストラクト here~~		*所属：1: 東大・院新領域,2: JST BIRD
			* バイオイメージングは多様な生命現象を網羅する研究手法である．
			近年，生体分子や細胞内構造の可視化法，撮像系の進歩，画像デー
			タベースの構築などが進展する一方，得られた画像に対しては定
			性的で主観的な評価を行なうに留まっている場合が多い．私たち
			は植物細胞の研究において，画像の持つ情報を活かした定量的で
			客観的な解析を実現するため，画像処理手法の導入に取り組んで
			きた．本発表では，植物細胞の形態制御のモデル系として気孔の
			開閉を例にとり，連続共焦点像からの立体再構築を介したオルガ
			ネラと細胞骨格系の形状解析，細胞骨格系の配向パターンの定量，
			画像クラスタリングによる細胞内構造の状態分類について紹介す
			る．

Crmind: /* 画像解析技術紹介 */

2008-11-19T07:41:54Z

画像解析技術紹介

← Older revision		Revision as of 07:41, 19 November 2008
Line 22:		Line 22:
	* アブストラクト：細胞の形態変化と、それを制御する分子シグナルの関係は非常に動的である。この関係を調べるためには、形態変化と分子シグナルを定量しなければならないが、形の変化や空間的な分子シグナルを一般的に定量し、関連付けることは難しい。これに対し、時系列画像から細胞形態の変化とその系譜を定量する画像処理技術(Edge Evolution Tracking: EET)を開発した。本発表では、EETの扱う問題と、アルゴリズムの概要、実際のデータに対して行った解析結果を紹介する。解析したデータは、分子活性を可視化する蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)により得られた、Rho GTPases活性分布の時系列画像であり、生データを見ただけでは明確にできなかったRho GTPases活性シグナルと形態変化の動的な関係を定量解析により明らかにする。		* アブストラクト：細胞の形態変化と、それを制御する分子シグナルの関係は非常に動的である。この関係を調べるためには、形態変化と分子シグナルを定量しなければならないが、形の変化や空間的な分子シグナルを一般的に定量し、関連付けることは難しい。これに対し、時系列画像から細胞形態の変化とその系譜を定量する画像処理技術(Edge Evolution Tracking: EET)を開発した。本発表では、EETの扱う問題と、アルゴリズムの概要、実際のデータに対して行った解析結果を紹介する。解析したデータは、分子活性を可視化する蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)により得られた、Rho GTPases活性分布の時系列画像であり、生データを見ただけでは明確にできなかったRho GTPases活性シグナルと形態変化の動的な関係を定量解析により明らかにする。

	=== 画像解析技術紹介===		===導入：画像解析技術紹介===
	*講演者：小林徹也		*講演者：小林徹也
	* アブストラクト here		* アブストラクト here

年会2009チュートリアル2 - Revision history

Crmind: /* 導入： 画像解析技術紹介 */

Crmind: /* 導入： 画像解析技術紹介 */

Crmind: /* 顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例 */

Crmind: /* 発表内容 */

Crmind: /* 顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例 */

Crmind: /* 顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例 */

Crmind: /* 顕微鏡画像から探る植物細胞の構造: 気孔研究における事例 */

Crmind: /* 時系列画像からの形態変化の定量・・・問題と解決方法 */

Crmind: /* 発表内容 */

Crmind: /* 画像解析技術紹介 */

Crmind: /* 導入：画像解析技術紹介 */

Crmind: /* 導入：画像解析技術紹介 */