Japanese society for quantitative biology - User contributions [en]

IIS Sympo

2015-11-20T08:36:02Z

Akkimura: /* NIG International Symposium 2016 */

=='''NIG International Symposium 2016'''==
This event is sponsored by National Institute of Genetics ([http://www.nig.ac.jp/nig/ NIG]) and held as the NIG International Symposium 2016.

===''Tokyo Symposium at Institute of Industrial Science, the University of Tokyo''===

=='''Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems '''==

'''Exploring frontiers of quantitative biology by identifying X-factors that shape living systems'''

'''Quantitative biology is a growing discipline goes beyond the quantification of biological phenomena and attempts to unveil fundamental and general principles governing living systems.'''

'''After decades of emphasis on the study of GENES to reveal such principles, recent advances in quantitative biology have shed light on other key factors in biology, designated as X-FACTORS. X-factors include FORCE and SYMMETRY, which control the shape, size, and movement of cells and tissues, and INFORMATION, which characterizes processing and transduction of intra- and inter-cellular signaling. Enumerating such X-factors represents a milestone in quantitative biology.'''

'''In the Tokyo Symposium, we shall focus on X-factors in biology. This symposium was designed to share and discuss our vision for the frontiers of quantitative biology with cutting-edge researchers from around the world. We expect active discussions on state-of-the-art techniques to measure and manipulate X-factors and on the integration of different X-factors, leading towards a deeper understanding of the nature of living systems.'''

==Date: Jan 9th - 11th, 2016.==
Jan. 9th 13:00 to Jan. 11th 12:00

==Venue for workshops and the Symposium at Tokyo==
Convention hall, An Block, Institute of Industrial Science, 
Komaba Ⅱ Research Campus, the University of Tokyo.
 [http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access_e/access_e.html Access to Komaba Ⅱ Research Campus]
 [http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access_e/campusmap_e.html Campus map]

==Registration and Abstract submission (Oct/20/2015)==
'''Registration Deadline is approaching: Nov. 30th mon. 2015''' 
'''Registration from [https://docs.google.com/forms/d/1hNiBiiLu73N0Mo9FS5O03D0LTu7VHHP-BqJtOAzoNPY/viewform?usp=send_form here].''' 
 
'''Poster Abstract submission deadline: Dec. 10th thr. 2015''' 
'''For a poster presentation, please submit your abstract from [https://docs.google.com/forms/d/1x3dNWPk6GZDBLec_O3WFCaXsaqmis83wtzdt8f5AetM/viewform?usp=send_form here].'''
 
 
'''DON'T MISS!''' 
'''Please be sure that the above registration and abstract submission are both ONLY for Tokyo Symposium. '''
 For the registration and abstract submission to the other workshops and symposium, you may visit the other sites ([http://q-bio.jp/wiki/Events Events]).'''

'''Seating capacity: Approximately 150, excluding invited speakers ( approx. 20 people ).'''

==Speakers and Abstracts==
[[SpeakersandAbstracts|'''Link to a "Speakers and Abstracts" page.''']]

==Scientific Program==
=== Jan. 9th===
-----
=====Opening Remarks=====
Date and Time: Jan. 9th 13:00-13:10 
-----

====Session: Quantity - FORCE -====
Date and Time: Jan. 9th 13:10-15:25 
Chair: '''Kaoru Sugimura''' 
Speakers:
{|
|-
!
!　　
![http://me.ucsb.edu/people/otger-campas '''Otger Campàs'''] ( University of California, Santa Barbara, USA ) 
title: "Quantifying tissue mechanics in vivo and in situ"
|-
!
!
![http://www.koolau.info/ '''Kaoru Sugimura'''] ( Kyoto Univ., Japan ) 
title: "Quantifying epithelial tissue morphogenesis: from F-actin regulation to cell kinematics and tissue stress"
|-
!
!
![http://umr168.curie.fr/en/profile/emmanuel-farge-00906 '''Emmanuel Farge'''] ( Institut Curie, France )
title: "From mesoderm mechanotransductive evolutionary origins to tumourogenic mechanical induction"
|-
|}

====Poster Session I====
Date and Time: Jan. 9th 15:25-18:30 including 5-min instructions of poster presentations 

----
----

=== Jan. 10th===
-----
====Session: Quantity - SYMMETRY I -====
Date and Time: Jan. 10th 9:00-12:00 
Co-Chair: '''Noriko Hiroi and Yusuke Maeda''' 
Speakers:
{|
|-
!
!　　
![http://fun.bio.keio.ac.jp/people/ '''Noriko Hiroi'''] ( Keio University, Japan )
title: "Anisotropy shaped by and for the Dynamic Distribution of Heat"
|-
!
!
![http://www.imcb.a-star.edu.sg/php/np.php '''Nicolas D Plachta'''] ( IMCB, Singapore )
title: "Seeing how mammalian life starts: Quantitative imaging in live mouse embryos"
|-
!
!
![http://www.yusukeman.org/YM/youkoso.html '''Yusuke Maeda'''] ( Kyushu University, Japan )
title: tba
|-
!
!
![http://www.chimie.ens.fr/?q=en/umr-8640/biophysical-chemistry/profil/zoher.gueroui '''Zoher Gueroui'''] ( École Normale Supérieure, France )
title:tba
|-
|}

====Poster Session II====
Date and Time: Jan. 10th 12:00-13:30 
 
----

====Session: Quantity - SYMMETRY II - ====
Date and Time: Jan. 10th 13:30-15:45 
Chair: '''Akatsuki Kimura''' 
Speakers:
{|
|-
!
!　　
![http://www.princeton.edu/cbe/people/faculty/brangwynne/ '''Cliff Brangwynne'''] ( Princeton University, USA ) 
title: tba
|-
!
!　　
![http://www.nig.ac.jp/nig/research/interviews/faculty-interviews/kimura '''Akatsuki Kimura'''] ( National Insititute of Genetics, Japan ) 
title: tba
|-
!
!　　
![http://www.kcl.ac.uk/lsm/research/divisions/randall/research/sections/motility/stramer/stramerbrian.aspx '''Brian Stramer'''] ( King's College London, UK )
title: "Intercellular forces orchestrate contact inhibition of locomotion" 
|}
 
----
'''Coffee Break'''
Date and Time: Jan. 10th 15:45-16:00 
----

====Session: Quantity - INFORMATION -====
Date and Time: Jan. 10th 16:00-19:00 
Chair:'''Yuki Tsukada''' 
Speakers:
{|
|-
!
!　　
![http://sawailab.c.u-tokyo.ac.jp/# '''Satoshi Sawai'''] ( the University of Tokyo, Japan ) 
title: tba
|-
!
!　　
![http://clarklab.yale.edu/ '''Damon Clark'''] ( Yale University, USA )
title: "Dissecting neural circuits for motion estimation in Drosophila"
|-
|-
!
!
![http://elegans.bio.nagoya-u.ac.jp/~tsukada/ '''Yuki Tsukada'''] ( Nagoya University, Japan )
title: "Quantification and reconstruction of thermosensory neuronal processing
in C. elegans"
|-
!
!
![http://engineering.purdue.edu/ABE/People/ptProfile?resource_id=46484 '''David Umulis'''] ( Purdue University, USA )
title: "Quantification and modeling of BMP signaling during zebrafish embryo development"
|}
----

====Poster Session III====
Date and Time: Jan. 10th 19:00-20:30 
 
----
----

=== Jan. 11th===
-----
====Session: Quantities and Beyond====
Date and Time: Jan. 11th 9:00-11:15 
Chair: '''Naoki Irie''' 
Speakers:
{|-
!
!　　
![http://www.biol.s.u-tokyo.ac.jp/users/hassei/irie/index_e.html '''Naoki Irie''']( the University of Tokto, Japan )
title: "Double bladed aspect of gene recruitment to morphological evolution"
|-
!
!
![http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/wakamoto-lab/Member_e.html '''Yuichi Wakamoto'''] ( the University of Tokyo, Japan )
title: "Fitness and gene expression from the viewpoint of single-cell histories"
|-
!
!
! [http://research-en.crmind.net/ '''Tetsuya J Kobayashi''']( the University of Tokyo, Japan )
title: "Linking Quantities from Information to Fitness"
|}
----

====Open Discussion====
Date and Time: Jan. 11th 11:15-12:00 
----

==Links==
[http://q-bio.jp/wiki/IIS_Sympo Tokyo Symposium: Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems] 
[http://symposium.crmind.net/bridging_thr_exp/Home.html NIG International Symposium 2016 satellite workshop] 
[http://symposium.crmind.net/EIC2015/Home.html Toyota Physical & Chemical Research Institute Workshop] 
[http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/nigsymposium2016/MishimaSympo.html Mishima Symposium: Quantitative Biology - force, information and dynamics] 

==Contacts==
qbioint2016 at gmail.com 
 
Organizers: Akatsuki Kimura (NIG), Akira Funahashi (Keio Univ.), Noriko F. Hiroi (Keio Univ.), Tetsuya J. Kobayashi (Univ. Tokyo)

IIS Sympo

2015-11-20T08:35:45Z

Akkimura: /* NIG International Symposium 2016 */

==='''NIG International Symposium 2016'''===
This event is sponsored by National Institute of Genetics ([http://www.nig.ac.jp/nig/ NIG]) and held as the NIG International Symposium 2016.

===''Tokyo Symposium at Institute of Industrial Science, the University of Tokyo''===

=='''Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems '''==

'''Exploring frontiers of quantitative biology by identifying X-factors that shape living systems'''

'''Quantitative biology is a growing discipline goes beyond the quantification of biological phenomena and attempts to unveil fundamental and general principles governing living systems.'''

'''After decades of emphasis on the study of GENES to reveal such principles, recent advances in quantitative biology have shed light on other key factors in biology, designated as X-FACTORS. X-factors include FORCE and SYMMETRY, which control the shape, size, and movement of cells and tissues, and INFORMATION, which characterizes processing and transduction of intra- and inter-cellular signaling. Enumerating such X-factors represents a milestone in quantitative biology.'''

'''In the Tokyo Symposium, we shall focus on X-factors in biology. This symposium was designed to share and discuss our vision for the frontiers of quantitative biology with cutting-edge researchers from around the world. We expect active discussions on state-of-the-art techniques to measure and manipulate X-factors and on the integration of different X-factors, leading towards a deeper understanding of the nature of living systems.'''

==Date: Jan 9th - 11th, 2016.==
Jan. 9th 13:00 to Jan. 11th 12:00

==Venue for workshops and the Symposium at Tokyo==
Convention hall, An Block, Institute of Industrial Science, 
Komaba Ⅱ Research Campus, the University of Tokyo.
 [http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access_e/access_e.html Access to Komaba Ⅱ Research Campus]
 [http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access_e/campusmap_e.html Campus map]

==Registration and Abstract submission (Oct/20/2015)==
'''Registration Deadline is approaching: Nov. 30th mon. 2015''' 
'''Registration from [https://docs.google.com/forms/d/1hNiBiiLu73N0Mo9FS5O03D0LTu7VHHP-BqJtOAzoNPY/viewform?usp=send_form here].''' 
 
'''Poster Abstract submission deadline: Dec. 10th thr. 2015''' 
'''For a poster presentation, please submit your abstract from [https://docs.google.com/forms/d/1x3dNWPk6GZDBLec_O3WFCaXsaqmis83wtzdt8f5AetM/viewform?usp=send_form here].'''
 
 
'''DON'T MISS!''' 
'''Please be sure that the above registration and abstract submission are both ONLY for Tokyo Symposium. '''
 For the registration and abstract submission to the other workshops and symposium, you may visit the other sites ([http://q-bio.jp/wiki/Events Events]).'''

'''Seating capacity: Approximately 150, excluding invited speakers ( approx. 20 people ).'''

==Speakers and Abstracts==
[[SpeakersandAbstracts|'''Link to a "Speakers and Abstracts" page.''']]

==Scientific Program==
=== Jan. 9th===
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=====Opening Remarks=====
Date and Time: Jan. 9th 13:00-13:10 
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====Session: Quantity - FORCE -====
Date and Time: Jan. 9th 13:10-15:25 
Chair: '''Kaoru Sugimura''' 
Speakers:
{|
|-
!
!　　
![http://me.ucsb.edu/people/otger-campas '''Otger Campàs'''] ( University of California, Santa Barbara, USA ) 
title: "Quantifying tissue mechanics in vivo and in situ"
|-
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![http://www.koolau.info/ '''Kaoru Sugimura'''] ( Kyoto Univ., Japan ) 
title: "Quantifying epithelial tissue morphogenesis: from F-actin regulation to cell kinematics and tissue stress"
|-
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![http://umr168.curie.fr/en/profile/emmanuel-farge-00906 '''Emmanuel Farge'''] ( Institut Curie, France )
title: "From mesoderm mechanotransductive evolutionary origins to tumourogenic mechanical induction"
|-
|}

====Poster Session I====
Date and Time: Jan. 9th 15:25-18:30 including 5-min instructions of poster presentations 

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=== Jan. 10th===
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====Session: Quantity - SYMMETRY I -====
Date and Time: Jan. 10th 9:00-12:00 
Co-Chair: '''Noriko Hiroi and Yusuke Maeda''' 
Speakers:
{|
|-
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![http://fun.bio.keio.ac.jp/people/ '''Noriko Hiroi'''] ( Keio University, Japan )
title: "Anisotropy shaped by and for the Dynamic Distribution of Heat"
|-
!
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![http://www.imcb.a-star.edu.sg/php/np.php '''Nicolas D Plachta'''] ( IMCB, Singapore )
title: "Seeing how mammalian life starts: Quantitative imaging in live mouse embryos"
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![http://www.yusukeman.org/YM/youkoso.html '''Yusuke Maeda'''] ( Kyushu University, Japan )
title: tba
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![http://www.chimie.ens.fr/?q=en/umr-8640/biophysical-chemistry/profil/zoher.gueroui '''Zoher Gueroui'''] ( École Normale Supérieure, France )
title:tba
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====Poster Session II====
Date and Time: Jan. 10th 12:00-13:30 
 
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====Session: Quantity - SYMMETRY II - ====
Date and Time: Jan. 10th 13:30-15:45 
Chair: '''Akatsuki Kimura''' 
Speakers:
{|
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![http://www.princeton.edu/cbe/people/faculty/brangwynne/ '''Cliff Brangwynne'''] ( Princeton University, USA ) 
title: tba
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![http://www.nig.ac.jp/nig/research/interviews/faculty-interviews/kimura '''Akatsuki Kimura'''] ( National Insititute of Genetics, Japan ) 
title: tba
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![http://www.kcl.ac.uk/lsm/research/divisions/randall/research/sections/motility/stramer/stramerbrian.aspx '''Brian Stramer'''] ( King's College London, UK )
title: "Intercellular forces orchestrate contact inhibition of locomotion" 
|}
 
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'''Coffee Break'''
Date and Time: Jan. 10th 15:45-16:00 
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====Session: Quantity - INFORMATION -====
Date and Time: Jan. 10th 16:00-19:00 
Chair:'''Yuki Tsukada''' 
Speakers:
{|
|-
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![http://sawailab.c.u-tokyo.ac.jp/# '''Satoshi Sawai'''] ( the University of Tokyo, Japan ) 
title: tba
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![http://clarklab.yale.edu/ '''Damon Clark'''] ( Yale University, USA )
title: "Dissecting neural circuits for motion estimation in Drosophila"
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![http://elegans.bio.nagoya-u.ac.jp/~tsukada/ '''Yuki Tsukada'''] ( Nagoya University, Japan )
title: "Quantification and reconstruction of thermosensory neuronal processing
in C. elegans"
|-
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![http://engineering.purdue.edu/ABE/People/ptProfile?resource_id=46484 '''David Umulis'''] ( Purdue University, USA )
title: "Quantification and modeling of BMP signaling during zebrafish embryo development"
|}
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====Poster Session III====
Date and Time: Jan. 10th 19:00-20:30 
 
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=== Jan. 11th===
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====Session: Quantities and Beyond====
Date and Time: Jan. 11th 9:00-11:15 
Chair: '''Naoki Irie''' 
Speakers:
{|-
!
!　　
![http://www.biol.s.u-tokyo.ac.jp/users/hassei/irie/index_e.html '''Naoki Irie''']( the University of Tokto, Japan )
title: "Double bladed aspect of gene recruitment to morphological evolution"
|-
!
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![http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/wakamoto-lab/Member_e.html '''Yuichi Wakamoto'''] ( the University of Tokyo, Japan )
title: "Fitness and gene expression from the viewpoint of single-cell histories"
|-
!
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! [http://research-en.crmind.net/ '''Tetsuya J Kobayashi''']( the University of Tokyo, Japan )
title: "Linking Quantities from Information to Fitness"
|}
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====Open Discussion====
Date and Time: Jan. 11th 11:15-12:00 
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==Links==
[http://q-bio.jp/wiki/IIS_Sympo Tokyo Symposium: Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems] 
[http://symposium.crmind.net/bridging_thr_exp/Home.html NIG International Symposium 2016 satellite workshop] 
[http://symposium.crmind.net/EIC2015/Home.html Toyota Physical & Chemical Research Institute Workshop] 
[http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/nigsymposium2016/MishimaSympo.html Mishima Symposium: Quantitative Biology - force, information and dynamics] 

==Contacts==
qbioint2016 at gmail.com 
 
Organizers: Akatsuki Kimura (NIG), Akira Funahashi (Keio Univ.), Noriko F. Hiroi (Keio Univ.), Tetsuya J. Kobayashi (Univ. Tokyo)

IIS Sympo

2015-11-20T08:35:20Z

Akkimura: /* NIG International Symposium 2016 */

===='''NIG International Symposium 2016'''====
This event is sponsored by National Institute of Genetics ([http://www.nig.ac.jp/nig/ NIG]) and held as the NIG International Symposium 2016.

===''Tokyo Symposium at Institute of Industrial Science, the University of Tokyo''===

=='''Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems '''==

'''Exploring frontiers of quantitative biology by identifying X-factors that shape living systems'''

'''Quantitative biology is a growing discipline goes beyond the quantification of biological phenomena and attempts to unveil fundamental and general principles governing living systems.'''

'''After decades of emphasis on the study of GENES to reveal such principles, recent advances in quantitative biology have shed light on other key factors in biology, designated as X-FACTORS. X-factors include FORCE and SYMMETRY, which control the shape, size, and movement of cells and tissues, and INFORMATION, which characterizes processing and transduction of intra- and inter-cellular signaling. Enumerating such X-factors represents a milestone in quantitative biology.'''

'''In the Tokyo Symposium, we shall focus on X-factors in biology. This symposium was designed to share and discuss our vision for the frontiers of quantitative biology with cutting-edge researchers from around the world. We expect active discussions on state-of-the-art techniques to measure and manipulate X-factors and on the integration of different X-factors, leading towards a deeper understanding of the nature of living systems.'''

==Date: Jan 9th - 11th, 2016.==
Jan. 9th 13:00 to Jan. 11th 12:00

==Venue for workshops and the Symposium at Tokyo==
Convention hall, An Block, Institute of Industrial Science, 
Komaba Ⅱ Research Campus, the University of Tokyo.
 [http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access_e/access_e.html Access to Komaba Ⅱ Research Campus]
 [http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access_e/campusmap_e.html Campus map]

==Registration and Abstract submission (Oct/20/2015)==
'''Registration Deadline is approaching: Nov. 30th mon. 2015''' 
'''Registration from [https://docs.google.com/forms/d/1hNiBiiLu73N0Mo9FS5O03D0LTu7VHHP-BqJtOAzoNPY/viewform?usp=send_form here].''' 
 
'''Poster Abstract submission deadline: Dec. 10th thr. 2015''' 
'''For a poster presentation, please submit your abstract from [https://docs.google.com/forms/d/1x3dNWPk6GZDBLec_O3WFCaXsaqmis83wtzdt8f5AetM/viewform?usp=send_form here].'''
 
 
'''DON'T MISS!''' 
'''Please be sure that the above registration and abstract submission are both ONLY for Tokyo Symposium. '''
 For the registration and abstract submission to the other workshops and symposium, you may visit the other sites ([http://q-bio.jp/wiki/Events Events]).'''

'''Seating capacity: Approximately 150, excluding invited speakers ( approx. 20 people ).'''

==Speakers and Abstracts==
[[SpeakersandAbstracts|'''Link to a "Speakers and Abstracts" page.''']]

==Scientific Program==
=== Jan. 9th===
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=====Opening Remarks=====
Date and Time: Jan. 9th 13:00-13:10 
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====Session: Quantity - FORCE -====
Date and Time: Jan. 9th 13:10-15:25 
Chair: '''Kaoru Sugimura''' 
Speakers:
{|
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![http://me.ucsb.edu/people/otger-campas '''Otger Campàs'''] ( University of California, Santa Barbara, USA ) 
title: "Quantifying tissue mechanics in vivo and in situ"
|-
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![http://www.koolau.info/ '''Kaoru Sugimura'''] ( Kyoto Univ., Japan ) 
title: "Quantifying epithelial tissue morphogenesis: from F-actin regulation to cell kinematics and tissue stress"
|-
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![http://umr168.curie.fr/en/profile/emmanuel-farge-00906 '''Emmanuel Farge'''] ( Institut Curie, France )
title: "From mesoderm mechanotransductive evolutionary origins to tumourogenic mechanical induction"
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====Poster Session I====
Date and Time: Jan. 9th 15:25-18:30 including 5-min instructions of poster presentations 

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=== Jan. 10th===
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====Session: Quantity - SYMMETRY I -====
Date and Time: Jan. 10th 9:00-12:00 
Co-Chair: '''Noriko Hiroi and Yusuke Maeda''' 
Speakers:
{|
|-
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![http://fun.bio.keio.ac.jp/people/ '''Noriko Hiroi'''] ( Keio University, Japan )
title: "Anisotropy shaped by and for the Dynamic Distribution of Heat"
|-
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![http://www.imcb.a-star.edu.sg/php/np.php '''Nicolas D Plachta'''] ( IMCB, Singapore )
title: "Seeing how mammalian life starts: Quantitative imaging in live mouse embryos"
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![http://www.yusukeman.org/YM/youkoso.html '''Yusuke Maeda'''] ( Kyushu University, Japan )
title: tba
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![http://www.chimie.ens.fr/?q=en/umr-8640/biophysical-chemistry/profil/zoher.gueroui '''Zoher Gueroui'''] ( École Normale Supérieure, France )
title:tba
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|}

====Poster Session II====
Date and Time: Jan. 10th 12:00-13:30 
 
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====Session: Quantity - SYMMETRY II - ====
Date and Time: Jan. 10th 13:30-15:45 
Chair: '''Akatsuki Kimura''' 
Speakers:
{|
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![http://www.princeton.edu/cbe/people/faculty/brangwynne/ '''Cliff Brangwynne'''] ( Princeton University, USA ) 
title: tba
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![http://www.nig.ac.jp/nig/research/interviews/faculty-interviews/kimura '''Akatsuki Kimura'''] ( National Insititute of Genetics, Japan ) 
title: tba
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![http://www.kcl.ac.uk/lsm/research/divisions/randall/research/sections/motility/stramer/stramerbrian.aspx '''Brian Stramer'''] ( King's College London, UK )
title: "Intercellular forces orchestrate contact inhibition of locomotion" 
|}
 
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'''Coffee Break'''
Date and Time: Jan. 10th 15:45-16:00 
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====Session: Quantity - INFORMATION -====
Date and Time: Jan. 10th 16:00-19:00 
Chair:'''Yuki Tsukada''' 
Speakers:
{|
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![http://sawailab.c.u-tokyo.ac.jp/# '''Satoshi Sawai'''] ( the University of Tokyo, Japan ) 
title: tba
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!　　
![http://clarklab.yale.edu/ '''Damon Clark'''] ( Yale University, USA )
title: "Dissecting neural circuits for motion estimation in Drosophila"
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![http://elegans.bio.nagoya-u.ac.jp/~tsukada/ '''Yuki Tsukada'''] ( Nagoya University, Japan )
title: "Quantification and reconstruction of thermosensory neuronal processing
in C. elegans"
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![http://engineering.purdue.edu/ABE/People/ptProfile?resource_id=46484 '''David Umulis'''] ( Purdue University, USA )
title: "Quantification and modeling of BMP signaling during zebrafish embryo development"
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====Poster Session III====
Date and Time: Jan. 10th 19:00-20:30 
 
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=== Jan. 11th===
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====Session: Quantities and Beyond====
Date and Time: Jan. 11th 9:00-11:15 
Chair: '''Naoki Irie''' 
Speakers:
{|-
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![http://www.biol.s.u-tokyo.ac.jp/users/hassei/irie/index_e.html '''Naoki Irie''']( the University of Tokto, Japan )
title: "Double bladed aspect of gene recruitment to morphological evolution"
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![http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/wakamoto-lab/Member_e.html '''Yuichi Wakamoto'''] ( the University of Tokyo, Japan )
title: "Fitness and gene expression from the viewpoint of single-cell histories"
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! [http://research-en.crmind.net/ '''Tetsuya J Kobayashi''']( the University of Tokyo, Japan )
title: "Linking Quantities from Information to Fitness"
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====Open Discussion====
Date and Time: Jan. 11th 11:15-12:00 
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==Links==
[http://q-bio.jp/wiki/IIS_Sympo Tokyo Symposium: Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems] 
[http://symposium.crmind.net/bridging_thr_exp/Home.html NIG International Symposium 2016 satellite workshop] 
[http://symposium.crmind.net/EIC2015/Home.html Toyota Physical & Chemical Research Institute Workshop] 
[http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/nigsymposium2016/MishimaSympo.html Mishima Symposium: Quantitative Biology - force, information and dynamics] 

==Contacts==
qbioint2016 at gmail.com 
 
Organizers: Akatsuki Kimura (NIG), Akira Funahashi (Keio Univ.), Noriko F. Hiroi (Keio Univ.), Tetsuya J. Kobayashi (Univ. Tokyo)

IIS Sympo

2015-11-20T08:32:33Z

Akkimura: /* NIG International Symposium 2016 */

='''NIG International Symposium 2016'''=
This event is sponsored by National Institute of Genetics ([http://www.nig.ac.jp/nig/ NIG]) and held as the NIG International Symposium 2016.

===''Tokyo Symposium at Institute of Industrial Science, the University of Tokyo''===

=='''Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems '''==

'''Exploring frontiers of quantitative biology by identifying X-factors that shape living systems'''

'''Quantitative biology is a growing discipline goes beyond the quantification of biological phenomena and attempts to unveil fundamental and general principles governing living systems.'''

'''After decades of emphasis on the study of GENES to reveal such principles, recent advances in quantitative biology have shed light on other key factors in biology, designated as X-FACTORS. X-factors include FORCE and SYMMETRY, which control the shape, size, and movement of cells and tissues, and INFORMATION, which characterizes processing and transduction of intra- and inter-cellular signaling. Enumerating such X-factors represents a milestone in quantitative biology.'''

'''In the Tokyo Symposium, we shall focus on X-factors in biology. This symposium was designed to share and discuss our vision for the frontiers of quantitative biology with cutting-edge researchers from around the world. We expect active discussions on state-of-the-art techniques to measure and manipulate X-factors and on the integration of different X-factors, leading towards a deeper understanding of the nature of living systems.'''

==Date: Jan 9th - 11th, 2016.==
Jan. 9th 13:00 to Jan. 11th 12:00

==Venue for workshops and the Symposium at Tokyo==
Convention hall, An Block, Institute of Industrial Science, 
Komaba Ⅱ Research Campus, the University of Tokyo.
 [http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access_e/access_e.html Access to Komaba Ⅱ Research Campus]
 [http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access_e/campusmap_e.html Campus map]

==Registration and Abstract submission (Oct/20/2015)==
'''Registration Deadline is approaching: Nov. 30th mon. 2015''' 
'''Registration from [https://docs.google.com/forms/d/1hNiBiiLu73N0Mo9FS5O03D0LTu7VHHP-BqJtOAzoNPY/viewform?usp=send_form here].''' 
 
'''Poster Abstract submission deadline: Dec. 10th thr. 2015''' 
'''For a poster presentation, please submit your abstract from [https://docs.google.com/forms/d/1x3dNWPk6GZDBLec_O3WFCaXsaqmis83wtzdt8f5AetM/viewform?usp=send_form here].'''
 
 
'''DON'T MISS!''' 
'''Please be sure that the above registration and abstract submission are both ONLY for Tokyo Symposium. '''
 For the registration and abstract submission to the other workshops and symposium, you may visit the other sites ([http://q-bio.jp/wiki/Events Events]).'''

'''Seating capacity: Approximately 150, excluding invited speakers ( approx. 20 people ).'''

==Speakers and Abstracts==
[[SpeakersandAbstracts|'''Link to a "Speakers and Abstracts" page.''']]

==Scientific Program==
=== Jan. 9th===
-----
=====Opening Remarks=====
Date and Time: Jan. 9th 13:00-13:10 
-----

====Session: Quantity - FORCE -====
Date and Time: Jan. 9th 13:10-15:25 
Chair: '''Kaoru Sugimura''' 
Speakers:
{|
|-
!
!　　
![http://me.ucsb.edu/people/otger-campas '''Otger Campàs'''] ( University of California, Santa Barbara, USA ) 
title: "Quantifying tissue mechanics in vivo and in situ"
|-
!
!
![http://www.koolau.info/ '''Kaoru Sugimura'''] ( Kyoto Univ., Japan ) 
title: "Quantifying epithelial tissue morphogenesis: from F-actin regulation to cell kinematics and tissue stress"
|-
!
!
![http://umr168.curie.fr/en/profile/emmanuel-farge-00906 '''Emmanuel Farge'''] ( Institut Curie, France )
title: "From mesoderm mechanotransductive evolutionary origins to tumourogenic mechanical induction"
|-
|}

====Poster Session I====
Date and Time: Jan. 9th 15:25-18:30 including 5-min instructions of poster presentations 

----
----

=== Jan. 10th===
-----
====Session: Quantity - SYMMETRY I -====
Date and Time: Jan. 10th 9:00-12:00 
Co-Chair: '''Noriko Hiroi and Yusuke Maeda''' 
Speakers:
{|
|-
!
!　　
![http://fun.bio.keio.ac.jp/people/ '''Noriko Hiroi'''] ( Keio University, Japan )
title: "Anisotropy shaped by and for the Dynamic Distribution of Heat"
|-
!
!
![http://www.imcb.a-star.edu.sg/php/np.php '''Nicolas D Plachta'''] ( IMCB, Singapore )
title: "Seeing how mammalian life starts: Quantitative imaging in live mouse embryos"
|-
!
!
![http://www.yusukeman.org/YM/youkoso.html '''Yusuke Maeda'''] ( Kyushu University, Japan )
title: tba
|-
!
!
![http://www.chimie.ens.fr/?q=en/umr-8640/biophysical-chemistry/profil/zoher.gueroui '''Zoher Gueroui'''] ( École Normale Supérieure, France )
title:tba
|-
|}

====Poster Session II====
Date and Time: Jan. 10th 12:00-13:30 
 
----

====Session: Quantity - SYMMETRY II - ====
Date and Time: Jan. 10th 13:30-15:45 
Chair: '''Akatsuki Kimura''' 
Speakers:
{|
|-
!
!　　
![http://www.princeton.edu/cbe/people/faculty/brangwynne/ '''Cliff Brangwynne'''] ( Princeton University, USA ) 
title: tba
|-
!
!　　
![http://www.nig.ac.jp/nig/research/interviews/faculty-interviews/kimura '''Akatsuki Kimura'''] ( National Insititute of Genetics, Japan ) 
title: tba
|-
!
!　　
![http://www.kcl.ac.uk/lsm/research/divisions/randall/research/sections/motility/stramer/stramerbrian.aspx '''Brian Stramer'''] ( King's College London, UK )
title: "Intercellular forces orchestrate contact inhibition of locomotion" 
|}
 
----
'''Coffee Break'''
Date and Time: Jan. 10th 15:45-16:00 
----

====Session: Quantity - INFORMATION -====
Date and Time: Jan. 10th 16:00-19:00 
Chair:'''Yuki Tsukada''' 
Speakers:
{|
|-
!
!　　
![http://sawailab.c.u-tokyo.ac.jp/# '''Satoshi Sawai'''] ( the University of Tokyo, Japan ) 
title: tba
|-
!
!　　
![http://clarklab.yale.edu/ '''Damon Clark'''] ( Yale University, USA )
title: "Dissecting neural circuits for motion estimation in Drosophila"
|-
|-
!
!
![http://elegans.bio.nagoya-u.ac.jp/~tsukada/ '''Yuki Tsukada'''] ( Nagoya University, Japan )
title: "Quantification and reconstruction of thermosensory neuronal processing
in C. elegans"
|-
!
!
![http://engineering.purdue.edu/ABE/People/ptProfile?resource_id=46484 '''David Umulis'''] ( Purdue University, USA )
title: "Quantification and modeling of BMP signaling during zebrafish embryo development"
|}
----

====Poster Session III====
Date and Time: Jan. 10th 19:00-20:30 
 
----
----

=== Jan. 11th===
-----
====Session: Quantities and Beyond====
Date and Time: Jan. 11th 9:00-11:15 
Chair: '''Naoki Irie''' 
Speakers:
{|-
!
!　　
![http://www.biol.s.u-tokyo.ac.jp/users/hassei/irie/index_e.html '''Naoki Irie''']( the University of Tokto, Japan )
title: "Double bladed aspect of gene recruitment to morphological evolution"
|-
!
!
![http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/wakamoto-lab/Member_e.html '''Yuichi Wakamoto'''] ( the University of Tokyo, Japan )
title: "Fitness and gene expression from the viewpoint of single-cell histories"
|-
!
!
! [http://research-en.crmind.net/ '''Tetsuya J Kobayashi''']( the University of Tokyo, Japan )
title: "Linking Quantities from Information to Fitness"
|}
----

====Open Discussion====
Date and Time: Jan. 11th 11:15-12:00 
----

==Links==
[http://q-bio.jp/wiki/IIS_Sympo Tokyo Symposium: Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems] 
[http://symposium.crmind.net/bridging_thr_exp/Home.html NIG International Symposium 2016 satellite workshop] 
[http://symposium.crmind.net/EIC2015/Home.html Toyota Physical & Chemical Research Institute Workshop] 
[http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/nigsymposium2016/MishimaSympo.html Mishima Symposium: Quantitative Biology - force, information and dynamics] 

==Contacts==
qbioint2016 at gmail.com 
 
Organizers: Akatsuki Kimura (NIG), Akira Funahashi (Keio Univ.), Noriko F. Hiroi (Keio Univ.), Tetsuya J. Kobayashi (Univ. Tokyo)

IIS Sympo

2015-11-20T08:31:35Z

Akkimura: /* NIG International Symposium 2016 */

IIS Sympo

2015-11-20T08:30:37Z

Akkimura: /* NIG International Symposium 2016 */

===='''NIG International Symposium 2016'''====
This event is sponsored by National Institute of Genetics (NIG) and held as the NIG International Symposium 2016.

===''Tokyo Symposium at Institute of Industrial Science, the University of Tokyo''===

=='''Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems '''==

'''Exploring frontiers of quantitative biology by identifying X-factors that shape living systems'''

'''Quantitative biology is a growing discipline goes beyond the quantification of biological phenomena and attempts to unveil fundamental and general principles governing living systems.'''

'''After decades of emphasis on the study of GENES to reveal such principles, recent advances in quantitative biology have shed light on other key factors in biology, designated as X-FACTORS. X-factors include FORCE and SYMMETRY, which control the shape, size, and movement of cells and tissues, and INFORMATION, which characterizes processing and transduction of intra- and inter-cellular signaling. Enumerating such X-factors represents a milestone in quantitative biology.'''

'''In the Tokyo Symposium, we shall focus on X-factors in biology. This symposium was designed to share and discuss our vision for the frontiers of quantitative biology with cutting-edge researchers from around the world. We expect active discussions on state-of-the-art techniques to measure and manipulate X-factors and on the integration of different X-factors, leading towards a deeper understanding of the nature of living systems.'''

==Date: Jan 9th - 11th, 2016.==
Jan. 9th 13:00 to Jan. 11th 12:00

==Venue for workshops and the Symposium at Tokyo==
Convention hall, An Block, Institute of Industrial Science, 
Komaba Ⅱ Research Campus, the University of Tokyo.
 [http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access_e/access_e.html Access to Komaba Ⅱ Research Campus]
 [http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access_e/campusmap_e.html Campus map]

==Registration and Abstract submission (Oct/20/2015)==
'''Registration Deadline is approaching: Nov. 30th mon. 2015''' 
'''Registration from [https://docs.google.com/forms/d/1hNiBiiLu73N0Mo9FS5O03D0LTu7VHHP-BqJtOAzoNPY/viewform?usp=send_form here].''' 
 
'''Poster Abstract submission deadline: Dec. 10th thr. 2015''' 
'''For a poster presentation, please submit your abstract from [https://docs.google.com/forms/d/1x3dNWPk6GZDBLec_O3WFCaXsaqmis83wtzdt8f5AetM/viewform?usp=send_form here].'''
 
 
'''DON'T MISS!''' 
'''Please be sure that the above registration and abstract submission are both ONLY for Tokyo Symposium. '''
 For the registration and abstract submission to the other workshops and symposium, you may visit the other sites ([http://q-bio.jp/wiki/Events Events]).'''

'''Seating capacity: Approximately 150, excluding invited speakers ( approx. 20 people ).'''

==Speakers and Abstracts==
[[SpeakersandAbstracts|'''Link to a "Speakers and Abstracts" page.''']]

==Scientific Program==
=== Jan. 9th===
-----
=====Opening Remarks=====
Date and Time: Jan. 9th 13:00-13:10 
-----

====Session: Quantity - FORCE -====
Date and Time: Jan. 9th 13:10-15:25 
Chair: '''Kaoru Sugimura''' 
Speakers:
{|
|-
!
!　　
![http://me.ucsb.edu/people/otger-campas '''Otger Campàs'''] ( University of California, Santa Barbara, USA ) 
title: "Quantifying tissue mechanics in vivo and in situ"
|-
!
!
![http://www.koolau.info/ '''Kaoru Sugimura'''] ( Kyoto Univ., Japan ) 
title: "Quantifying epithelial tissue morphogenesis: from F-actin regulation to cell kinematics and tissue stress"
|-
!
!
![http://umr168.curie.fr/en/profile/emmanuel-farge-00906 '''Emmanuel Farge'''] ( Institut Curie, France )
title: "From mesoderm mechanotransductive evolutionary origins to tumourogenic mechanical induction"
|-
|}

====Poster Session I====
Date and Time: Jan. 9th 15:25-18:30 including 5-min instructions of poster presentations 

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----

=== Jan. 10th===
-----
====Session: Quantity - SYMMETRY I -====
Date and Time: Jan. 10th 9:00-12:00 
Co-Chair: '''Noriko Hiroi and Yusuke Maeda''' 
Speakers:
{|
|-
!
!　　
![http://fun.bio.keio.ac.jp/people/ '''Noriko Hiroi'''] ( Keio University, Japan )
title: "Anisotropy shaped by and for the Dynamic Distribution of Heat"
|-
!
!
![http://www.imcb.a-star.edu.sg/php/np.php '''Nicolas D Plachta'''] ( IMCB, Singapore )
title: "Seeing how mammalian life starts: Quantitative imaging in live mouse embryos"
|-
!
!
![http://www.yusukeman.org/YM/youkoso.html '''Yusuke Maeda'''] ( Kyushu University, Japan )
title: tba
|-
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!
![http://www.chimie.ens.fr/?q=en/umr-8640/biophysical-chemistry/profil/zoher.gueroui '''Zoher Gueroui'''] ( École Normale Supérieure, France )
title:tba
|-
|}

====Poster Session II====
Date and Time: Jan. 10th 12:00-13:30 
 
----

====Session: Quantity - SYMMETRY II - ====
Date and Time: Jan. 10th 13:30-15:45 
Chair: '''Akatsuki Kimura''' 
Speakers:
{|
|-
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!　　
![http://www.princeton.edu/cbe/people/faculty/brangwynne/ '''Cliff Brangwynne'''] ( Princeton University, USA ) 
title: tba
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![http://www.nig.ac.jp/nig/research/interviews/faculty-interviews/kimura '''Akatsuki Kimura'''] ( National Insititute of Genetics, Japan ) 
title: tba
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![http://www.kcl.ac.uk/lsm/research/divisions/randall/research/sections/motility/stramer/stramerbrian.aspx '''Brian Stramer'''] ( King's College London, UK )
title: "Intercellular forces orchestrate contact inhibition of locomotion" 
|}
 
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'''Coffee Break'''
Date and Time: Jan. 10th 15:45-16:00 
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====Session: Quantity - INFORMATION -====
Date and Time: Jan. 10th 16:00-19:00 
Chair:'''Yuki Tsukada''' 
Speakers:
{|
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![http://sawailab.c.u-tokyo.ac.jp/# '''Satoshi Sawai'''] ( the University of Tokyo, Japan ) 
title: tba
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![http://clarklab.yale.edu/ '''Damon Clark'''] ( Yale University, USA )
title: "Dissecting neural circuits for motion estimation in Drosophila"
|-
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![http://elegans.bio.nagoya-u.ac.jp/~tsukada/ '''Yuki Tsukada'''] ( Nagoya University, Japan )
title: "Quantification and reconstruction of thermosensory neuronal processing
in C. elegans"
|-
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![http://engineering.purdue.edu/ABE/People/ptProfile?resource_id=46484 '''David Umulis'''] ( Purdue University, USA )
title: "Quantification and modeling of BMP signaling during zebrafish embryo development"
|}
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====Poster Session III====
Date and Time: Jan. 10th 19:00-20:30 
 
----
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=== Jan. 11th===
-----
====Session: Quantities and Beyond====
Date and Time: Jan. 11th 9:00-11:15 
Chair: '''Naoki Irie''' 
Speakers:
{|-
!
!　　
![http://www.biol.s.u-tokyo.ac.jp/users/hassei/irie/index_e.html '''Naoki Irie''']( the University of Tokto, Japan )
title: "Double bladed aspect of gene recruitment to morphological evolution"
|-
!
!
![http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/wakamoto-lab/Member_e.html '''Yuichi Wakamoto'''] ( the University of Tokyo, Japan )
title: "Fitness and gene expression from the viewpoint of single-cell histories"
|-
!
!
! [http://research-en.crmind.net/ '''Tetsuya J Kobayashi''']( the University of Tokyo, Japan )
title: "Linking Quantities from Information to Fitness"
|}
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====Open Discussion====
Date and Time: Jan. 11th 11:15-12:00 
----

==Links==
[http://q-bio.jp/wiki/IIS_Sympo Tokyo Symposium: Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems] 
[http://symposium.crmind.net/bridging_thr_exp/Home.html NIG International Symposium 2016 satellite workshop] 
[http://symposium.crmind.net/EIC2015/Home.html Toyota Physical & Chemical Research Institute Workshop] 
[http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/nigsymposium2016/MishimaSympo.html Mishima Symposium: Quantitative Biology - force, information and dynamics] 

==Contacts==
qbioint2016 at gmail.com 
 
Organizers: Akatsuki Kimura (NIG), Akira Funahashi (Keio Univ.), Noriko F. Hiroi (Keio Univ.), Tetsuya J. Kobayashi (Univ. Tokyo)

Events

2015-11-11T07:50:50Z

Akkimura: /*- Mishima Symposium: Quantitative Biology - force, information and dynamics */

== 最新のイベント情報 ==
'''''NIG International Symposium 2016 + ROIS Event''''' 
and '''''Toyoda Physical & Chemical Research Institute Workshop''''' 

='''Japan q-bio week''' (Jan/8/2016~Jan/13/2016)=
We will have a series of international symposiums and workshops (Japan q-bio week) in place of the FY2015 annual meeting of the Japanese Society for Quantitative Biology, starting from Jan/8/2016 to Jan/13/2016. Most symposiums and workshops will be held as NIG International Symposium 2016. All symposiums and workshops are organized by the core-members of Japanese Society for Quantitative Biology. Two symposiums, one in Tokyo and the other in Mishima, share a common list of speakers invited from around the world. These symposiums have different sets of domestic invited speakers and most likely have different sets of poster presentations. You can experience the essence of “Japan Q-Bio week” in each symposium. By participating in both symposiums, you can enjoy more of diverse research areas that quantitative biology impacts on.


=='''Tokyo Workshops'''==
[http://symposium.crmind.net/bridging_thr_exp/Home.html NIG International Symposium 2016 satellite workshop (Jan 8th, 9:00 - 12:00)] '''Bridging Theory & Experiment''' 
[http://symposium.crmind.net/EIC2015/Home.html Toyota Physical & Chemical Research Institute Workshop (Jan 8th, 13:00 - 18:00)] '''Entropy, Information & Control''' 
* Date: Jan/8/2016
* Site: Institute of Industrial Science, Bld. S , the Univ. Tokyo, Komaba
* Aim: Discussing how to bridge experiment and theory in quantitative biology. Discussing recent theoretical advancements on how “entropy”, “information”, “control”, and “fitness” are mutually related. 目的: 理論と実験の協働や定量的な生命現象の理解に貢献するであろう概念や理論についての発表が行われます。
* URL: http://symposium.crmind.net/bridging_thr_exp/Home.html
* URL: http://symposium.crmind.net/EIC2015/Home.html

=='''[[IIS_Sympo|NIG International Symposium - Tokyo Symposium: Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems]]'''==
* Date: Jan/9/2016~Jan/11/2016
* Site: Institute of Industrial Science, Bld. An, the Univ Tokyo Komaba
* Aim: Exploring frontiers of quantitative biology by identifying X-factors that shape living systems. 目的: 定量生物学の最先端の話題について、今後の生物学に重要になるであろう要素（X-factor) を探索するという観点から取り上げ、議論します。
* URL: http://q-bio.jp/wiki/IIS_Sympo 

=='''[http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/nigsymposium2016/MishimaSympo.html Mishima Symposium: Quantitative Biology - force, information and dynamics]'''==
* Date: Jan/12/2016~Jan/13/2016
* Site: National Institute of Genetics
* Aim: Expanding the horizons of biology by integrating genetics and quantitative biology. 目的: 遺伝学と定量生物学の融合によって、生物学の新たな地平を広げる契機となることを目指します。
* URL: http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/nigsymposium2016/MishimaSympo.html 
 
 
=== 定量生物学の会主催の公式研究会 ===

=== 定量生物学の会のメンバー主催のイベント ===

== 過去の研究会情報 ==
=== 終了した定量生物学の会主催の公式研究会 ===
*定量生物学の会年会
** [[第一回年会|第一回年会(2009/1)]]
** [[第二回年会|第二回年会(2010/1)]]
** [[定量生物学の会第三回年会 (2010/11)|第三回年会(2010/11)]]
** [[第四回年会|第四回年会(2012/1)]]
***[[4th_Annual_Meeting|4th Annual Meeting (in English)]]
** [[第五回年会|第五回年会(2012/11)]]
***[[5th_Annual_Meeting|5th Annual Meeting (in English)]]
**[[qbio6th_2013|第六回年会]]
***[[qbio6th_2013en|6th annual meeting]] 
**[[Qbio7th_2014|第七回年会]]
*定量生物学の会キャラバン
** [[第一回キャラバン]] at 遺伝研
*定量生物学の会準備会
** [[第一回定量生物学の会準備会プログラム|第一回準備会]]
** [[第二回定量生物学の会準備会プログラム|第二回準備会]]
* その他の研究会・夏の学校
** [[日本バイオインフォマティクス学会、定量生物学の会　共催夏の学校2009]]
**NGS現場の会・オープンバイオ研究会・生命情報科学若手の会・定量生物学の会４会合同シンポジウム[http://bioinfowakate.org/events/symposium2012 「これからの生命科学を考える」]
**[http://fun.bio.keio.ac.jp/iwqb2012/ International Workshop on Quantitative Biology 2012 (2012/11)]
**[http://fun.bio.keio.ac.jp/iwqb2013/ International Workshop on Quantitative Biology 2013 (2013/11) ]
**International Workshop on Quantitative Biology 2014 (2014/9) was held at VLSCI in Melbourne, Australia, as one of the workshops of ICSB 2014.

=== 終了した定量生物学の会のメンバー主催のイベント ===
* 生物数理モデル入門～生物への数理工学的アプローチ～
**小林徹也（東京大学生産技術研究所）
** １２月０４日（木）～１月１５日（木）:木曜日の１６：３０～１８：００
** 東京大学駒場キャンパス１号館１０６号室
** 詳細は[http://research.crmind.net/2008/11/post-9.php]をご覧ください。

*北海道大学理学院生命理学専攻および生命科学院　発生進化学特論
**杉村薫（理研）
**2008年10月30日1限目2限目
**1. 個体発生における力学過程の概論
**2. 上皮形態形成を支える機械的な力の研究ー実験と理論を融合させて生物システムを理解する

*東京大学農学生命情報科学特論II（アグリバイオインフォマティクスセミナー）
**舟橋啓、小林徹也
**システムバイオロジーの最前線：定量生物学から計算生物学まで
**10/23(木):15:00-18:45
**農学部２号館２階第１講義室（化１）
**http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/main_seminar.html

SpeakersandAbstracts

2015-11-11T07:47:58Z

Akkimura: /* Session: Quantity - SYMMETRY II - */

==Speakers and Abstracts==
We have brought together researchers who have the potential to take the lead in quantitative biology as next-generation leaders. 
次世代のリーダーとして定量生物学を牽引していくポテンシャルを有する研究者が揃っています。大御所を並べただけではない、定量生物学の会ならではの講演者のラインナップになっております。

==Session: Quantity - FORCE -==
Date and Time: Jan. 9th 13:10-15:25 

===[http://me.ucsb.edu/people/otger-campas '''Otger Campàs'''] ( University of California, Santa Barbara, USA )===
'''油滴を利用して、生体組織の力学を"その場で"測る。''' 

'''Quantifying tissue mechanics in vivo and in situ''' 
abstract: 
Selected refs: Campàs et al. Nat. Methods (2014); Campàs et al. BPJ (2012); Campàs et al. PNAS (2010)

===[http://www.koolau.info/ '''Kaoru Sugimura'''] ( Kyoto University, Japan )===
'''ベイズ統計学をつかって、見えない力を見る。アクチン結合タンパク質の力生成能と力感知能に注目して、形態形成の力学制御の分子メカニズムに迫る。''' 

'''Quantifying epithelial tissue morphogenesis: from F-actin regulation to cell kinematics and tissue stress''' 
abstract: 
Selected refs: Guirao et al. eLife, in press; Sugimura and Ishihara. Development (2013); Ishihara and Sugimura. J. Theor. Biol. (2012)

===[http://umr168.curie.fr/en/profile/emmanuel-farge-00906 '''Emmanuel Farge'''] ( Institut Curie, France )===
'''原腸形成過程は進化的に広くみられるが、コアとなる誘導シグナルははっきりしていなかった。それがなんと機械的応力である可能性が示された。''' 

'''From mesoderm mechanotransductive evolutionary origins to tumourogenic mechanical induction''' 
abstract: 
Selected refs: Fernández-Sánchez et al. Nature (2015); Brunet et al. Nat. Commun. (2013); Farge. Curr. Biol. (2003)

==Session: Quantity - SYMMETRY I -==
Date and Time: Jan. 10th 9:00-12:00 

===[http://fun.bio.keio.ac.jp/people/ '''Noriko Hiroi'''] ( Keio University, Japan )===
 

'''Anisotropy shaped by and for the dynamic distribution of heat''' 
abstract: 
Selected refs: Sumiyoshi et al. Front Physiol. (2015); Hiroi et al. Front Physiol. (2014)

===[http://www.imcb.a-star.edu.sg/php/np.php '''Nicolas D Plachta'''] ( IMCB, Singapore )===
'''マウス初期胚の対称性の破れに定量イメージングで迫る''' 

'''Seeing how mammalian life starts: Quantitative imaging in live mouse embryos''' 
abstract: 
Selected refs: Samarage et al. Dev. Cell (2015); Fierro-González et al. Nat. Cell Biol. (2013); Plachta et al. Nat. Cell Biol. (2011)

===[http://www.yusukeman.org/YM/youkoso.html '''Yusuke Maeda'''] ( Kyushu University, Japan )===
'''構成的手法から探る生命システムの構築原理：生命の起源と人工細胞のダイナミクス''' 

title: tba 
abstract: 
Selected refs: Fukuyama et al. Langmuir (2015); Maeda et al. PNAS (2012); Maeda et al. PRL (2011)

===[http://www.chimie.ens.fr/?q=en/umr-8640/biophysical-chemistry/profil/zoher.gueroui '''Zoher Gueroui'''] ( École Normale Supérieure, France )===
'''マグネトジェネティクス：情報流れの時空間制御が明らかにする自己組織化の原理''' 

title:tba 
abstract: 
Selected refs: Hoffmann et al. Nat. Nanotech. (2013); Pinot et al. PNAS (2012).

==Session: Quantity - SYMMETRY II -==
Date and Time: Jan. 10th 13:30-15:45 

===[http://www.princeton.edu/cbe/people/faculty/brangwynne/ '''Cliff Brangwynne'''] ( Princeton University, USA )===
'''Cliff Brangwynne博士は物理学の視点から細胞生物学に新しいコンセプトを導入し、近年、大きなインパクトを与えて続けている新進気鋭の研究者です。「相転移/phase transition」は、例えば水分子が沸点や融点をまたぐと固体、液体、気体と急激に状態を変化させるような物理学のコンセプトです。Brangwynne博士は、細胞内で核小体や生殖顆粒が形成・消滅する過程を、この相転移現象として理解できることを明らかにしています。''' 

title: tba 
abstract: 
selected refs: Berry et al. PNAS (2015); Feric and Brangwynne. Nat. Cell Biol. (2013); Brangwynne et al. Science (2009)

===[http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/cell_archi_home.html '''Akatsuki Kimura'''] ( National Insititute of Genetics, Japan )===
'''多数の小さな分子たちによってどのように細胞レベルでの空間的な秩序ができるのかを研究しています。本発表では、線虫C. elegansの細胞質流動を例に、流れの方向が定まらない（不安定）流動が、必ず（安定的に）生じるメカニズムについて発表します。''' 

title: '''How a cell-wide cytoplasmic flow with unstable direction emerges reproducibly?''' 
abstract: 
selected refs: Kimura and Kimura. J. Cell Sci. (2012); Niwayama et al. PNAS (2011); Kimura and Kimura. PNAS (2011)

===[http://www.kcl.ac.uk/lsm/research/divisions/randall/research/sections/motility/stramer/stramerbrian.aspx '''Brian Stramer'''] ( King's College London, UK )===
'''細胞のミクロとマクロを定量的 in vivo イメージングでつなぐ：細胞内アクチン動態・張力から細胞の巨視的挙動へ''' 

'''Intercellular forces orchestrate contact inhibition of locomotion''' 
abstract: 
Selected refs: Davis et al. Cell (2015); Davis et al. Development (2012); Stramer et al. J. Cell Biol. (2010)

==Session: Quantity - INFORMATION -==
Date and Time: Jan. 10th 16:00-19:00 

===[http://sawailab.c.u-tokyo.ac.jp/# '''Satoshi Sawai'''] ( the University of Tokyo, Japan )===
 

title: tba 
abstract: 
Selected refs: Nakajima et al. Nat. Commun. (2014); Taniguchi et al. PNAS (2013); Gregor et al. Science (2010)

===[http://clarklab.yale.edu/ '''Damon Clark'''] ( Yale University, USA )===
'''ショウジョウバエの視覚神経回路：動きを読みだす情報処理に迫る定量生物学''' 

'''Dissecting neural circuits for motion estimation in Drosophila''' 
abstract: 
Selected refs: Fitzgerald and Clark. eLife (2015); Clark et al. Nat. Neurosci. (2014); Clark et al. Neuron (2011);

===[http://elegans.bio.nagoya-u.ac.jp/~tsukada/ '''Yuki Tsukada'''] ( Nagoya University, Japan )===
'''定量と再構築から理解する感覚神経細胞の環境認識''' 

'''Quantification and reconstruction of thermosensory neuronal processing in C. elegans''' 
abstract: 
Selected refs:

===[http://engineering.purdue.edu/ABE/People/ptProfile?resource_id=46484 '''David Umulis'''] ( Purdue University, USA ) ===
'''勾配情報が作り出す発生メカニズム''' 

'''Quantification and modeling of BMP signaling during zebrafish embryo development''' 
abstract: 
Selected refs: Pargett et al. PLoS Comp. Biol. (2014); Peluso et al. Dev. Cell (2011); Umulis et al. Dev. Cell (2010)

==Session: Quantities and Beyond -==
Date and Time: Jan. 11th 9:00-11:00 

===[http://www.biol.s.u-tokyo.ac.jp/users/hassei/English/ '''Naoki Irie''']( the University of Tokto, Japan )===
'''胚発生と進化の法則性として近年支持された砂時計モデル。この法則性を生み出すメカニズムの有力候補がみえてきた。''' 

'''Double bladed aspect of gene recruitment to morphological evolution.''' 
abstract: 
Selected refs: Wang et al. Nat. Genetics (2013); Irie and Kuratani. Nat. Commun. (2011)

===[http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/wakamoto-lab/Member_e.html '''Yuichi Wakamoto'''] ( the University of Tokyo, Japan )===
'''1細胞ヒストリーの観点から適応度と遺伝子発現を捉え直す''' 

'''Fitness and gene expression from the viewpoint of single-cell histories''' 
abstract: 
Selected refs: Wakamoto et al. Science (2013); Wakamoto et al. Evolution (2012); Tomita et al. Langmuir (2011)

===[http://research-en.crmind.net/ '''Tetsuya J Kobayashi''']( the University of Tokyo, Japan )===
'''「量」をつなぐ：情報から適応度まで''' 

'''Linking quantities from information to fitness''' 
abstract: 
Selected refs: Kobayashi and Sughiyama. PRL (2015); Kobayashi. PRL (2011); Kobayashi. PRL (2010)
 
 
 

[http://q-bio.jp/wiki/IIS_Sympo Tokyo Symposium: Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems] 
[http://symposium.crmind.net/bridging_thr_exp/Home.html NIG International Symposium 2016 satellite workshop] 
[http://symposium.crmind.net/EIC2015/Home.html Toyota Physical & Chemical Research Institute Workshop] 
[http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/nigsymposium2016/MishimaSympo.html Mishima Symposium: Quantitative Biology - force, information and dynamics]

SpeakersandAbstracts

2015-11-11T07:42:30Z

Akkimura: /* Cliff Brangwynne ( Princeton University, USA ) */

==Speakers and Abstracts==
We have brought together researchers who have the potential to take the lead in quantitative biology as next-generation leaders. 
次世代のリーダーとして定量生物学を牽引していくポテンシャルを有する研究者が揃っています。大御所を並べただけではない、定量生物学の会ならではの講演者のラインナップになっております。

==Session: Quantity - FORCE -==
Date and Time: Jan. 9th 13:10-15:25 

===[http://me.ucsb.edu/people/otger-campas '''Otger Campàs'''] ( University of California, Santa Barbara, USA )===
'''油滴を利用して、生体組織の力学を"その場で"測る。''' 

'''Quantifying tissue mechanics in vivo and in situ''' 
abstract: 
Selected refs: Campàs et al. Nat. Methods (2014); Campàs et al. BPJ (2012); Campàs et al. PNAS (2010)

===[http://www.koolau.info/ '''Kaoru Sugimura'''] ( Kyoto University, Japan )===
'''ベイズ統計学をつかって、見えない力を見る。アクチン結合タンパク質の力生成能と力感知能に注目して、形態形成の力学制御の分子メカニズムに迫る。''' 

'''Quantifying epithelial tissue morphogenesis: from F-actin regulation to cell kinematics and tissue stress''' 
abstract: 
Selected refs: Guirao et al. eLife, in press; Sugimura and Ishihara. Development (2013); Ishihara and Sugimura. J. Theor. Biol. (2012)

===[http://umr168.curie.fr/en/profile/emmanuel-farge-00906 '''Emmanuel Farge'''] ( Institut Curie, France )===
'''原腸形成過程は進化的に広くみられるが、コアとなる誘導シグナルははっきりしていなかった。それがなんと機械的応力である可能性が示された。''' 

'''From mesoderm mechanotransductive evolutionary origins to tumourogenic mechanical induction''' 
abstract: 
Selected refs: Fernández-Sánchez et al. Nature (2015); Brunet et al. Nat. Commun. (2013); Farge. Curr. Biol. (2003)

==Session: Quantity - SYMMETRY I -==
Date and Time: Jan. 10th 9:00-12:00 

===[http://fun.bio.keio.ac.jp/people/ '''Noriko Hiroi'''] ( Keio University, Japan )===
 

'''Anisotropy shaped by and for the dynamic distribution of heat''' 
abstract: 
Selected refs: Sumiyoshi et al. Front Physiol. (2015); Hiroi et al. Front Physiol. (2014)

===[http://www.imcb.a-star.edu.sg/php/np.php '''Nicolas D Plachta'''] ( IMCB, Singapore )===
'''マウス初期胚の対称性の破れに定量イメージングで迫る''' 

'''Seeing how mammalian life starts: Quantitative imaging in live mouse embryos''' 
abstract: 
Selected refs: Samarage et al. Dev. Cell (2015); Fierro-González et al. Nat. Cell Biol. (2013); Plachta et al. Nat. Cell Biol. (2011)

===[http://www.yusukeman.org/YM/youkoso.html '''Yusuke Maeda'''] ( Kyushu University, Japan )===
'''構成的手法から探る生命システムの構築原理：生命の起源と人工細胞のダイナミクス''' 

title: tba 
abstract: 
Selected refs: Fukuyama et al. Langmuir (2015); Maeda et al. PNAS (2012); Maeda et al. PRL (2011)

===[http://www.chimie.ens.fr/?q=en/umr-8640/biophysical-chemistry/profil/zoher.gueroui '''Zoher Gueroui'''] ( École Normale Supérieure, France )===
'''マグネトジェネティクス：情報流れの時空間制御が明らかにする自己組織化の原理''' 

title:tba 
abstract: 
Selected refs: Hoffmann et al. Nat. Nanotech. (2013); Pinot et al. PNAS (2012).

==Session: Quantity - SYMMETRY II -==
Date and Time: Jan. 10th 13:30-15:45 

===[http://www.princeton.edu/cbe/people/faculty/brangwynne/ '''Cliff Brangwynne'''] ( Princeton University, USA )===
'''Cliff Brangwynne博士は物理学の視点から細胞生物学に新しいコンセプトを導入し、近年、大きなインパクトを与えて続けている新進気鋭の研究者です。「相転移/phase transition」は、例えば水分子が沸点や融点をまたぐと固体、液体、気体と急激に状態を変化させるような物理学のコンセプトです。Brangwynne博士は、細胞内で核小体や生殖顆粒が形成・消滅する過程を、この相転移現象として理解できることを明らかにしています。''' 

title: tba 
abstract: 
selected refs: Berry et al. PNAS (2015); Feric and Brangwynne. Nat. Cell Biol. (2013); Brangwynne et al. Science (2009)

===[http://www.kcl.ac.uk/lsm/research/divisions/randall/research/sections/motility/stramer/stramerbrian.aspx '''Brian Stramer'''] ( King's College London, UK )===
'''細胞のミクロとマクロを定量的 in vivo イメージングでつなぐ：細胞内アクチン動態・張力から細胞の巨視的挙動へ''' 

'''Intercellular forces orchestrate contact inhibition of locomotion''' 
abstract: 
Selected refs: Davis et al. Cell (2015); Davis et al. Development (2012); Stramer et al. J. Cell Biol. (2010)

==Session: Quantity - INFORMATION -==
Date and Time: Jan. 10th 16:00-19:00 

===[http://sawailab.c.u-tokyo.ac.jp/# '''Satoshi Sawai'''] ( the University of Tokyo, Japan )===
 

title: tba 
abstract: 
Selected refs: Nakajima et al. Nat. Commun. (2014); Taniguchi et al. PNAS (2013); Gregor et al. Science (2010)

===[http://clarklab.yale.edu/ '''Damon Clark'''] ( Yale University, USA )===
'''ショウジョウバエの視覚神経回路：動きを読みだす情報処理に迫る定量生物学''' 

'''Dissecting neural circuits for motion estimation in Drosophila''' 
abstract: 
Selected refs: Fitzgerald and Clark. eLife (2015); Clark et al. Nat. Neurosci. (2014); Clark et al. Neuron (2011);

===[http://elegans.bio.nagoya-u.ac.jp/~tsukada/ '''Yuki Tsukada'''] ( Nagoya University, Japan )===
'''定量と再構築から理解する感覚神経細胞の環境認識''' 

'''Quantification and reconstruction of thermosensory neuronal processing in C. elegans''' 
abstract: 
Selected refs:

===[http://engineering.purdue.edu/ABE/People/ptProfile?resource_id=46484 '''David Umulis'''] ( Purdue University, USA ) ===
'''勾配情報が作り出す発生メカニズム''' 

'''Quantification and modeling of BMP signaling during zebrafish embryo development''' 
abstract: 
Selected refs: Pargett et al. PLoS Comp. Biol. (2014); Peluso et al. Dev. Cell (2011); Umulis et al. Dev. Cell (2010)

==Session: Quantities and Beyond -==
Date and Time: Jan. 11th 9:00-11:00 

===[http://www.biol.s.u-tokyo.ac.jp/users/hassei/English/ '''Naoki Irie''']( the University of Tokto, Japan )===
'''胚発生と進化の法則性として近年支持された砂時計モデル。この法則性を生み出すメカニズムの有力候補がみえてきた。''' 

'''Double bladed aspect of gene recruitment to morphological evolution.''' 
abstract: 
Selected refs: Wang et al. Nat. Genetics (2013); Irie and Kuratani. Nat. Commun. (2011)

===[http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/wakamoto-lab/Member_e.html '''Yuichi Wakamoto'''] ( the University of Tokyo, Japan )===
'''1細胞ヒストリーの観点から適応度と遺伝子発現を捉え直す''' 

'''Fitness and gene expression from the viewpoint of single-cell histories''' 
abstract: 
Selected refs: Wakamoto et al. Science (2013); Wakamoto et al. Evolution (2012); Tomita et al. Langmuir (2011)

===[http://research-en.crmind.net/ '''Tetsuya J Kobayashi''']( the University of Tokyo, Japan )===
'''「量」をつなぐ：情報から適応度まで''' 

'''Linking quantities from information to fitness''' 
abstract: 
Selected refs: Kobayashi and Sughiyama. PRL (2015); Kobayashi. PRL (2011); Kobayashi. PRL (2010)
 
 
 

[http://q-bio.jp/wiki/IIS_Sympo Tokyo Symposium: Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems] 
[http://symposium.crmind.net/bridging_thr_exp/Home.html NIG International Symposium 2016 satellite workshop] 
[http://symposium.crmind.net/EIC2015/Home.html Toyota Physical & Chemical Research Institute Workshop] 
[http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/nigsymposium2016/MishimaSympo.html Mishima Symposium: Quantitative Biology - force, information and dynamics]

SpeakersandAbstracts

2015-11-11T07:40:00Z

Akkimura: /* Akatsuki Kimura ( National Insititute of Genetics, Japan ) */

==Speakers and Abstracts==
We have brought together researchers who have the potential to take the lead in quantitative biology as next-generation leaders. 
次世代のリーダーとして定量生物学を牽引していくポテンシャルを有する研究者が揃っています。大御所を並べただけではない、定量生物学の会ならではの講演者のラインナップになっております。

==Session: Quantity - FORCE -==
Date and Time: Jan. 9th 13:10-15:25 

===[http://me.ucsb.edu/people/otger-campas '''Otger Campàs'''] ( University of California, Santa Barbara, USA )===
'''油滴を利用して、生体組織の力学を"その場で"測る。''' 

'''Quantifying tissue mechanics in vivo and in situ''' 
abstract: 
Selected refs: Campàs et al. Nat. Methods (2014); Campàs et al. BPJ (2012); Campàs et al. PNAS (2010)

===[http://www.koolau.info/ '''Kaoru Sugimura'''] ( Kyoto University, Japan )===
'''ベイズ統計学をつかって、見えない力を見る。アクチン結合タンパク質の力生成能と力感知能に注目して、形態形成の力学制御の分子メカニズムに迫る。''' 

'''Quantifying epithelial tissue morphogenesis: from F-actin regulation to cell kinematics and tissue stress''' 
abstract: 
Selected refs: Guirao et al. eLife, in press; Sugimura and Ishihara. Development (2013); Ishihara and Sugimura. J. Theor. Biol. (2012)

===[http://umr168.curie.fr/en/profile/emmanuel-farge-00906 '''Emmanuel Farge'''] ( Institut Curie, France )===
'''原腸形成過程は進化的に広くみられるが、コアとなる誘導シグナルははっきりしていなかった。それがなんと機械的応力である可能性が示された。''' 

'''From mesoderm mechanotransductive evolutionary origins to tumourogenic mechanical induction''' 
abstract: 
Selected refs: Fernández-Sánchez et al. Nature (2015); Brunet et al. Nat. Commun. (2013); Farge. Curr. Biol. (2003)

==Session: Quantity - SYMMETRY I -==
Date and Time: Jan. 10th 9:00-12:00 

===[http://fun.bio.keio.ac.jp/people/ '''Noriko Hiroi'''] ( Keio University, Japan )===
 

'''Anisotropy shaped by and for the dynamic distribution of heat''' 
abstract: 
Selected refs: Sumiyoshi et al. Front Physiol. (2015); Hiroi et al. Front Physiol. (2014)

===[http://www.imcb.a-star.edu.sg/php/np.php '''Nicolas D Plachta'''] ( IMCB, Singapore )===
'''マウス初期胚の対称性の破れに定量イメージングで迫る''' 

'''Seeing how mammalian life starts: Quantitative imaging in live mouse embryos''' 
abstract: 
Selected refs: Samarage et al. Dev. Cell (2015); Fierro-González et al. Nat. Cell Biol. (2013); Plachta et al. Nat. Cell Biol. (2011)

===[http://www.yusukeman.org/YM/youkoso.html '''Yusuke Maeda'''] ( Kyushu University, Japan )===
'''構成的手法から探る生命システムの構築原理：生命の起源と人工細胞のダイナミクス''' 

title: tba 
abstract: 
Selected refs: Fukuyama et al. Langmuir (2015); Maeda et al. PNAS (2012); Maeda et al. PRL (2011)

===[http://www.chimie.ens.fr/?q=en/umr-8640/biophysical-chemistry/profil/zoher.gueroui '''Zoher Gueroui'''] ( École Normale Supérieure, France )===
'''マグネトジェネティクス：情報流れの時空間制御が明らかにする自己組織化の原理''' 

title:tba 
abstract: 
Selected refs: Hoffmann et al. Nat. Nanotech. (2013); Pinot et al. PNAS (2012).

==Session: Quantity - SYMMETRY II -==
Date and Time: Jan. 10th 13:30-15:45 

===[http://www.princeton.edu/cbe/people/faculty/brangwynne/ '''Cliff Brangwynne'''] ( Princeton University, USA )===
'''Cliff Brangwynne博士は物理学の視点から細胞生物学に新しいコンセプトを導入し、近年、大きなインパクトを与えて続けている新進気鋭の研究者です。「相転移/phase transition」は、例えば水分子が沸点や融点をまたぐと固体、液体、気体と急激に状態を変化させるような物理学のコンセプトです。Brangwynne博士は、細胞内で核小体や生殖顆粒が形成・消滅する過程を、この相転移現象として理解できることを明らかにしています。''' 

title: tba 
abstract: 
selected refs: Berry et al. PNAS (2015); Feric and Brangwynne. Nat. Cell Biol. (2013); Brangwynne et al. Science (2009)

===[http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/cell_archi_home.html '''Akatsuki Kimura'''] ( National Insititute of Genetics, Japan )==='''多数の小さな分子たちによってどのように細胞レベルでの空間的な秩序ができるのかを研究しています。本発表では、線虫C. elegansの細胞質流動を例に、流れの方向が定まらない（不安定）流動が、必ず（安定的に）生じるメカニズムについて発表します。''' 

title: '''How a cell-wide cytoplasmic flow with unstable direction emerges reproducibly?''' 
abstract: 
Selected refs: Kimura and Kimura. J. Cell Sci. (2012); Niwayama et al. PNAS (2011); Kimura and Kimura. PNAS (2011)

===[http://www.kcl.ac.uk/lsm/research/divisions/randall/research/sections/motility/stramer/stramerbrian.aspx '''Brian Stramer'''] ( King's College London, UK )===
'''細胞のミクロとマクロを定量的 in vivo イメージングでつなぐ：細胞内アクチン動態・張力から細胞の巨視的挙動へ''' 

'''Intercellular forces orchestrate contact inhibition of locomotion''' 
abstract: 
Selected refs: Davis et al. Cell (2015); Davis et al. Development (2012); Stramer et al. J. Cell Biol. (2010)

==Session: Quantity - INFORMATION -==
Date and Time: Jan. 10th 16:00-19:00 

===[http://sawailab.c.u-tokyo.ac.jp/# '''Satoshi Sawai'''] ( the University of Tokyo, Japan )===
 

title: tba 
abstract: 
Selected refs: Nakajima et al. Nat. Commun. (2014); Taniguchi et al. PNAS (2013); Gregor et al. Science (2010)

===[http://clarklab.yale.edu/ '''Damon Clark'''] ( Yale University, USA )===
'''ショウジョウバエの視覚神経回路：動きを読みだす情報処理に迫る定量生物学''' 

'''Dissecting neural circuits for motion estimation in Drosophila''' 
abstract: 
Selected refs: Fitzgerald and Clark. eLife (2015); Clark et al. Nat. Neurosci. (2014); Clark et al. Neuron (2011);

===[http://elegans.bio.nagoya-u.ac.jp/~tsukada/ '''Yuki Tsukada'''] ( Nagoya University, Japan )===
'''定量と再構築から理解する感覚神経細胞の環境認識''' 

'''Quantification and reconstruction of thermosensory neuronal processing in C. elegans''' 
abstract: 
Selected refs:

===[http://engineering.purdue.edu/ABE/People/ptProfile?resource_id=46484 '''David Umulis'''] ( Purdue University, USA ) ===
'''勾配情報が作り出す発生メカニズム''' 

'''Quantification and modeling of BMP signaling during zebrafish embryo development''' 
abstract: 
Selected refs: Pargett et al. PLoS Comp. Biol. (2014); Peluso et al. Dev. Cell (2011); Umulis et al. Dev. Cell (2010)

==Session: Quantities and Beyond -==
Date and Time: Jan. 11th 9:00-11:00 

===[http://www.biol.s.u-tokyo.ac.jp/users/hassei/English/ '''Naoki Irie''']( the University of Tokto, Japan )===
'''胚発生と進化の法則性として近年支持された砂時計モデル。この法則性を生み出すメカニズムの有力候補がみえてきた。''' 

'''Double bladed aspect of gene recruitment to morphological evolution.''' 
abstract: 
Selected refs: Wang et al. Nat. Genetics (2013); Irie and Kuratani. Nat. Commun. (2011)

===[http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/wakamoto-lab/Member_e.html '''Yuichi Wakamoto'''] ( the University of Tokyo, Japan )===
'''1細胞ヒストリーの観点から適応度と遺伝子発現を捉え直す''' 

'''Fitness and gene expression from the viewpoint of single-cell histories''' 
abstract: 
Selected refs: Wakamoto et al. Science (2013); Wakamoto et al. Evolution (2012); Tomita et al. Langmuir (2011)

===[http://research-en.crmind.net/ '''Tetsuya J Kobayashi''']( the University of Tokyo, Japan )===
'''「量」をつなぐ：情報から適応度まで''' 

'''Linking quantities from information to fitness''' 
abstract: 
Selected refs: Kobayashi and Sughiyama. PRL (2015); Kobayashi. PRL (2011); Kobayashi. PRL (2010)
 
 
 

[http://q-bio.jp/wiki/IIS_Sympo Tokyo Symposium: Force, Information and Dynamics: X factors shaping living systems] 
[http://symposium.crmind.net/bridging_thr_exp/Home.html NIG International Symposium 2016 satellite workshop] 
[http://symposium.crmind.net/EIC2015/Home.html Toyota Physical & Chemical Research Institute Workshop] 
[http://www.nig.ac.jp/labs/CelArchi/nigsymposium2016/MishimaSympo.html Mishima Symposium: Quantitative Biology - force, information and dynamics]

About us

2010-11-14T04:58:15Z

Akkimura: /* 会の活動 */

== 定量生物学の会の概要 ==
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　[[English| go to English page]]
=== 背景 ===
現在、生命科学の多数の領域において、定量的なアプローチを導入した研究が分子生物学を補完する1つの方向性として浮上しつつあり、すでに萌芽的な研究例が報告されています。

「定量生物学の会」はこのような背景のもと、各領域において自ら手を動かして定量的な生命科学を模索している若手研究者により2回の準備会を経て立ち上げられた研究グループです。

[http://www.q-bio.jp/wiki/English#Background_of_the_foundation Background of the foundation (English)]

=== 会の目的 ===
本研究会は定量的な生命科学の方向性・問題点などを具体的に議論し、領域横断的な研究体制や連携関係をトップダウン的にではなく、最前線の研究を担う若手研究者（学生、PD、若手PI）によってボトムアップ的に模索することを目的としています。

[http://www.q-bio.jp/wiki/English#The_Aim_of_the_Q-BioJP The Aim of the Q-BioJP (English)]

=== 会の活動 ===
メーリングリストによる情報交換（参加はコアメンバーによる紹介制）と、以下に述べます2つの目的の異なる研究会の開催を行っています。

1つ目は「'''年会'''」と呼ばれる会です。定量的な生命科学研究に携わる・もしくは携わりたいと考えている研究者どうしが集まって相互に情報を発信することで、技術的な問題の解決方法や今後の研究の方向性などを模索することを目指します。

2つ目は「'''キャラバン'''」と呼ばれる会です。（主に）定量生物学に携わっていないが興味を抱いている研究者に向けて、定量的な生命科学研究の重要性や成果を発信する会です。2009年3月に初回のキャラバンを「遺伝研」で開催しました。今後も、様々な研究機関で開催したいと考えています。

[http://www.q-bio.jp/wiki/English#Agenda Agenda (English)]

=== コアメンバー・世話人===
*[[コアメンバー世話人一覧|コアメンバー・世話人の一覧]]
*[http://www.q-bio.jp/wiki/English#Core_members Core members]

=== 研究会のウェブサイト ===
　　URL: http://q-bio.jp/
 
　　URL (English page): http://q-bio.jp/wiki/English

=== 研究会の問い合わせ先 ===
連絡先：q.biology at gmail.com
（迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください）

== 我々が考える定量生物学　2008 ==
定量的なデータ解析は生命科学の様々な分野において行われており、すべてを本研究会で網羅することは現実的でないと考えています。そこで、あくまで本研究会が対象に設定している定量生物学であることを明示するために、「我々が考える定量生物学」というタイトルにしました。また、「我々が考える定量生物学」も未成熟であり、今後色々な人と議論を交わす過程で変わっていくと思います。変わっていく過程、外部からの意見を取り入れる姿勢を示すという意味で、各年度ごとに定義を更新していくのもおもしろいかと考えました。そのため２００８という日付を入れてあります。

=== なぜ定量生物学が再び注目されてきているのか？===
定量的な生命科学が注目されてきている背景として、イメージングなどの光学技術、MEMSなどの工学技術の発展に伴い、より解像度の高い時空間情報を得られるようになったことが挙げられます。また、実験・解析技術の異分野間交流が進み、それにともなって優れた定量解析から生命システムの原理に迫る研究が分野を超えて認識されるようになってきたことも背景の一つに挙げられます。

例えば主に分子生物学的手法を用いてきた細胞生物学や発生生物学では、バイオイメージングなどの発展によりこれまで見過ごされてきた、あるいは解析できなかった分子レベル、細胞レベルの現象を詳細に可視化できるようになりました。それにともない、現象を定量的に解析すること、そしてそのための数理、実験手法の必要性が認識されるようになってきました。このような流れは、定量的な解析が分子生物学成立直後までは活発に行われていたことを考えると、ルネッサンス的な意味を持っていると考えられます。

一方で生物物理学においては、バイオイメージングなどを駆使した定量的な解析は継続的に行われてきましたが、逆にスクリーニングなどの分子生物学的な研究はあまり集中的に行われてきませんでした。しかし最近、生物物理学の方法論と分子生物学の方法論の双方を使いこなす若手研究者が現れ、融合的な研究の機運が高まってきています。また、これまでタンパク質構造などの分子レベルの現象と比較して比重が低かった細胞レベルの現象や個体発生に挑む研究者も増加傾向にあり、細胞や組織のスケールにおける定量的な研究が顕在化してきているという背景もあります。

さらに、理論系研究においては、利用可能な定量的な実験データが限られていた時代の理論生物学のスタイルから脱却した、定量的な実験データの存在を前提とする現代的な理論生物学が求められています。またインフォマティクスでは、分子生物学の発展に立脚したオミクス情報を対象とした研究だけでなく、オミクス情報ほど網羅的ではないがより定量性の高いデータという新しい種類の情報を対象としたインフォマティクスの可能性を探る試みがなされてきています。

このように定量生物学は、生命科学の様々な分野における新しい流れが結びついた異分野融合の交差点に位置していると考えられます。そして「定量生物学の会」は、定量的な生命科学に挑戦する様々な分野の若手研究者が、その技術や知見を交換をする場としての役割を担っていきたいと考えています。しかし研究会としては、'''定量的な研究はあくまで手段であって、我々の最終的な目的はこれまで明らかにされていない生命現象の謎を解くことにある'''と考えています。

[http://www.q-bio.jp/wiki/English#Background_of_the_foundation Background of the foundation (English)]
 
[http://www.q-bio.jp/wiki/English#The_Aim_of_the_Q-BioJP The Aim of the Q-BioJP (English)]

=== 我々が現在想定している定量生物学の研究対象 ===
定量的なデータ解析は生命科学の様々な分野において行われており、そのすべてを本研究会で網羅することは現実的でないと考えています。本研究会が現時点でターゲットとしている研究は、まず過去に定量的な方法論を使っていたにもかかわらず、分子生物学による定性分析の台頭によって、定量的な思考や方法論が衰退してしまった分野です。例えば発生学はこのような分野の１例であると考えられます。このような分野では定量的な思考や手法が遅れている分、それらを導入することにより生命現象の理解が格段に進む可能性があります。

他方で、生物物理学における細胞ダイナミクスの解析など、定量的な解析手法の適用範囲を多階層のスケールを横断する形で拡張する境界領域分野も主要な対象とします。解析対象は分子から個体までを含みますが、特に細胞・組織の階層を含む研究を中心に据えます。分子、個体においては、それぞれ、より高次・低次の現象との関係を意識したものに積極的に取り組み、分子と分子内部分構造などは重点的には扱いません。

さらに、理論系研究においてはアイディア・モデルのみに動機づけられた研究よりも、定量的なデータや知見を積極的に取り入れた理論を模索する研究を現時点では想定しています。また、画像データから定量性の高い時空間情報を抽出することが現在の定量生物学におけるデータ生産のボトルネックになっていることから、画像解析を中心としたインフォマティクスの研究も歓迎します。

神経科学は伝統的に定量性を意識した研究がなされてきた分野でありますが、すでに電気生理データなどの定量的な解析手法が比較的成熟しているため、現時点では対象に含めていません。ただし、神経科学と他分野を定量的な解析手法でつなぐ横断的研究（成長円錐の走性・神経細胞内の１分子計測・神経発生）などは対象に含めます。

また、マイクロアレイなどの網羅的な解析を中心とした研究も現時点では対象に含めていません。ただし、網羅的な解析を発展させ、高い定量性持たせることを追求するような研究については対象に含めます。

[http://www.q-bio.jp/wiki/English#Targeting_Subject Trageting Subgect (English)]

第三回年会セッション3

2010-11-02T01:03:19Z

Akkimura: /* 第三回年会（セッション3）大規模情報の定量生物学 */

==第三回年会（セッション3）大規模情報の定量生物学 ==
講演者: 斉藤典子（熊大）、二階堂愛（理研CDB）

===日時===
2010/11/28 10:00-11:00 セッション３

=== Chair===
*木村　暁（遺伝研）

=== 概要 ===

===細胞形態の定量解析と分類===
*○斉藤典子、徳永和明、＊村瀬八重子、＊小林民代、＊坂内誠、中尾光善（熊本大・発生医学研究所・細胞医学、＊オリンパス株式会社）　
 
細胞核内は遺伝子の転写、複製、RNAのプロセッシングなど生命活動に重要な事象が複雑な制御を受けながら起こるため、高度に組織化され、染色体間領域に様々な核内構造体が存在する。発生・分化の各過程や各種の疾患において、遺伝子の発現プロファイルがグローバルに変換するとともに、染色体を含めた核内構造がダイナミックに変動する。細胞核の形態は細胞状態を評価する指標として優れており、例えば、癌細胞における核構造異常（核異型）は病理学的な診断に広く用いられている。これらの形態を数値化し、客観的な評価基準を確立することは、生命科学の基礎研究および臨床医学において有益と考えられる。そこで我々は細胞核の形状をコンピュータプログラム（Olympus CELAVIEW RS100）に自動認識させて測定、計測する“モデルベースド”な方法と、多目的パターン認識ソフトウエア（WND-CHARM）を用いて機械視覚･学習を経て形態の類似度を計測し、細胞の状態を自動分類･評価する、“モデルフリーシステム”のふたつの異なるアプローチを確立することを目指している。現在までに我々は動物培養細胞系を用いて、正常細胞群および異常細胞群の核内構造体（核スペックル、カハールボディ、PMLボディ）や核膜の形態の数値化を行った。siRNA処理を施した細胞に、蛍光免疫染色を施し、イメージングサイトメータ（Olympus Celaview RS100）で画像を多量取得し、多因子画像解析計算法を施行することにより、各構造体の形態的特徴を自動検出・計測し、個々の細胞または細胞集団における核内構造を定量的に評価した。これらに加え、がん疾患組織を含む様々な細胞形態の類似度を定量的に評価し、診断補助技術などへの応用の可能性を見出した。

 
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[http://q-bio.jp/wiki/定量生物学の会_第三回年会_(2010/11)#.E3.82.BB.E3.83.83.E3.82.B7.E3.83.A7.E3.83.B3.EF.BC.8811.E6.9C.8827.E6.97.A5.E3.80.8128.E6.97.A5.E9.96.8B.E5.82.AC.EF.BC.89 第三回年会セッションへ]

===次世代シーケンサーによる細胞分化に伴う転写制御ネットワーク再構成の包括的かつ定量的な測定===
*二階堂愛(理化学研究所発生・再生科学総合研究センター　機能ゲノミクスユニット)
 
我々のからだは約300種類の細胞からなる。これらの細胞はたったひとつの細胞に由来し、原則的にはすべて同じゲノム配列を持つ。均一な細胞から多様な細胞の個性を作り出すものはなにか、また、どのようにその個性を維持するのかを明らかにすることは、我々の体の成り立ち(発生)や維持(再生)を理解することに繋がるため、生命科学の重要な問題である。

近年、マイクロアレイや網羅的なcDNA配列決定などのオミックス技術により、細胞の性質を決める転写因子の同定が進んできた (例: iPS細胞)。これにより、細胞の状態は、数千の遺伝子を制御するわずか数種類の転写因子によって作り出せることが明らかになりつつある。これらの研究から明らかになったことの1つとして、「細胞状態の数だけ転写因子の種類が必要となるわけではない」ということがある。ある転写因子は、明らかに、さまざまな細胞状態で再利用されている。

ここで疑問となるのは、「同じ転写因子が異なる細胞状態をどのようにして作り出すのか」という点である。我々は、このような再利用される転写因子が、ほかの転写因子と協調して働くことで、細胞種依存的に、制御する遺伝子を切り替えたり、制御の方向(活性・抑制化)を変えたりすると考えた。この現象を「転写制御ネットワークの再構成(rewiring)」と呼ぶことにする。

ネットワークの再構成を定量的に測定するには、遺伝子の転写量を測定するマイクロアレイなどの技術では達成することは困難である。しかし、近年、高出力・高並列性を備えた次世代シーケンサーが登場し、免疫沈降法との技術的な統合により、特定の転写因子に限れば、包括的な転写因子結合領域を安価に高速に、そして定量的に、同定できるChIP-seq法が開発された。

本研究では、胚性幹細胞と栄養外胚葉細胞の両方で再利用される転写因子に注目し、分化の際にどのようにその転写因子がターゲットや活性を変えるかを捉えることを目的とした。まず胚性幹細胞から栄養外胚葉細胞へ分化する培養細胞系を用い、経時的にマイクロアレイとChIP-seqを行なった。この定量データから、この転写因子と協調的に働く細胞状態特異的な転写因子を同定した。さらに、転写因子結合が遺伝子発現に対し、活性的に働くのか、抑制的に働くのかを予測するために、転写因子のプロモータへの結合量がmRNAの転写量に与える影響について定量的なモデルを構築し、転写因子活性を予測した。これらの結果より、転写制御ネットワークの構造がダイナミックに再構築される様子を明らかにすることができた。

 
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第三回年会セッション3

2010-11-02T01:02:09Z

Akkimura: /* 第三回年会（セッション3）大規模情報の定量生物学 */

==第三回年会（セッション3）大規模情報の定量生物学 ==
===日時===
2010/11/28 10:00-11:00 セッション３

=== Chair===
*木村　暁（遺伝研）

=== 概要 ===

===細胞形態の定量解析と分類===
*○斉藤典子、徳永和明、＊村瀬八重子、＊小林民代、＊坂内誠、中尾光善（熊本大・発生医学研究所・細胞医学、＊オリンパス株式会社）　
 
細胞核内は遺伝子の転写、複製、RNAのプロセッシングなど生命活動に重要な事象が複雑な制御を受けながら起こるため、高度に組織化され、染色体間領域に様々な核内構造体が存在する。発生・分化の各過程や各種の疾患において、遺伝子の発現プロファイルがグローバルに変換するとともに、染色体を含めた核内構造がダイナミックに変動する。細胞核の形態は細胞状態を評価する指標として優れており、例えば、癌細胞における核構造異常（核異型）は病理学的な診断に広く用いられている。これらの形態を数値化し、客観的な評価基準を確立することは、生命科学の基礎研究および臨床医学において有益と考えられる。そこで我々は細胞核の形状をコンピュータプログラム（Olympus CELAVIEW RS100）に自動認識させて測定、計測する“モデルベースド”な方法と、多目的パターン認識ソフトウエア（WND-CHARM）を用いて機械視覚･学習を経て形態の類似度を計測し、細胞の状態を自動分類･評価する、“モデルフリーシステム”のふたつの異なるアプローチを確立することを目指している。現在までに我々は動物培養細胞系を用いて、正常細胞群および異常細胞群の核内構造体（核スペックル、カハールボディ、PMLボディ）や核膜の形態の数値化を行った。siRNA処理を施した細胞に、蛍光免疫染色を施し、イメージングサイトメータ（Olympus Celaview RS100）で画像を多量取得し、多因子画像解析計算法を施行することにより、各構造体の形態的特徴を自動検出・計測し、個々の細胞または細胞集団における核内構造を定量的に評価した。これらに加え、がん疾患組織を含む様々な細胞形態の類似度を定量的に評価し、診断補助技術などへの応用の可能性を見出した。

 
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===次世代シーケンサーによる細胞分化に伴う転写制御ネットワーク再構成の包括的かつ定量的な測定===
*二階堂愛(理化学研究所発生・再生科学総合研究センター　機能ゲノミクスユニット)
 
我々のからだは約300種類の細胞からなる。これらの細胞はたったひとつの細胞に由来し、原則的にはすべて同じゲノム配列を持つ。均一な細胞から多様な細胞の個性を作り出すものはなにか、また、どのようにその個性を維持するのかを明らかにすることは、我々の体の成り立ち(発生)や維持(再生)を理解することに繋がるため、生命科学の重要な問題である。

近年、マイクロアレイや網羅的なcDNA配列決定などのオミックス技術により、細胞の性質を決める転写因子の同定が進んできた (例: iPS細胞)。これにより、細胞の状態は、数千の遺伝子を制御するわずか数種類の転写因子によって作り出せることが明らかになりつつある。これらの研究から明らかになったことの1つとして、「細胞状態の数だけ転写因子の種類が必要となるわけではない」ということがある。ある転写因子は、明らかに、さまざまな細胞状態で再利用されている。

ここで疑問となるのは、「同じ転写因子が異なる細胞状態をどのようにして作り出すのか」という点である。我々は、このような再利用される転写因子が、ほかの転写因子と協調して働くことで、細胞種依存的に、制御する遺伝子を切り替えたり、制御の方向(活性・抑制化)を変えたりすると考えた。この現象を「転写制御ネットワークの再構成(rewiring)」と呼ぶことにする。

ネットワークの再構成を定量的に測定するには、遺伝子の転写量を測定するマイクロアレイなどの技術では達成することは困難である。しかし、近年、高出力・高並列性を備えた次世代シーケンサーが登場し、免疫沈降法との技術的な統合により、特定の転写因子に限れば、包括的な転写因子結合領域を安価に高速に、そして定量的に、同定できるChIP-seq法が開発された。

本研究では、胚性幹細胞と栄養外胚葉細胞の両方で再利用される転写因子に注目し、分化の際にどのようにその転写因子がターゲットや活性を変えるかを捉えることを目的とした。まず胚性幹細胞から栄養外胚葉細胞へ分化する培養細胞系を用い、経時的にマイクロアレイとChIP-seqを行なった。この定量データから、この転写因子と協調的に働く細胞状態特異的な転写因子を同定した。さらに、転写因子結合が遺伝子発現に対し、活性的に働くのか、抑制的に働くのかを予測するために、転写因子のプロモータへの結合量がmRNAの転写量に与える影響について定量的なモデルを構築し、転写因子活性を予測した。これらの結果より、転写制御ネットワークの構造がダイナミックに再構築される様子を明らかにすることができた。

 
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第三回年会セッション3

2010-11-01T16:04:08Z

Akkimura: /* 細胞形態の定量解析と分類 */

==第三回年会（セッション3）大規模情報の定量生物学 ==
===日時===
2010/11/28 セッション３

=== Chair===
*木村　暁（遺伝研）

=== 概要 ===

===細胞形態の定量解析と分類===
*○斉藤典子、徳永和明、＊村瀬八重子、＊小林民代、＊坂内誠、中尾光善（熊本大・発生医学研究所・細胞医学、＊オリンパス株式会社）　
 
細胞核内は遺伝子の転写、複製、RNAのプロセッシングなど生命活動に重要な事象が複雑な制御を受けながら起こるため、高度に組織化され、染色体間領域に様々な核内構造体が存在する。発生・分化の各過程や各種の疾患において、遺伝子の発現プロファイルがグローバルに変換するとともに、染色体を含めた核内構造がダイナミックに変動する。細胞核の形態は細胞状態を評価する指標として優れており、例えば、癌細胞における核構造異常（核異型）は病理学的な診断に広く用いられている。これらの形態を数値化し、客観的な評価基準を確立することは、生命科学の基礎研究および臨床医学において有益と考えられる。そこで我々は細胞核の形状をコンピュータプログラム（Olympus CELAVIEW RS100）に自動認識させて測定、計測する“モデルベースド”な方法と、多目的パターン認識ソフトウエア（WND-CHARM）を用いて機械視覚･学習を経て形態の類似度を計測し、細胞の状態を自動分類･評価する、“モデルフリーシステム”のふたつの異なるアプローチを確立することを目指している。現在までに我々は動物培養細胞系を用いて、正常細胞群および異常細胞群の核内構造体（核スペックル、カハールボディ、PMLボディ）や核膜の形態の数値化を行った。siRNA処理を施した細胞に、蛍光免疫染色を施し、イメージングサイトメータ（Olympus Celaview RS100）で画像を多量取得し、多因子画像解析計算法を施行することにより、各構造体の形態的特徴を自動検出・計測し、個々の細胞または細胞集団における核内構造を定量的に評価した。これらに加え、がん疾患組織を含む様々な細胞形態の類似度を定量的に評価し、診断補助技術などへの応用の可能性を見出した。

 
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===次世代シーケンサーによる細胞分化に伴う転写制御ネットワーク再構成の包括的かつ定量的な測定===
*二階堂愛(理化学研究所発生・再生科学総合研究センター　機能ゲノミクスユニット)
 
我々のからだは約300種類の細胞からなる。これらの細胞はたったひとつの細胞に由来し、原則的にはすべて同じゲノム配列を持つ。均一な細胞から多様な細胞の個性を作り出すものはなにか、また、どのようにその個性を維持するのかを明らかにすることは、我々の体の成り立ち(発生)や維持(再生)を理解することに繋がるため、生命科学の重要な問題である。

近年、マイクロアレイや網羅的なcDNA配列決定などのオミックス技術により、細胞の性質を決める転写因子の同定が進んできた (例: iPS細胞)。これにより、細胞の状態は、数千の遺伝子を制御するわずか数種類の転写因子によって作り出せることが明らかになりつつある。これらの研究から明らかになったことの1つとして、「細胞状態の数だけ転写因子の種類が必要となるわけではない」ということがある。ある転写因子は、明らかに、さまざまな細胞状態で再利用されている。

ここで疑問となるのは、「同じ転写因子が異なる細胞状態をどのようにして作り出すのか」という点である。我々は、このような再利用される転写因子が、ほかの転写因子と協調して働くことで、細胞種依存的に、制御する遺伝子を切り替えたり、制御の方向(活性・抑制化)を変えたりすると考えた。この現象を「転写制御ネットワークの再構成(rewiring)」と呼ぶことにする。

ネットワークの再構成を定量的に測定するには、遺伝子の転写量を測定するマイクロアレイなどの技術では達成することは困難である。しかし、近年、高出力・高並列性を備えた次世代シーケンサーが登場し、免疫沈降法との技術的な統合により、特定の転写因子に限れば、包括的な転写因子結合領域を安価に高速に、そして定量的に、同定できるChIP-seq法が開発された。

本研究では、胚性幹細胞と栄養外胚葉細胞の両方で再利用される転写因子に注目し、分化の際にどのようにその転写因子がターゲットや活性を変えるかを捉えることを目的とした。まず胚性幹細胞から栄養外胚葉細胞へ分化する培養細胞系を用い、経時的にマイクロアレイとChIP-seqを行なった。この定量データから、この転写因子と協調的に働く転写因子を同定した。さらに、転写因子結合が遺伝子発現に対し、活性的に働くのか、抑制的に働くのかを予測するために、転写因子のプロモータへの結合量がmRNAの転写量に与える影響について定量的なモデルを構築し、転写因子活性を予測した。これらの結果より、転写制御ネットワークの構造がダイナミックに再構築される様子を明らかにすることができた。

 
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[http://q-bio.jp/wiki/定量生物学の会_第三回年会_(2010/11)#.E3.82.BB.E3.83.83.E3.82.B7.E3.83.A7.E3.83.B3.EF.BC.8811.E6.9C.8827.E6.97.A5.E3.80.8128.E6.97.A5.E9.96.8B.E5.82.AC.EF.BC.89 第三回年会セッションへ]

第三回年会セッション3

2010-11-01T16:03:14Z

Akkimura:

==第三回年会（セッション3）大規模情報の定量生物学 ==
===日時===
2010/11/28 セッション３

=== Chair===
*木村　暁（遺伝研）

=== 概要 ===

===細胞形態の定量解析と分類===
*○斉藤典子、徳永和明、＊村瀬八重子、＊小林民代、＊坂内誠、中尾光善（熊本大・発生医学研究所・細胞医学、＊オリンパス株式会社）　
　　細胞核内は遺伝子の転写、複製、RNAのプロセッシングなど生命活動に重要な事象が複雑な制御を受けながら起こるため、高度に組織化され、染色体間領域に様々な核内構造体が存在する。発生・分化の各過程や各種の疾患において、遺伝子の発現プロファイルがグローバルに変換するとともに、染色体を含めた核内構造がダイナミックに変動する。細胞核の形態は細胞状態を評価する指標として優れており、例えば、癌細胞における核構造異常（核異型）は病理学的な診断に広く用いられている。これらの形態を数値化し、客観的な評価基準を確立することは、生命科学の基礎研究および臨床医学において有益と考えられる。そこで我々は細胞核の形状をコンピュータプログラム（Olympus CELAVIEW RS100）に自動認識させて測定、計測する“モデルベースド”な方法と、多目的パターン認識ソフトウエア（WND-CHARM）を用いて機械視覚･学習を経て形態の類似度を計測し、細胞の状態を自動分類･評価する、“モデルフリーシステム”のふたつの異なるアプローチを確立することを目指している。現在までに我々は動物培養細胞系を用いて、正常細胞群および異常細胞群の核内構造体（核スペックル、カハールボディ、PMLボディ）や核膜の形態の数値化を行った。siRNA処理を施した細胞に、蛍光免疫染色を施し、イメージングサイトメータ（Olympus Celaview RS100）で画像を多量取得し、多因子画像解析計算法を施行することにより、各構造体の形態的特徴を自動検出・計測し、個々の細胞または細胞集団における核内構造を定量的に評価した。これらに加え、がん疾患組織を含む様々な細胞形態の類似度を定量的に評価し、診断補助技術などへの応用の可能性を見出した。

 
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===次世代シーケンサーによる細胞分化に伴う転写制御ネットワーク再構成の包括的かつ定量的な測定===
*二階堂愛(理化学研究所発生・再生科学総合研究センター　機能ゲノミクスユニット)
 
我々のからだは約300種類の細胞からなる。これらの細胞はたったひとつの細胞に由来し、原則的にはすべて同じゲノム配列を持つ。均一な細胞から多様な細胞の個性を作り出すものはなにか、また、どのようにその個性を維持するのかを明らかにすることは、我々の体の成り立ち(発生)や維持(再生)を理解することに繋がるため、生命科学の重要な問題である。

近年、マイクロアレイや網羅的なcDNA配列決定などのオミックス技術により、細胞の性質を決める転写因子の同定が進んできた (例: iPS細胞)。これにより、細胞の状態は、数千の遺伝子を制御するわずか数種類の転写因子によって作り出せることが明らかになりつつある。これらの研究から明らかになったことの1つとして、「細胞状態の数だけ転写因子の種類が必要となるわけではない」ということがある。ある転写因子は、明らかに、さまざまな細胞状態で再利用されている。

ここで疑問となるのは、「同じ転写因子が異なる細胞状態をどのようにして作り出すのか」という点である。我々は、このような再利用される転写因子が、ほかの転写因子と協調して働くことで、細胞種依存的に、制御する遺伝子を切り替えたり、制御の方向(活性・抑制化)を変えたりすると考えた。この現象を「転写制御ネットワークの再構成(rewiring)」と呼ぶことにする。

ネットワークの再構成を定量的に測定するには、遺伝子の転写量を測定するマイクロアレイなどの技術では達成することは困難である。しかし、近年、高出力・高並列性を備えた次世代シーケンサーが登場し、免疫沈降法との技術的な統合により、特定の転写因子に限れば、包括的な転写因子結合領域を安価に高速に、そして定量的に、同定できるChIP-seq法が開発された。

本研究では、胚性幹細胞と栄養外胚葉細胞の両方で再利用される転写因子に注目し、分化の際にどのようにその転写因子がターゲットや活性を変えるかを捉えることを目的とした。まず胚性幹細胞から栄養外胚葉細胞へ分化する培養細胞系を用い、経時的にマイクロアレイとChIP-seqを行なった。この定量データから、この転写因子と協調的に働く転写因子を同定した。さらに、転写因子結合が遺伝子発現に対し、活性的に働くのか、抑制的に働くのかを予測するために、転写因子のプロモータへの結合量がmRNAの転写量に与える影響について定量的なモデルを構築し、転写因子活性を予測した。これらの結果より、転写制御ネットワークの構造がダイナミックに再構築される様子を明らかにすることができた。

 
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第三回年会セッション3

2010-11-01T15:57:44Z

Akkimura: Created page with '==第三回年会（セッション4）時空間ダイナミクスの定量生物学 == ===日時=== 2010/11/28 13:30-15:30 セッション４ === Chair=== *広井賀子（慶…'

==第三回年会（セッション4）時空間ダイナミクスの定量生物学 ==
===日時===
2010/11/28 13:30-15:30 セッション４

=== Chair===
*広井賀子（慶大）

=== 概要 ===

===転写因子Hes1の発現振動によるES細胞の分化調節機構===
*小林妙子(京都大学ウイルス研究所)　
　近年、胚性幹(ES)細胞から様々な種類の細胞を分化誘導する方法が確立されてきていますが、いずれの方法においてもES細胞は均一に分化するのではなく、個々の細胞がばらばらなタイミングで様々な方向へ分化してゆきます(1)。このES細胞の「分化の不均一性」は長年観察されていたものの、そのメカニズムはほとんど分かっていませんでした。

　私たちは、抑制型の転写因子Hes1に着目をしました。Hes1は、ES細胞集団で豊富に発現していますが、個々のES細胞を観察すると、細胞内では、主に３－５時間の周期で発現が振動していることを見いだしました(2)。Hes1は転写因子であり、その発現レベルの変動は、下流遺伝子の発現変動も引き起こしていました。Hes1の発現レベルが高いES細胞と低いES細胞を分離して分化能力を比較した結果、Hes1タンパク質の発現が高い細胞は初期中胚葉に、発現が低い細胞は神経系に分化しやすい傾向を見いだしました(2)。また、ES細胞からの神経分化に必要なNotchシグナルの活性化が、Hes1によって負に調節されている事も分かりました(3)。この結果は、分化誘導時のHes1の発現レベルがNotchシグナルのON、OFFを調節し、分化方向の決定に寄与していることを示します(3, 4)。

　以上の発見により、Hes1の短周期の発現振動によって、様々な分化のポテンシャルをもつES細胞がつくられ、幹細胞の不均一な分化に寄与することが分かりました。遺伝子の発現の振動は、同じ遺伝的背景を持つES細胞が、多様な細胞応答を可能にする戦略の一つかもしれません。　

1. Lowell, S. et al. (2006) PLoS Biol. 4: 805-818. 
2. Kobayashi , T. et al.(2009) Genes & Dev. 23: 1870-1875. 
3. Kobayashi, T and Kageyama, R. (2010) Genes Cells, 15: 689-698. 
4. Kobayashi, T and Kageyama, R. (2010) Cell Cycle 9: 207-208

 
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===遺伝子改変マウスを用いた哺乳類脊髄神経回路網の機能解析===
*西丸広史(筑波大学大学院・人間総合科学研究科)
 
私たちの心と体の動きは、中枢神経系にある神経細胞がお互いに結合して形成する神経回路によって生み出されていると考えられている。しかし哺乳類の多くの神経回路では、どのような性質をもった神経細胞の電気活動がどのように組み合わさることで個々の回路からの出力パターンが最終的に形成されるのか、という基本的なことさえほとんどわかっていない。例えば、私たちヒトを含めた地上に暮らす哺乳類が歩くときには、左右の足のそれぞれの関節をリズミックかつスムーズに動かすことで推進力を生み出している。このときの時間的・空間的出力パターンはそれぞれの筋群を直接支配する運動ニューロンが、脊髄に局在する神経回路で作られた指令を受けてリズミックに発火することによって形成される。このような運動神経回路はその出力をモニタすることが容易なことから、哺乳類の神経回路の作動機序の格好の研究対象となっているが、回路そのものの生物学的構造、例えば回路内のニューロンがどのように結合し、それぞれの活動がどのように組み合わさることによって機能的な運動出力が作られているのかという点はほとんど明らかにされていない。その要因として回路の機能的な結合を保ちつつ、脊髄の複雑さを乗り越えてアプローチする方法が限られていたことが挙げられる。しかし近年、哺乳類の分子生物学的、遺伝子工学的な実験モデルとして最も確立されているマウスを用いることにより、脊髄の運動を生み出す神経機構、特に回路を構成する脊髄介在ニューロンの電気生理学的性質、活動の制御様式さらにはその役割の研究が大きく進みつつある。本発表では、運動の発現に関与する神経回路の作動メカニズムに関して、遺伝改変マウスを用いた脊髄抑制性ニューロンの機能解析に関する最近の我々の取り組みについて、特に運動ニューロンを反回抑制回路のシナプスレベルでの解析を紹介する。

 
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===マウス胚左右軸を決めるノード繊毛運動の協同性===
*篠原恭介1・高松敦子2 (1 大阪大学　大学院生命機能研究科, 2 早稲田大学理工学部電気・情報生命工学科)

マウス初期胚において受精後7.5日から8.0日の間に胚体の正中線上にあるノード内で、繊毛（長さ2-3 umの有毛細胞）の時計回り回転運動によりノード流と呼ばれる左向きの流れが発生し、これが左右非対称な遺伝子発現を誘導し、左右軸を決める事が知られている。本研究ではノード流の速度分布と繊毛の回転運動を粒子画像流速測定法（PIV法）と回転位相差の固定確率を用いて定量的に計測し、繊毛間の協同性解析を行った。また、位相振動子と呼ばれる、振動ユニットを相互作用させた系と数値流体力学を組み合わせた数理モデルシミュレーションを行い、実験結果と比較・検証した。ノード内の繊毛は自らが発生する流れを通じて結合し、繊毛運動の協同性と流れの速度はトレードオフの関係にある事が示唆された。また、最近ノード繊毛の運動性が著しく低下するが左右異常を示さない興味深い変異体を見つけたので併せて報告する。 
研究内容の紹介以外に、工学出身者と生物物理学研究者の共同研究のきっかけや問題解決のアプローチの違いなどに言及できればと思います。

 
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[http://q-bio.jp/wiki/定量生物学の会_第三回年会_(2010/11)#.E3.82.BB.E3.83.83.E3.82.B7.E3.83.A7.E3.83.B3.EF.BC.8811.E6.9C.8827.E6.97.A5.E3.80.8128.E6.97.A5.E9.96.8B.E5.82.AC.EF.BC.89 第三回年会セッションへ]

===細胞内自己組織化による自発シグナル生成　- Organized randomness - ===
*上田昌宏1・柴田達夫2 ( 1 大阪大学大学院・生命機能研究科, 2 理化学研究所・CDB)

 
上田昌宏　（大阪大学大学院・生命機能研究科）
 
「細胞は分子反応・分子運動の確率性に起因する”ゆらぎ”を内包したシステムであ
る。確率的にはたらく分子を要素として情報処理機能・運動機能などを有する分子シ
ステムが自律的に組織化され，変動する環境に対して巧みに適応できる．本セミナー
では，分子レベルから細胞レベルへと階層を登りながら，各階層にみられる機能発現
とゆらぎの関係について議論する．「ゆらぐ分子による確率的シグナル伝達」，「分
子ネットワークの自己組織化による自発シグナル生成」，「細胞運動のゆらぎを利用
した環境変動への柔軟な応答」等、ゆらぎの寄与が顕著な生命現象を取り上げ，その
現象の動的な振る舞い（ダイナミクス）を実験と理論の両面から明らかにする．ゆら
ぎは細胞の安定性を乱す邪魔者ではなく，むしろ細胞の環境適応性を高めるのに役立っ
ている可能性について議論したい．」

 
柴田達夫（理化学研究所・CDB）
 
「生命の複雑な過程に関する情報を統合して生命の高次の現象を調べるために、数理
モデルや計算を用いた理論的な方法は有効な手段のひとつである。また、理論的な方
法を通じて抽象された現象の数理的メカニズムは、特定のシステムに依存しない普遍
的な動作原理に迫ることができるだろう。そのために、生命現象を定量的に計測し、
それをもとに定量的なデータ解析を行い、その結果を説明する理論を構築するアプロー
チが必要である。本研究では、走化性細胞のシグナル伝達系で観察された自己組織化現象による自発的シグナル形成のメカニズムに、蛍光イメージングデータの統計的解析とそれにもとづく数理モデルの構築によって迫る。さらに、構築された数理モデルを用いて、勾配の安定なセンシングのメカニズムについて考察する」

 
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[http://q-bio.jp/wiki/定量生物学の会_第三回年会_(2010/11)#.E3.82.BB.E3.83.83.E3.82.B7.E3.83.A7.E3.83.B3.EF.BC.8811.E6.9C.8827.E6.97.A5.E3.80.8128.E6.97.A5.E9.96.8B.E5.82.AC.EF.BC.89 第三回年会セッションへ]

定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-11-01T15:51:18Z

Akkimura: /* セッション（11月27日、28日開催） */

==定量生物学の会　年会最新情報 ==
*New!! 要旨の登録がまだの方はメールの案内に従ってお早めに提出頂けますようよろしくお願い致します(101101)。
* ポスター発表の要旨登録を開始しました(101021)。
* チュートリアルの要旨を掲載しましたのでどうぞご覧下さい(100926)。
*第三回年会は定員を超えたため参加登録を締め切らせて頂きました。チュートリアルのみの枠はまだ十分空いています(100917 21:09)。
* 参加登録を開始しました(100915)。[[第三回年会参加登録ページ|参加登録ページへ]]
* Home pageを作成しました。随時、情報を掲載していきます(100521)。

==定量生物学の会　第三回年会　参加登録 ==
*第三回年会は定員を超えたため参加登録を締め切らせて頂きました。チュートリアルのみの枠はまだ十分空いています

[[第三回年会参加登録ページ|参加登録ページへ]]

==定量生物学の会　第三回年会　要旨登録 ==
メールでお知らせしましたように、ポスター発表の要旨の受付を開始予定しました。要旨登録には参加登録時に送付したパスワードが必要になります。要旨登録の締め切りは10月31日です。 

== 第三回年会の概要==
===目的===
第三回年会は、過去二回の年会と同様に、定量性を高く意識した生命科学研究にかかわる研究者、およびそのような新しい方向性を模索したいと考える研究者が、具体的な方法論や技術、そして分野の方向性などをオープンな雰囲気で議論することを目的としています。「定量的な生命科学のあり方」を模索するにあたり、参加者一人一人に情報を発信していただき、情報を相互に交換することを重視したいと考えています。そのため、参加者全員に口頭発表（招待のみ）もしくはポスター発表をお願いしています。

=== プログラム企画について ===
第三回年会のプログラムを作成するにあたり、過去の年会・キャラバンの参加者の皆様からのフィードバックを元にして、既存の企画の再構成と新たな企画の立案を行いました。
さらに、新たな世話人が加わることで、これまでの企画を踏襲しながらも新しい視点や新しい人脈を導入することを目指しました。
==== 【チュートリアル】====
新機軸として、顕微鏡画像の取得や解析、微細加工技術などを自らの手で活用するための「Do It Yourself」のチュートリアルを企画しました。
過去二回の研究会で好評だった「理論生物学基礎(仮)」チュートリアルについては、新たな講師の方をお招きし、これまでとは違ったテーマと視点で講演を行って頂きます。
また、第二回年会より設けられた「実験データの統計解析法基礎(仮)」については、前回大変効果的な講義を行って下さった高木拓明さんに講演をお願いしました。
====【セッション】====
第二回年会の構成を踏襲する形で４つの口頭発表セッションを企画しております。
これまでの年会でも主要なトピックであった「細胞メカニクス」「時空間ダイナミクス」をテーマとしたセッションを設けます。
過去二回の年会で好評だった「要素技術」に関するセッションは、「工学技術と定量生物学」と題して、技術に留まらず、工学的視点から生物や解析手法を議論できるものにしたいと考えています。
さらに、第二回年会でとりあげたオミックス的な解析と定量的な解析との間をつなぐ研究についても、「大規模情報と定量生物学」として情報の取得と解析をテーマに企画しています。

もちろん今回も、参加者全員が発表するポスターセッションを行います。さらに議論が盛り上がるように時間配分等を工夫します。

ぜひ皆様の積極的な参加をお待ちしております。

==日時・場所・参加費・参加人数==
*日時：2010年11月26日(金)、11月27日(土)、11月28日(日)
*場所：東京大学生産技術研究所　[http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access/access.html] コンベンションホール
* 参加費： 1500-2500円程度を予定（懇親会での軽食代など実費）。確定次第、HP上でお知らせします。チュートリアルのみ参加の方は無料です。

* 参加上限人数
** チュートリアル：200人程度（講演会場の定員により）
** 年会: 120人+講演者約20名（ポスター会場のスペースにより）

== 企画プログラム ==
=== チュートリアル（11月26日開催） ===
*[[第三回年会_チュートリアル_DIY | Do It Yourself: 環境制御、顕微鏡の構築と制御]]
**chair: 塚田祐基（名大）
**講演者: 五條理保（東大）、五島剛太（名大）、新井由之（北大）
*[[第三回年会_チュートリアル_統計 | 実験データの統計解析法基礎]]
**高木拓明 (奈良医大)
*[[第三回_チュートリアル_理論生物1 |理論生物学基礎1:理論家が考えていること]]
**郡宏 · 伊藤浩史（お茶大）
*[[第三回年会_チュートリアル_理論生物2 |理論生物学基礎2:生命現象への情報理論的アプローチと基礎]]
**小林徹也（東大）

=== セッション（11月27日、28日開催） ===
*[[第3回年会セッション1 | 工学技術と定量生物学]]
**chair: 木村啓志（東大）
**講演者: 津田行子（東大）、奥寛雅（東大）、竹本智子（理研）、安達泰治（京大）
*[[第3回年会セッション2 | 細胞メカニクスの定量生物学]]
**chair: 澤井　哲（東大）
**講演者: 谷本博一（東大）、水野大介（九大）、末次志郎（東大）、鈴木孝幸（東北大）・森下喜弘（九州大)
*[[第三回年会セッション3 | 大規模情報の定量生物学]]
**chair: 木村暁（遺伝研）
**講演者: 斉藤典子（熊大）、二階堂愛（理研CDB）
*[[第三回年会セッション4 | 時空間ダイナミクスの定量生物学]]
**chair: 広井賀子（慶大）
**講演者: 小林妙子（京大）、西丸広史（筑波大）、篠原恭介（大阪大）・高松敦子（早稲田大）、上田昌宏（阪大）・柴田達夫（理研CDB）

===ポスターセッション（11月27日、28日開催） ===

=== その他の企画（11月27日開催） ===
*ポスターガイド
** ポスターのセクション分けなどの説明
*懇親会
** ポスターセッション会場と併設。

==発表形式==
* 口頭発表
** 個別にご案内します。
* 一般参加者の発表
** 原則的に'''ポスター発表をお願いします'''。
** ポスター発表の目的は、参加者がお互いに何をやっているのか、もしくは、参加者のお互いの顔がわかるようにすることです。発表できるような結果が出ていない学生や、研究室の都合で詳細な内容を発表できない参加者も想定されますが、そのような場合は、自分が何をやりたいかを説明するようなポスター発表でも構いません。過去の年会においても研究提案中心のポスターがありましたし、ぜひ積極的にご参加ください。
== スケジュール ==
===11月26日(チュートリアル)===
{|
|-
!11:00-14:00　　
!
!（チュートリアル１）Do It Yourself: 環境・顕微鏡制御
|-
!11:00 - 11:40
!
|　講演者1 　五条理保「超簡単！マイクロデバイス作製法」
|-
!11:40 - 12:20
!
| 　講演者2 　新井由之「手作り全反射照明顕微鏡」
|-
!12:20 - 13:20
!
|　(昼食休憩)
|-
!13:20 - 14:00
!
|　講演者3　五島剛太「今日から使える快適・無料イメージングソフト「マイクロマネージャー」」
|-
!14:15-15:30
!　　
!（チュートリアル2）実験データの統計解析法基礎
|-
!
!
| 　講演者　　高木拓明
|-
!15:45-18:00
!
!（チュートリアル3）理論生物学基礎
|-
!15:45 - 16:45
!
| 　講演者1　郡宏・伊藤浩史「理論家が考えていること」
|-
!17:00 - 18:00
!
| 　講演者2 　小林徹也「生命現象への情報論的アプローチと基礎」
|-
|}

===11月27日(年会1日目)===
{| class="wikitable"
|-
!10:00-10:30
!
! 導入・これまでの会の活動について経緯説明・会場利用の注意点
|-
!10:30-12:00
!
! セッション１（工学技術と定量生物学）
|-
!
!
| 津田行子「ボトムアップ組織構築のための細胞集団のマイクロ制御技術」
|-
!
!
| 奥寛雅「顕微鏡の高速制御技術とその生物学への応用」
|-
!
!
| 竹本智子「細胞観察画像の定量解析のための注目点検出アルゴリズムの性能評価」
|-
!
!
| 安達泰治「骨のリモデリングによる機能的適応の計算バイオメカニクス」
|-
!12:00-12:05
!
! ポスターガイダンス
|-
!
!
|
|-
!12:05-13:00
!
! 昼食
|-
!13:00-15:00
!
! ポスターセッション１
|-
!15:15-17:15
!
! セッション２（細胞メカニクスの定量生物学）
|-
!
!
| 谷本博一「細胞の形と力の関係」
|-
!
!
| 水野大介「細胞骨格の非平衡力学特性と細胞の力学知覚の物理メカニズム」
|-
!
!
| 末次志郎「細胞の形態形成における脂質膜とアクチン細胞骨格の形態形成機構」
|-
!
!
| 鈴木孝幸・森下喜弘「四肢発生をモデルとした形態形成のロジックを解明するための定量的アプローチ」
|-
!
!
|
|-
!18:00-20:00
!
!ポスターセッション２(兼懇親会)
|}

===11月28日(年会2日目)===
{| class="wikitable"
|-
!10:00-11:00
!　　
!セッション３（大規模情報の定量生物学）
|-
!
!
| 斉藤典子「疾患組織画像を用いた細胞形態の定量解析・分類」
|-
!
!
| 二階堂愛「次世代シーケンサーによる細胞分化に伴う転写制御ネットワーク再構成の包括的かつ定量的な測定」
|-
!11:00-13:30
!
!昼食 & ポスターセッション３
|-
!13:30-15:30
!
! セッション４（時空間ダイナミクスの定量生物学)
|-
!
!
| 小林妙子「転写因子Hes1の発現振動によるES細胞の分化調節機構」
|-
!
!
| 西丸広史「遺伝子改変マウスを用いた哺乳類脊髄神経回路網の機能解析」
|-
!
!
| 篠原恭介・高松敦子「マウス胚左右軸を決めるノード繊毛運動の協同性」
|-
|-
!
!
| 上田昌宏・柴田達夫「細胞内自己組織化による自発シグナル生成　- Organized randomness -」
|-
!
|-
!16:00-17:00
!
!総合議論
|}

== 第三回年会企画・運営 (あいうえお順)==
*木村　暁(遺伝研)
*黒澤　元(理化学研究所)
*小林徹也(東京大学)
*佐藤雅之(大阪大学)
*杉村　薫(理化学研究所)
*塚田祐基(名古屋大学)
*広井賀子(慶應義塾大学)
*舟橋　啓(慶應義塾大学)

== スポンサー==
本年会の開催費の一部は、文部科学省新学術領域研究「遺伝情報発現・収納・継承の時空間場（遺伝情報場）」と「哺乳類初期発生の細胞コミュニティー」からサポートをうけています。

「遺伝情報場」は染色体やその周辺環境の動態・物性など新たな観点から遺伝情報制御を捉える研究を展開しており、関連分野での若手研究者の活躍を応援します。

「細胞コミュニティ」は、哺乳類初期発生を、細胞、分子をはじめとする様々な視点から解析する研究を進めています。哺乳類に特徴的な調節性に富んだ発生を理解する為にもライブイメージング、画像解析、数理解析などを積極的に取り入れていきます。特に若く柔軟な研究者の分野を超えた活躍に期待しています。

== 問い合わせ先 ==
Email:q.bio2010 at gmail.com
（迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください）

第三回年会参加登録ページ

2010-09-14T23:15:02Z

Akkimura: /* 参加登録ページ */

== 定量生物学の会　第三回年会登録==
以下の「注意とお願い」、「レジストレーションの流れ」を読んでいただき、ページ最後の登録フォームから手続きを進めてください。

== 注意とお願い==
* 年会は　チュートリアル(11/26)，年会初日(11/27)、年会２日目(11/28)の３日間開催されます。
* チュートリアルは無料です。ポスター発表の必要もありません。
* 年会初日、年会２日目は参加費1500-3800円（お弁当の有無などに応じて; 後日正確な金額を連絡）が必要になります。
*参加費は、定量生物学の会のpaypalアカウント（名義：定量生物学の会）から請求メールが届きますので、メールの説明に従ってお支払い下さい。尚、支払いにpaypalアカウントは必要ありません。
*会として参加者の間でお互いの顔が見える会を目指していますので、年会参加者の皆様には原則'''ポスター発表をお願いします。'''ただし、まだ研究成果が出ていない学生や、研究室の方針で進行中の研究が公開できない研究者にもぜひ参加していただきたいと思うので、ポスター発表は通常の研究発表的なものだけでなく、「こういうことがやりたい」とか「だれか一緒にこういう研究をしないか？」といった内容でも構いません。
*参加登録には演題の要旨は必要ありません。演題登録は'''参加登録時に送られてくるパスワード'''を使って行います。演題登録の詳細については参加登録された方に後日お知らせします。
* 年会二日目は休日のため、'''会場である東京大学生産技術研究所のまわりは昼食などを取るのに非常に不便です'''。お弁当を注文されるか、もしくはコンビニなどで昼食を持参してくださるようお願いします。

== レジストレーションの流れ ==
#以下の参加登録ページでお名前など簡単な情報を登録します。その際、"年会＋チュートリアルに参加"、"年会のみ参加"、"チュートリアルのみ参加"を選択していただきます。
#年会参加登録者にはパスワードがメールで送付されてきます。
#パスワードを使って演題を登録します。年会の演題登録については改めてお知らせします。

== 参加登録ページ ==
参加登録を開始しました。こちらのリンクから登録ページへ移動して、登録してください:

http://q-bio.jp/qbio2010_11/regist.cgi

[[定量生物学の会第三回年会 (2010/11)|年会メインページへもどる]]

定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-09-14T23:13:56Z

Akkimura: /* 定量生物学の会　年会最新情報 */

==定量生物学の会　年会最新情報 ==
* Home pageを作成しました。随時、情報を掲載していきます(100521)。
* 参加登録を開始しました(100915)。[[第三回年会参加登録ページ|参加登録ページへ]]

==定量生物学の会　第三回年会　参加登録 ==
*参加登録を開始しました。

[[第三回年会参加登録ページ|参加登録ページへ]]

== 第三回年会の概要==
===目的===
第三回年会は、過去二回の年会と同様に、定量性を高く意識した生命科学研究にかかわる研究者、およびそのような新しい方向性を模索したいと考える研究者が、具体的な方法論や技術、そして分野の方向性などをオープンな雰囲気で議論することを目的としています。「定量的な生命科学のあり方」を模索するにあたり、参加者一人一人に情報を発信していただき、情報を相互に交換することを重視したいと考えています。そのため、参加者全員に口頭発表（招待のみ）もしくはポスター発表をお願いしています。

=== プログラム企画について ===
第三回年会のプログラムを作成するにあたり、過去の年会・キャラバンの参加者の皆様からのフィードバックを元にして、既存の企画の再構成と新たな企画の立案を行いました。
さらに、新たな世話人が加わることで、これまでの企画を踏襲しながらも新しい視点や新しい人脈を導入することを目指しました。
==== 【チュートリアル】====
新機軸として、顕微鏡画像の取得や解析、微細加工技術などを自らの手で活用するための「Do It Yourself」のチュートリアルを企画しました。
過去二回の研究会で好評だった「理論生物学基礎(仮)」チュートリアルについては、新たな講師の方をお招きし、これまでとは違ったテーマと視点で講演を行って頂きます。
また、第二回年会より設けられた「実験データの統計解析法基礎(仮)」については、前回大変効果的な講義を行って下さった高木拓明さんに講演をお願いしました。
====【セッション】====
第二回年会の構成を踏襲する形で４つの口頭発表セッションを企画しております。
これまでの年会でも主要なトピックであった「細胞メカニクス」「時空間ダイナミクス」をテーマとしたセッションを設けます。
過去二回の年会で好評だった「要素技術」に関するセッションは、「工学技術と定量生物学」と題して、技術に留まらず、工学的視点から生物や解析手法を議論できるものにしたいと考えています。
さらに、第二回年会でとりあげたオミックス的な解析と定量的な解析との間をつなぐ研究についても、「大規模情報と定量生物学」として情報の取得と解析をテーマに企画しています。

もちろん今回も、参加者全員が発表するポスターセッションを行います。さらに議論が盛り上がるように時間配分等を工夫します。

ぜひ皆様の積極的な参加をお待ちしております。

==日時・場所・参加費・参加人数==
*日時：2010年11月26日(金)、11月27日(土)、11月28日(日)
*場所：東京大学生産技術研究所　[http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access/access.html] コンベンションホール
* 参加費： 1500-2500円程度を予定（懇親会での軽食代など実費）。確定次第、HP上でお知らせします。チュートリアルのみ参加の方は無料です。

* 参加上限人数
** チュートリアル：150人程度（会場の定員により）
** 年会: 120人+講演者約20名（ポスター会場のスペースにより）

== 企画プログラム ==
=== チュートリアル（11月26日開催） ===
*Do It Yourself: 環境制御、顕微鏡の構築と制御
**chair: 塚田祐基（名大）
**講演者: 五條理保（東大）、五島剛太（名大）、新井由之（北大）
*実験データの統計解析法基礎
**高木拓明（奈良医大）
*理論生物学基礎1:生物学と縮約
**郡宏 · 伊藤浩史（お茶大）
*理論生物学基礎2:生命現象への情報理論的アプローチと基礎
**小林徹也（東大）

=== セッション（11月27日、28日開催） ===
*工学技術と定量生物学
**chair: 木村啓志（東大）
**講演者: 津田行子（東大）、奥寛雅（東大）、竹本智子（理研）、安達泰治（京大）
*細胞メカニクスの定量生物学
**chair: 澤井　哲（東大）
**講演者: 谷本博一（東大）、水野大介（九大）、鈴木孝幸（東北大）・森下喜弘（九州大)、末次志郎（東大）
*大規模情報の定量生物学
**chair: 木村暁（遺伝研）
**講演者: 二階堂愛（理研CDB）、斉藤典子（熊大）
*時空間ダイナミクスの定量生物学
**chair: 広井賀子（慶大）
**講演者: 小林妙子（京大）、西丸広史（筑波大）、上田昌宏（阪大）・柴田達夫（広大）、篠原恭介（大阪大）・高松敦子（早稲田大）

===ポスターセッション（11月27日、28日開催） ===

=== その他の企画（11月27日開催） ===
*ポスターガイド
** ポスターのセクション分けなどの説明
*懇親会
** ポスターセッション会場と併設。

==発表形式==
* 口頭発表
** 個別にご案内します。
* 一般参加者の発表
** 原則的に'''ポスター発表をお願いします'''。
** ポスター発表の目的は、参加者がお互いに何をやっているのか、もしくは、参加者のお互いの顔がわかるようにすることです。発表できるような結果が出ていない学生や、研究室の都合で詳細な内容を発表できない参加者も想定されますが、そのような場合は、自分が何をやりたいかを説明するようなポスター発表でも構いません。過去の年会においても研究提案中心のポスターがありましたし、ぜひ積極的にご参加ください。
== スケジュール ==
===11月26日(チュートリアル)===
{|
|-
!11:00-14:45　　
!
!（チュートリアル１）Do It Yourself: 環境・顕微鏡制御
|-
!　11:00 - 11:45
!
|　講演者1 　五条理保「超簡単！マイクロデバイス作製法」
|-
!　11:45 - 12:30
!
| 　講演者2 　新井由之「手作り全反射照明顕微鏡」
|-
!　12:30 - 13:30
!
|　(昼食休憩)
|-
!　13:30 - 14:15
!
|　講演者3　五島剛太「今日から使える快適・無料イメージングソフト「マイクロマネージャー」」
|-
!14:30-15:30
!　　
!（チュートリアル2）実験データの統計解析法基礎
|-
!
!
| 　講演者　　高木拓明
|-
!15:45-18:00
!
!（チュートリアル3）理論生物学基礎
|-
!　15:45 - 16:45
!
| 　講演者1　郡宏・伊藤浩史「生物学と縮約」
|-
!　17:00 - 18:00
!
| 　講演者2 　小林徹也「生命現象への情報論的アプローチと基礎」
|-
|}

===11月27日(年会1日目)===
{| class="wikitable"
|-
!10:00-10:30
!
! 導入・これまでの会の活動について経緯説明・会場利用の注意点
|-
!10:30-12:00
!
! セッション１（工学技術と定量生物学）
|-
!
!
| 津田行子「ボトムアップ組織構築のための細胞集団のマイクロ制御技術」
|-
!
!
| 奥寛雅「顕微鏡の高速制御技術とその生物学への応用」
|-
!
!
| 竹本智子「細胞観察画像の定量解析のための注目点検出アルゴリズムの性能評価」
|-
!
!
| 安達泰治「骨のリモデリングによる機能的適応の計算バイオメカニクス」
|-
!12:00-12:05
!
! ポスターガイダンス
|-
!
!
|
|-
!12:05-13:00
!
! 昼食
|-
!13:00-15:00
!
! ポスターセッション１
|-
!15:15-17:15
!
! セッション２（細胞メカニクスの定量生物学）
|-
!
!
| 谷本博一「細胞の形と力の関係」
|-
!
!
| 水野大介「細胞骨格の非平衡力学特性と細胞の力学知覚の物理メカニズム」
|-
!
!
| 鈴木孝幸・森下喜弘「指の個性の決定メカニズムを定量発生生物学を用いて解析する」
|-
!
!
| 末次志郎「細胞の形態形成における脂質膜とアクチン細胞骨格の形態形成機構」
|-
!
!
|
|-
!18:00-20:00
!
!ポスターセッション２(兼懇親会)
|}

===11月28日(年会2日目)===
{| class="wikitable"
|-
!10:00-11:00
!　　
!セッション３（大規模情報の定量生物学）
|-
!
!
| 二階堂愛「次世代シーケンサーによる細胞分化に伴う転写制御ネットワーク再構成の包括的かつ定量的な測定」
|-
!
!
| 斉藤典子「疾患組織画像を用いた細胞形態の定量解析・分類」
|-
!11:00-13:30
!
!昼食 & ポスターセッション３
|-
!13:30-15:30
!
! セッション４（時空間ダイナミクスの定量生物学）
|-
!
!
| 小林妙子「転写因子Hes1の発現振動によるES細胞の分化調節機構」
|-
!
!
| 西丸広史「哺乳類脊髄神経回路網の作動メカニズムの生理学的解析」
|-
!
!
| 上田昌宏・柴田達夫「細胞内自己組織化による自発シグナル生成　- Organized randomness -」
|-
|-
!
!
| 篠原恭介・高松敦子「マウス胚左右軸を決めるノード繊毛運動の協同性」
|-
!
|-
!16:00-17:00
!
!総合議論
|}

== 第三回年会企画・運営 (あいうえお順)==
*木村　暁(遺伝研)
*黒澤　元(理化学研究所)
*小林徹也(東京大学)
*佐藤雅之(大阪大学)
*杉村　薫(理化学研究所)
*塚田祐基(名古屋大学)
*広井賀子(慶應義塾大学)
*舟橋　啓(慶應義塾大学)

== スポンサー==
本年会の開催費の一部は、文部科学省新学術領域研究「遺伝情報発現・収納・継承の時空間場（遺伝情報場）」と「哺乳類初期発生の細胞コミュニティー」からサポートをうけています。

「遺伝情報場」は染色体やその周辺環境の動態・物性など新たな観点から遺伝情報制御を捉える研究を展開しており、関連分野での若手研究者の活躍を応援します。

「細胞コミュニティ」は、哺乳類初期発生を、細胞、分子をはじめとする様々な視点から解析する研究を進めています。哺乳類に特徴的な調節性に富んだ発生を理解する為にもライブイメージング、画像解析、数理解析などを積極的に取り入れていきます。特に若く柔軟な研究者の分野を超えた活躍に期待しています。

== 問い合わせ先 ==
Email:q.bio2010 at gmail.com
（迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください）

Main Page

2010-09-14T23:12:23Z

Akkimura: /* 最新情報 */

== 定量生物学の会へようこそ ==
定量生物学の会は、定量的な解析から生命システムの定性的な性質を明らかにする生命科学の方向性や解決すべき点などを具体的な問題設定のもとで議論する場です。さらに、領域横断的な研究体制や連携関係を、若手研究者（学生、PD、若手PI）を中心にボトムアップで模索することを目指しています。年齢や職位に関係なく、会の趣旨に賛同して下さったり、会の活動に興味を持って下さるみなさまの参加をお待ちしております。

== イベント情報 ==
[[定量生物学の会第三回年会 (2010/11)]] 
[[events|過去のイベント情報はこちら]]

==最新情報 ==
*[[定量生物学の会第三回年会 (2010/11)]]の参加登録を開始しました。[[第三回年会参加登録ページ|参加登録ページへ]]
*[[定量生物学の会第三回年会 (2010/11)]]は、2010年11月26-28日に東京大学生産技術研究所で行います。
*[[Documents|Documents page]]を更新しました。
*[[年会2010アンケート|第二回年会アンケート結果]]を掲載しました。
*年会の要旨登録をまだ済まされていない方は、なるべく早く、メールでお知らせした要旨登録フォームにて手続きを進めていただきますようよろしくお願い致します。
*[[第二回年会|第二回年会]]のポスター発表の要旨登録を開始しました。締め切りは12月15日です。
*第二回年会は定員を超えたため参加登録を締め切りました。
*[[第二回年会|第二回年会]]のレジストレーションを開始しました。
*[[News|News page]] を更新しました。。東京大学黒田研特任助教募集のお知らせ。
*[[News|News page]] を更新しました。Biology/Genetics/Evolution Postdoctoral Fellow Position (Fred Hutchinson Cancer Research Center)のお知らせ。
*第二回年会の企画プログラムの一部を掲載しました。[[第二回年会|第二回年会のページ]]
* [[日本バイオインフォマティクス学会、定量生物学の会　共催夏の学校2009]]のページを作成しました。
*[[News|News page]] を更新しました。京都大学生命科学研究科特別講義のお知らせ。
*[[News|News page]] を更新しました。東京大学黒田研博士研究員（ポスドク）募集のお知らせ。
*[[第二回年会]]のページを作成しました。随時、情報を掲載していきます。
*[[News|News page]] を更新しました。光イメージング若手研究会「光塾」のお知らせ。
*定量生物学に関わる研究者間の情報交換を促進するために、新しく [[News|News page]] を設けました。
*第１回年会の写真とアンケート結果を掲載しました。
*第１回キャラバン＠遺伝研のポスター発表申し込み受付期間を２／２７まで延長しました。なお、画像解析ケーススタディーのサンプル画像提供は締め切りました。
*第１回キャラバン＠遺伝研の情報を更新しました。発表申し込み方法も掲載されています。
*年会の要旨登録をまだ済まされていない方は、なるべく早く、要旨登録ページにて手続きを進めていただきますようよろしくお願い致します。
*年会の要旨登録を開始しました。締め切りは１２月１２日です。参加登録者のみなさんには改めてメールでお知らせします。
*'''申し訳ありませんが、年会・ワークショップ・チュートリアルは定員を超えたため参加登録を締め切りました。''
*'年会は定員まであと残りわずかです。年会参加を希望する方は登録をお急ぎください'
*第一回年会のレジストレーションを開始しました。
*ホームページをwww.q-bio.jp, q-bio.jpとして公開しました。
*ホームページのたたき台を作成しました。
*ホームページをアップしました。

Main Page

2010-09-14T23:11:52Z

Akkimura: /* 最新情報 */

== 定量生物学の会へようこそ ==
定量生物学の会は、定量的な解析から生命システムの定性的な性質を明らかにする生命科学の方向性や解決すべき点などを具体的な問題設定のもとで議論する場です。さらに、領域横断的な研究体制や連携関係を、若手研究者（学生、PD、若手PI）を中心にボトムアップで模索することを目指しています。年齢や職位に関係なく、会の趣旨に賛同して下さったり、会の活動に興味を持って下さるみなさまの参加をお待ちしております。

== イベント情報 ==
[[定量生物学の会第三回年会 (2010/11)]] 
[[events|過去のイベント情報はこちら]]

==最新情報 ==
*[[定量生物学の会第三回年会 (2010/11)]]の参加登録を開始しました。
*[[定量生物学の会第三回年会 (2010/11)]]は、2010年11月26-28日に東京大学生産技術研究所で行います。
*[[Documents|Documents page]]を更新しました。
*[[年会2010アンケート|第二回年会アンケート結果]]を掲載しました。
*年会の要旨登録をまだ済まされていない方は、なるべく早く、メールでお知らせした要旨登録フォームにて手続きを進めていただきますようよろしくお願い致します。
*[[第二回年会|第二回年会]]のポスター発表の要旨登録を開始しました。締め切りは12月15日です。
*第二回年会は定員を超えたため参加登録を締め切りました。
*[[第二回年会|第二回年会]]のレジストレーションを開始しました。
*[[News|News page]] を更新しました。。東京大学黒田研特任助教募集のお知らせ。
*[[News|News page]] を更新しました。Biology/Genetics/Evolution Postdoctoral Fellow Position (Fred Hutchinson Cancer Research Center)のお知らせ。
*第二回年会の企画プログラムの一部を掲載しました。[[第二回年会|第二回年会のページ]]
* [[日本バイオインフォマティクス学会、定量生物学の会　共催夏の学校2009]]のページを作成しました。
*[[News|News page]] を更新しました。京都大学生命科学研究科特別講義のお知らせ。
*[[News|News page]] を更新しました。東京大学黒田研博士研究員（ポスドク）募集のお知らせ。
*[[第二回年会]]のページを作成しました。随時、情報を掲載していきます。
*[[News|News page]] を更新しました。光イメージング若手研究会「光塾」のお知らせ。
*定量生物学に関わる研究者間の情報交換を促進するために、新しく [[News|News page]] を設けました。
*第１回年会の写真とアンケート結果を掲載しました。
*第１回キャラバン＠遺伝研のポスター発表申し込み受付期間を２／２７まで延長しました。なお、画像解析ケーススタディーのサンプル画像提供は締め切りました。
*第１回キャラバン＠遺伝研の情報を更新しました。発表申し込み方法も掲載されています。
*年会の要旨登録をまだ済まされていない方は、なるべく早く、要旨登録ページにて手続きを進めていただきますようよろしくお願い致します。
*年会の要旨登録を開始しました。締め切りは１２月１２日です。参加登録者のみなさんには改めてメールでお知らせします。
*'''申し訳ありませんが、年会・ワークショップ・チュートリアルは定員を超えたため参加登録を締め切りました。''
*'年会は定員まであと残りわずかです。年会参加を希望する方は登録をお急ぎください'
*第一回年会のレジストレーションを開始しました。
*ホームページをwww.q-bio.jp, q-bio.jpとして公開しました。
*ホームページのたたき台を作成しました。
*ホームページをアップしました。

定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-09-14T23:10:56Z

Akkimura: /* 定量生物学の会　第三回年会　参加登録 */

==定量生物学の会　年会最新情報 ==
* Home pageを作成しました。随時、情報を掲載していきます(100521)。

==定量生物学の会　第三回年会　参加登録 ==
*参加登録を開始しました。

[[第三回年会参加登録ページ|参加登録ページへ]]

== 第三回年会の概要==
===目的===
第三回年会は、過去二回の年会と同様に、定量性を高く意識した生命科学研究にかかわる研究者、およびそのような新しい方向性を模索したいと考える研究者が、具体的な方法論や技術、そして分野の方向性などをオープンな雰囲気で議論することを目的としています。「定量的な生命科学のあり方」を模索するにあたり、参加者一人一人に情報を発信していただき、情報を相互に交換することを重視したいと考えています。そのため、参加者全員に口頭発表（招待のみ）もしくはポスター発表をお願いしています。

=== プログラム企画について ===
第三回年会のプログラムを作成するにあたり、過去の年会・キャラバンの参加者の皆様からのフィードバックを元にして、既存の企画の再構成と新たな企画の立案を行いました。
さらに、新たな世話人が加わることで、これまでの企画を踏襲しながらも新しい視点や新しい人脈を導入することを目指しました。
==== 【チュートリアル】====
新機軸として、顕微鏡画像の取得や解析、微細加工技術などを自らの手で活用するための「Do It Yourself」のチュートリアルを企画しました。
過去二回の研究会で好評だった「理論生物学基礎(仮)」チュートリアルについては、新たな講師の方をお招きし、これまでとは違ったテーマと視点で講演を行って頂きます。
また、第二回年会より設けられた「実験データの統計解析法基礎(仮)」については、前回大変効果的な講義を行って下さった高木拓明さんに講演をお願いしました。
====【セッション】====
第二回年会の構成を踏襲する形で４つの口頭発表セッションを企画しております。
これまでの年会でも主要なトピックであった「細胞メカニクス」「時空間ダイナミクス」をテーマとしたセッションを設けます。
過去二回の年会で好評だった「要素技術」に関するセッションは、「工学技術と定量生物学」と題して、技術に留まらず、工学的視点から生物や解析手法を議論できるものにしたいと考えています。
さらに、第二回年会でとりあげたオミックス的な解析と定量的な解析との間をつなぐ研究についても、「大規模情報と定量生物学」として情報の取得と解析をテーマに企画しています。

もちろん今回も、参加者全員が発表するポスターセッションを行います。さらに議論が盛り上がるように時間配分等を工夫します。

ぜひ皆様の積極的な参加をお待ちしております。

==日時・場所・参加費・参加人数==
*日時：2010年11月26日(金)、11月27日(土)、11月28日(日)
*場所：東京大学生産技術研究所　[http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access/access.html] コンベンションホール
* 参加費： 1500-2500円程度を予定（懇親会での軽食代など実費）。確定次第、HP上でお知らせします。チュートリアルのみ参加の方は無料です。

* 参加上限人数
** チュートリアル：150人程度（会場の定員により）
** 年会: 120人+講演者約20名（ポスター会場のスペースにより）

== 企画プログラム ==
=== チュートリアル（11月26日開催） ===
*Do It Yourself: 環境制御、顕微鏡の構築と制御
**chair: 塚田祐基（名大）
**講演者: 五條理保（東大）、五島剛太（名大）、新井由之（北大）
*実験データの統計解析法基礎
**高木拓明（奈良医大）
*理論生物学基礎1:生物学と縮約
**郡宏 · 伊藤浩史（お茶大）
*理論生物学基礎2:生命現象への情報理論的アプローチと基礎
**小林徹也（東大）

=== セッション（11月27日、28日開催） ===
*工学技術と定量生物学
**chair: 木村啓志（東大）
**講演者: 津田行子（東大）、奥寛雅（東大）、竹本智子（理研）、安達泰治（京大）
*細胞メカニクスの定量生物学
**chair: 澤井　哲（東大）
**講演者: 谷本博一（東大）、水野大介（九大）、鈴木孝幸（東北大）・森下喜弘（九州大)、末次志郎（東大）
*大規模情報の定量生物学
**chair: 木村暁（遺伝研）
**講演者: 二階堂愛（理研CDB）、斉藤典子（熊大）
*時空間ダイナミクスの定量生物学
**chair: 広井賀子（慶大）
**講演者: 小林妙子（京大）、西丸広史（筑波大）、上田昌宏（阪大）・柴田達夫（広大）、篠原恭介（大阪大）・高松敦子（早稲田大）

===ポスターセッション（11月27日、28日開催） ===

=== その他の企画（11月27日開催） ===
*ポスターガイド
** ポスターのセクション分けなどの説明
*懇親会
** ポスターセッション会場と併設。

==発表形式==
* 口頭発表
** 個別にご案内します。
* 一般参加者の発表
** 原則的に'''ポスター発表をお願いします'''。
** ポスター発表の目的は、参加者がお互いに何をやっているのか、もしくは、参加者のお互いの顔がわかるようにすることです。発表できるような結果が出ていない学生や、研究室の都合で詳細な内容を発表できない参加者も想定されますが、そのような場合は、自分が何をやりたいかを説明するようなポスター発表でも構いません。過去の年会においても研究提案中心のポスターがありましたし、ぜひ積極的にご参加ください。
== スケジュール ==
===11月26日(チュートリアル)===
{|
|-
!11:00-14:45　　
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!（チュートリアル１）Do It Yourself: 環境・顕微鏡制御
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!　11:00 - 11:45
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|　講演者1 　五条理保「超簡単！マイクロデバイス作製法」
|-
!　11:45 - 12:30
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| 　講演者2 　新井由之「手作り全反射照明顕微鏡」
|-
!　12:30 - 13:30
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|　(昼食休憩)
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!　13:30 - 14:15
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|　講演者3　五島剛太「今日から使える快適・無料イメージングソフト「マイクロマネージャー」」
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!14:30-15:30
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!（チュートリアル2）実験データの統計解析法基礎
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| 　講演者　　高木拓明
|-
!15:45-18:00
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!（チュートリアル3）理論生物学基礎
|-
!　15:45 - 16:45
!
| 　講演者1　郡宏・伊藤浩史「生物学と縮約」
|-
!　17:00 - 18:00
!
| 　講演者2 　小林徹也「生命現象への情報論的アプローチと基礎」
|-
|}

===11月27日(年会1日目)===
{| class="wikitable"
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!10:00-10:30
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! 導入・これまでの会の活動について経緯説明・会場利用の注意点
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!10:30-12:00
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! セッション１（工学技術と定量生物学）
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| 津田行子「ボトムアップ組織構築のための細胞集団のマイクロ制御技術」
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| 奥寛雅「顕微鏡の高速制御技術とその生物学への応用」
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| 竹本智子「細胞観察画像の定量解析のための注目点検出アルゴリズムの性能評価」
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| 安達泰治「骨のリモデリングによる機能的適応の計算バイオメカニクス」
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!12:00-12:05
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! ポスターガイダンス
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!12:05-13:00
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! 昼食
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!13:00-15:00
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! ポスターセッション１
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!15:15-17:15
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! セッション２（細胞メカニクスの定量生物学）
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| 谷本博一「細胞の形と力の関係」
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| 水野大介「細胞骨格の非平衡力学特性と細胞の力学知覚の物理メカニズム」
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| 鈴木孝幸・森下喜弘「指の個性の決定メカニズムを定量発生生物学を用いて解析する」
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| 末次志郎「細胞の形態形成における脂質膜とアクチン細胞骨格の形態形成機構」
|-
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!18:00-20:00
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!ポスターセッション２(兼懇親会)
|}

===11月28日(年会2日目)===
{| class="wikitable"
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!10:00-11:00
!　　
!セッション３（大規模情報の定量生物学）
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| 二階堂愛「次世代シーケンサーによる細胞分化に伴う転写制御ネットワーク再構成の包括的かつ定量的な測定」
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| 斉藤典子「疾患組織画像を用いた細胞形態の定量解析・分類」
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!11:00-13:30
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!昼食 & ポスターセッション３
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!13:30-15:30
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! セッション４（時空間ダイナミクスの定量生物学）
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| 小林妙子「転写因子Hes1の発現振動によるES細胞の分化調節機構」
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| 西丸広史「哺乳類脊髄神経回路網の作動メカニズムの生理学的解析」
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| 上田昌宏・柴田達夫「細胞内自己組織化による自発シグナル生成　- Organized randomness -」
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| 篠原恭介・高松敦子「マウス胚左右軸を決めるノード繊毛運動の協同性」
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!16:00-17:00
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!総合議論
|}

== 第三回年会企画・運営 (あいうえお順)==
*木村　暁(遺伝研)
*黒澤　元(理化学研究所)
*小林徹也(東京大学)
*佐藤雅之(大阪大学)
*杉村　薫(理化学研究所)
*塚田祐基(名古屋大学)
*広井賀子(慶應義塾大学)
*舟橋　啓(慶應義塾大学)

== スポンサー==
本年会の開催費の一部は、文部科学省新学術領域研究「遺伝情報発現・収納・継承の時空間場（遺伝情報場）」と「哺乳類初期発生の細胞コミュニティー」からサポートをうけています。

「遺伝情報場」は染色体やその周辺環境の動態・物性など新たな観点から遺伝情報制御を捉える研究を展開しており、関連分野での若手研究者の活躍を応援します。

「細胞コミュニティ」は、哺乳類初期発生を、細胞、分子をはじめとする様々な視点から解析する研究を進めています。哺乳類に特徴的な調節性に富んだ発生を理解する為にもライブイメージング、画像解析、数理解析などを積極的に取り入れていきます。特に若く柔軟な研究者の分野を超えた活躍に期待しています。

== 問い合わせ先 ==
Email:q.bio2010 at gmail.com
（迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください）

第三回年会参加登録ページ

2010-09-14T23:09:38Z

Akkimura: /* 参加登録ページ */

== 定量生物学の会　第三回年会登録==
以下の「注意とお願い」、「レジストレーションの流れ」を読んでいただき、ページ最後の登録フォームから手続きを進めてください。

== 注意とお願い==
* 年会は　チュートリアル(11/26)，年会初日(11/27)、年会２日目(11/28)の３日間開催されます。
* チュートリアルは無料です。ポスター発表の必要もありません。
* 年会初日、年会２日目は参加費1500-3800円（お弁当の有無などに応じて; 後日正確な金額を連絡）が必要になります。
*参加費は、定量生物学の会のpaypalアカウント（名義：定量生物学の会）から請求メールが届きますので、メールの説明に従ってお支払い下さい。尚、支払いにpaypalアカウントは必要ありません。
*会として参加者の間でお互いの顔が見える会を目指していますので、年会参加者の皆様には原則'''ポスター発表をお願いします。'''ただし、まだ研究成果が出ていない学生や、研究室の方針で進行中の研究が公開できない研究者にもぜひ参加していただきたいと思うので、ポスター発表は通常の研究発表的なものだけでなく、「こういうことがやりたい」とか「だれか一緒にこういう研究をしないか？」といった内容でも構いません。
*参加登録には演題の要旨は必要ありません。演題登録は'''参加登録時に送られてくるパスワード'''を使って行います。演題登録の詳細については参加登録された方に後日お知らせします。
* 年会二日目は休日のため、'''会場である東京大学生産技術研究所のまわりは昼食などを取るのに非常に不便です'''。お弁当を注文されるか、もしくはコンビニなどで昼食を持参してくださるようお願いします。

== レジストレーションの流れ ==
#以下の参加登録ページでお名前など簡単な情報を登録します。その際、"年会＋チュートリアルに参加"、"年会のみ参加"、"チュートリアルのみ参加"を選択していただきます。
#年会参加登録者にはパスワードがメールで送付されてきます。
#パスワードを使って演題を登録します。年会の演題登録については改めてお知らせします。

== 参加登録ページ ==
参加登録を開始しました（2010.9.15）

こちらのリンクから登録ページへ移動して、登録してください:

http://q-bio.jp/qbio2010_11/regist.cgi

[[定量生物学の会第三回年会 (2010/11)|年会メインページへもどる]]

第三回年会参加登録ページ

2010-09-14T23:09:03Z

Akkimura: /* 参加登録ページ */

== 定量生物学の会　第三回年会登録==
以下の「注意とお願い」、「レジストレーションの流れ」を読んでいただき、ページ最後の登録フォームから手続きを進めてください。

== 注意とお願い==
* 年会は　チュートリアル(11/26)，年会初日(11/27)、年会２日目(11/28)の３日間開催されます。
* チュートリアルは無料です。ポスター発表の必要もありません。
* 年会初日、年会２日目は参加費1500-3800円（お弁当の有無などに応じて; 後日正確な金額を連絡）が必要になります。
*参加費は、定量生物学の会のpaypalアカウント（名義：定量生物学の会）から請求メールが届きますので、メールの説明に従ってお支払い下さい。尚、支払いにpaypalアカウントは必要ありません。
*会として参加者の間でお互いの顔が見える会を目指していますので、年会参加者の皆様には原則'''ポスター発表をお願いします。'''ただし、まだ研究成果が出ていない学生や、研究室の方針で進行中の研究が公開できない研究者にもぜひ参加していただきたいと思うので、ポスター発表は通常の研究発表的なものだけでなく、「こういうことがやりたい」とか「だれか一緒にこういう研究をしないか？」といった内容でも構いません。
*参加登録には演題の要旨は必要ありません。演題登録は'''参加登録時に送られてくるパスワード'''を使って行います。演題登録の詳細については参加登録された方に後日お知らせします。
* 年会二日目は休日のため、'''会場である東京大学生産技術研究所のまわりは昼食などを取るのに非常に不便です'''。お弁当を注文されるか、もしくはコンビニなどで昼食を持参してくださるようお願いします。

== レジストレーションの流れ ==
#以下の参加登録ページでお名前など簡単な情報を登録します。その際、"年会＋チュートリアルに参加"、"年会のみ参加"、"チュートリアルのみ参加"を選択していただきます。
#年会参加登録者にはパスワードがメールで送付されてきます。
#パスワードを使って演題を登録します。年会の演題登録については改めてお知らせします。

== 参加登録ページ ==
参加登録を開始しました（2010.9.15）

こちらからお願いします:

http://q-bio.jp/qbio2010_11/regist.cgi

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第三回年会参加登録ページ

2010-09-14T23:08:43Z

Akkimura: /* 参加登録ページ */

== 定量生物学の会　第三回年会登録==
以下の「注意とお願い」、「レジストレーションの流れ」を読んでいただき、ページ最後の登録フォームから手続きを進めてください。

== 注意とお願い==
* 年会は　チュートリアル(11/26)，年会初日(11/27)、年会２日目(11/28)の３日間開催されます。
* チュートリアルは無料です。ポスター発表の必要もありません。
* 年会初日、年会２日目は参加費1500-3800円（お弁当の有無などに応じて; 後日正確な金額を連絡）が必要になります。
*参加費は、定量生物学の会のpaypalアカウント（名義：定量生物学の会）から請求メールが届きますので、メールの説明に従ってお支払い下さい。尚、支払いにpaypalアカウントは必要ありません。
*会として参加者の間でお互いの顔が見える会を目指していますので、年会参加者の皆様には原則'''ポスター発表をお願いします。'''ただし、まだ研究成果が出ていない学生や、研究室の方針で進行中の研究が公開できない研究者にもぜひ参加していただきたいと思うので、ポスター発表は通常の研究発表的なものだけでなく、「こういうことがやりたい」とか「だれか一緒にこういう研究をしないか？」といった内容でも構いません。
*参加登録には演題の要旨は必要ありません。演題登録は'''参加登録時に送られてくるパスワード'''を使って行います。演題登録の詳細については参加登録された方に後日お知らせします。
* 年会二日目は休日のため、'''会場である東京大学生産技術研究所のまわりは昼食などを取るのに非常に不便です'''。お弁当を注文されるか、もしくはコンビニなどで昼食を持参してくださるようお願いします。

== レジストレーションの流れ ==
#以下の参加登録ページでお名前など簡単な情報を登録します。その際、"年会＋チュートリアルに参加"、"年会のみ参加"、"チュートリアルのみ参加"を選択していただきます。
#年会参加登録者にはパスワードがメールで送付されてきます。
#パスワードを使って演題を登録します。年会の演題登録については改めてお知らせします。

== 参加登録ページ ==
参加登録を開始しました（2010.9.15）
こちらからお願いします: http://q-bio.jp/qbio2010_11/regist.cgi

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定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-08-20T04:06:09Z

Akkimura: /* 【セッション】 */

==定量生物学の会　年会最新情報 ==
* Home pageを作成しました。随時、情報を掲載していきます(100521)。

== 第三回年会の概要==
===目的===
第三回年会は、過去二回の年会と同様に、定量性を高く意識した生命科学研究にかかわる研究者、およびそのような新しい方向性を模索したいと考える研究者が、具体的な方法論や技術、そして分野の方向性などをオープンな雰囲気で議論することを目的としています。「定量的な生命科学のあり方」を模索するにあたり、参加者一人一人に情報を発信していただき、情報を相互に交換することを重視したいと考えています。そのため、参加者全員に口頭発表（招待のみ）もしくはポスター発表をお願いしています。

=== プログラム企画について ===
第三回年会のプログラムを作成するにあたり、過去の年会・キャラバンの参加者の皆様からのフィードバックを元にして、既存の企画の再構成と新たな企画の立案を行いました。
さらに、新たな世話人が加わることで、これまでの企画を踏襲しながらも新しい視点や新しい人脈が導入することを目指しました。
==== 【チュートリアル】====
新機軸として、顕微鏡画像の取得や解析、微細加工技術などを自らの手で活用するための「Do It Yourself」のチュートリアルを企画しました。
過去二回の研究会で好評だった「理論生物学基礎(仮)」チュートリアルについては、新たな講師の方をお招きし、これまでとは違ったテーマと視点で講演を行って頂きます。
また、第二回年会より設けられた「実験データの統計解析法基礎(仮)」については、前回大変効果的な講義を行って下さった高木拓明さんに講演をお願いしました。
====【セッション】====
第二回年会の構成を踏襲する形で４つの口頭発表セッションを企画しております。
これまでの年会でも主要なトピックであった「細胞メカニクス」「時空間ダイナミクス」をテーマとしたセッションを設けます。
過去二回の年会で好評だった「要素技術」に関するセッションは、「工学技術と定量生物学」と題して、技術に留まらず、工学的視点から生物や解析手法を議論できるものにしたいと考えています。
さらに、第二回年会でとりあげたオミックス的な解析と定量的な解析との間をつなぐ研究についても、「大規模情報と定量生物学」として情報の取得と解析をテーマに企画しています。

もちろん今回も、参加者全員が発表するポスターセッションを行います。さらに議論が盛り上がるように時間配分等を工夫します。

ぜひ皆様の積極的な参加をお待ちしております。

==日時・場所・参加費・参加人数==
*日時：2010年11月26日(金)、11月27日(土)、11月28日(日)
*場所：東京大学生産技術研究所　[http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access/access.html] コンベンションホール
* 参加費： 1500-2500円程度を予定（懇親会での軽食代など実費）。確定次第、HP上でお知らせします。チュートリアルのみ参加の方は無料です。

* 参加上限人数
** チュートリアル：150人程度（会場の定員により）
** 年会: 120人+講演者約20名（ポスター会場のスペースにより）

== 企画プログラム ==
=== チュートリアル（11月26日開催） ===
*Do It Yourself: 環境制御、顕微鏡の構築と制御
**chair: 塚田祐基（名大）
**講演者: 五條理保（東大）、上原亮太（名大）、新井由之（北大）
*実験データの統計解析法基礎（仮）
**高木拓明（奈良医大）
*理論生物学基礎（仮）:非線形科学、情報論
**郡宏 · 伊藤浩史（お茶大）、小林徹也（東大）

=== セッション（11月27日、28日開催） ===
*工学技術と定量生物学
**chair: 木村啓志（東大）
**講演者: 津田行子（東大）、奥寛雅（東大）、竹本智子（理研）、安達泰治（京大）
*細胞メカニクスの定量生物学
**chair: 佐藤雅之（阪大）
**講演者: 上田昌宏（阪大）、谷本博一（東大）、水野大介（九大）、末次志郎（東大）
*大規模情報の定量生物学
**chair: 木村暁（遺伝研）
**講演者: 二階堂愛（理研CDB）、斉藤典子（熊大）
*時空間ダイナミクスの定量生物学
**chair: 広井賀子（慶大）
**講演者: 小林妙子（京大）、西丸広史（筑波大）、鈴木孝幸（東北大）・森下喜弘（九州大）、篠原恭介（大阪大）・高松敦子（早稲田大）

===ポスターセッション（11月27日、28日開催） ===

=== その他の企画（11月27日開催） ===
*ポスターガイド
** ポスターのセクション分けなどの説明
*懇親会
** ポスターセッション会場と併設。

==発表形式==
* 口頭発表
** 個別にご案内します。
* 一般参加者の発表
** 原則的に'''ポスター発表をお願いします'''。
** ポスター発表の目的は、参加者がお互いに何をやっているのか、もしくは、参加者のお互いの顔がわかるようにすることです。発表できるような結果が出ていない学生や、研究室の都合で詳細な内容を発表できない参加者も想定されますが、そのような場合は、自分が何をやりたいかを説明するようなポスター発表でも構いません。過去の年会においても研究提案中心のポスターがありましたし、ぜひ積極的にご参加ください。

== 第三回年会企画・運営 (あいうえお順)==
*木村　暁(遺伝研)
*黒澤　元(東京大学)
*小林徹也(東京大学)
*佐藤雅之(大阪大学)
*杉村　薫(理化学研究所)
*塚田祐基(名古屋大学)
*広井賀子(慶應義塾大学)
*舟橋　啓(慶應義塾大学)

== スポンサー==
本年会の開催費の一部は、文部科学省新学術領域研究「遺伝情報発現・収納・継承の時空間場（遺伝情報場）」と「哺乳類初期発生の細胞コミュニティー」からサポートをうけています。

「遺伝情報場」は染色体やその周辺環境の動態・物性など新たな観点から遺伝情報制御を捉える研究を展開しており、関連分野での若手研究者の活躍を応援します。

「細胞コミュニティ」は、哺乳類初期発生を、細胞、分子をはじめとする様々な視点から解析する研究を進めています。哺乳類に特徴的な調節性に富んだ発生を理解する為にもライブイメージング、画像解析、数理解析などを積極的に取り入れていきます。特に若く柔軟な研究者の分野を超えた活躍に期待しています。

== 問い合わせ先 ==
Email:q.bio2010 at gmail.com
（迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください）

定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-08-20T04:04:42Z

Akkimura: /* プログラム企画について */

==定量生物学の会　年会最新情報 ==
* Home pageを作成しました。随時、情報を掲載していきます(100521)。

== 第三回年会の概要==
===目的===
第三回年会は、過去二回の年会と同様に、定量性を高く意識した生命科学研究にかかわる研究者、およびそのような新しい方向性を模索したいと考える研究者が、具体的な方法論や技術、そして分野の方向性などをオープンな雰囲気で議論することを目的としています。「定量的な生命科学のあり方」を模索するにあたり、参加者一人一人に情報を発信していただき、情報を相互に交換することを重視したいと考えています。そのため、参加者全員に口頭発表（招待のみ）もしくはポスター発表をお願いしています。

=== プログラム企画について ===
第三回年会のプログラムを作成するにあたり、過去の年会・キャラバンの参加者の皆様からのフィードバックを元にして、既存の企画の再構成と新たな企画の立案を行いました。
さらに、新たな世話人が加わることで、これまでの企画を踏襲しながらも新しい視点や新しい人脈が導入することを目指しました。
==== 【チュートリアル】====
新機軸として、顕微鏡画像の取得や解析、微細加工技術などを自らの手で活用するための「Do It Yourself」のチュートリアルを企画しました。
過去二回の研究会で好評だった「理論生物学基礎(仮)」チュートリアルについては、新たな講師の方をお招きし、これまでとは違ったテーマと視点で講演を行って頂きます。
また、第二回年会より設けられた「実験データの統計解析法基礎(仮)」については、前回大変効果的な講義を行って下さった高木拓明さんに講演をお願いしました。
====【セッション】====
第二回年会の構成を踏襲する形で４つの口頭発表セッションを企画しております。
これまでの年会でも主要なトピックであった「細胞メカニクス」「時空間ダイナミクス」をテーマとしたセッションを設けます。
過去二回の年会で好評だった「要素技術」に関するセッションは、「工学技術と定量生物学」と題して、技術に留まらず、工学的視点から生物や解析手法を議論できるものにしたいと考えています。
さらに、第二回年会でとりあげたオミックス的な解析と定量的な解析との間をつなぐ研究についても、「大規模情報と定量生物学」として情報の取得と解析をテーマに企画しています。
もちろん今回も、参加者全員が発表するポスターセッションを行います。さらに議論が盛り上がるように時間配分等を工夫します。

ぜひ皆様の積極的な参加をお待ちしております。

==日時・場所・参加費・参加人数==
*日時：2010年11月26日(金)、11月27日(土)、11月28日(日)
*場所：東京大学生産技術研究所　[http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access/access.html] コンベンションホール
* 参加費： 1500-2500円程度を予定（懇親会での軽食代など実費）。確定次第、HP上でお知らせします。チュートリアルのみ参加の方は無料です。

* 参加上限人数
** チュートリアル：150人程度（会場の定員により）
** 年会: 120人+講演者約20名（ポスター会場のスペースにより）

== 企画プログラム ==
=== チュートリアル（11月26日開催） ===
*Do It Yourself: 環境制御、顕微鏡の構築と制御
**chair: 塚田祐基（名大）
**講演者: 五條理保（東大）、上原亮太（名大）、新井由之（北大）
*実験データの統計解析法基礎（仮）
**高木拓明（奈良医大）
*理論生物学基礎（仮）:非線形科学、情報論
**郡宏 · 伊藤浩史（お茶大）、小林徹也（東大）

=== セッション（11月27日、28日開催） ===
*工学技術と定量生物学
**chair: 木村啓志（東大）
**講演者: 津田行子（東大）、奥寛雅（東大）、竹本智子（理研）、安達泰治（京大）
*細胞メカニクスの定量生物学
**chair: 佐藤雅之（阪大）
**講演者: 上田昌宏（阪大）、谷本博一（東大）、水野大介（九大）、末次志郎（東大）
*大規模情報の定量生物学
**chair: 木村暁（遺伝研）
**講演者: 二階堂愛（理研CDB）、斉藤典子（熊大）
*時空間ダイナミクスの定量生物学
**chair: 広井賀子（慶大）
**講演者: 小林妙子（京大）、西丸広史（筑波大）、鈴木孝幸（東北大）・森下喜弘（九州大）、篠原恭介（大阪大）・高松敦子（早稲田大）

===ポスターセッション（11月27日、28日開催） ===

=== その他の企画（11月27日開催） ===
*ポスターガイド
** ポスターのセクション分けなどの説明
*懇親会
** ポスターセッション会場と併設。

==発表形式==
* 口頭発表
** 個別にご案内します。
* 一般参加者の発表
** 原則的に'''ポスター発表をお願いします'''。
** ポスター発表の目的は、参加者がお互いに何をやっているのか、もしくは、参加者のお互いの顔がわかるようにすることです。発表できるような結果が出ていない学生や、研究室の都合で詳細な内容を発表できない参加者も想定されますが、そのような場合は、自分が何をやりたいかを説明するようなポスター発表でも構いません。過去の年会においても研究提案中心のポスターがありましたし、ぜひ積極的にご参加ください。

== 第三回年会企画・運営 (あいうえお順)==
*木村　暁(遺伝研)
*黒澤　元(東京大学)
*小林徹也(東京大学)
*佐藤雅之(大阪大学)
*杉村　薫(理化学研究所)
*塚田祐基(名古屋大学)
*広井賀子(慶應義塾大学)
*舟橋　啓(慶應義塾大学)

== スポンサー==
本年会の開催費の一部は、文部科学省新学術領域研究「遺伝情報発現・収納・継承の時空間場（遺伝情報場）」と「哺乳類初期発生の細胞コミュニティー」からサポートをうけています。

「遺伝情報場」は染色体やその周辺環境の動態・物性など新たな観点から遺伝情報制御を捉える研究を展開しており、関連分野での若手研究者の活躍を応援します。

「細胞コミュニティ」は、哺乳類初期発生を、細胞、分子をはじめとする様々な視点から解析する研究を進めています。哺乳類に特徴的な調節性に富んだ発生を理解する為にもライブイメージング、画像解析、数理解析などを積極的に取り入れていきます。特に若く柔軟な研究者の分野を超えた活躍に期待しています。

== 問い合わせ先 ==
Email:q.bio2010 at gmail.com
（迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください）

定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-08-20T04:04:04Z

Akkimura: /* 目的 */

==定量生物学の会　年会最新情報 ==
* Home pageを作成しました。随時、情報を掲載していきます(100521)。

== 第三回年会の概要==
===目的===
第三回年会は、過去二回の年会と同様に、定量性を高く意識した生命科学研究にかかわる研究者、およびそのような新しい方向性を模索したいと考える研究者が、具体的な方法論や技術、そして分野の方向性などをオープンな雰囲気で議論することを目的としています。「定量的な生命科学のあり方」を模索するにあたり、参加者一人一人に情報を発信していただき、情報を相互に交換することを重視したいと考えています。そのため、参加者全員に口頭発表（招待のみ）もしくはポスター発表をお願いしています。

=== プログラム企画について ===
==== 【チュートリアル】====
====【セッション】====

==日時・場所・参加費・参加人数==
*日時：2010年11月26日(金)、11月27日(土)、11月28日(日)
*場所：東京大学生産技術研究所　[http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access/access.html] コンベンションホール
* 参加費： 1500-2500円程度を予定（懇親会での軽食代など実費）。確定次第、HP上でお知らせします。チュートリアルのみ参加の方は無料です。

* 参加上限人数
** チュートリアル：150人程度（会場の定員により）
** 年会: 120人+講演者約20名（ポスター会場のスペースにより）

== 企画プログラム ==
=== チュートリアル（11月26日開催） ===
*Do It Yourself: 環境制御、顕微鏡の構築と制御
**chair: 塚田祐基（名大）
**講演者: 五條理保（東大）、上原亮太（名大）、新井由之（北大）
*実験データの統計解析法基礎（仮）
**高木拓明（奈良医大）
*理論生物学基礎（仮）:非線形科学、情報論
**郡宏 · 伊藤浩史（お茶大）、小林徹也（東大）

=== セッション（11月27日、28日開催） ===
*工学技術と定量生物学
**chair: 木村啓志（東大）
**講演者: 津田行子（東大）、奥寛雅（東大）、竹本智子（理研）、安達泰治（京大）
*細胞メカニクスの定量生物学
**chair: 佐藤雅之（阪大）
**講演者: 上田昌宏（阪大）、谷本博一（東大）、水野大介（九大）、末次志郎（東大）
*大規模情報の定量生物学
**chair: 木村暁（遺伝研）
**講演者: 二階堂愛（理研CDB）、斉藤典子（熊大）
*時空間ダイナミクスの定量生物学
**chair: 広井賀子（慶大）
**講演者: 小林妙子（京大）、西丸広史（筑波大）、鈴木孝幸（東北大）・森下喜弘（九州大）、篠原恭介（大阪大）・高松敦子（早稲田大）

===ポスターセッション（11月27日、28日開催） ===

=== その他の企画（11月27日開催） ===
*ポスターガイド
** ポスターのセクション分けなどの説明
*懇親会
** ポスターセッション会場と併設。

==発表形式==
* 口頭発表
** 個別にご案内します。
* 一般参加者の発表
** 原則的に'''ポスター発表をお願いします'''。
** ポスター発表の目的は、参加者がお互いに何をやっているのか、もしくは、参加者のお互いの顔がわかるようにすることです。発表できるような結果が出ていない学生や、研究室の都合で詳細な内容を発表できない参加者も想定されますが、そのような場合は、自分が何をやりたいかを説明するようなポスター発表でも構いません。過去の年会においても研究提案中心のポスターがありましたし、ぜひ積極的にご参加ください。

== 第三回年会企画・運営 (あいうえお順)==
*木村　暁(遺伝研)
*黒澤　元(東京大学)
*小林徹也(東京大学)
*佐藤雅之(大阪大学)
*杉村　薫(理化学研究所)
*塚田祐基(名古屋大学)
*広井賀子(慶應義塾大学)
*舟橋　啓(慶應義塾大学)

== スポンサー==
本年会の開催費の一部は、文部科学省新学術領域研究「遺伝情報発現・収納・継承の時空間場（遺伝情報場）」と「哺乳類初期発生の細胞コミュニティー」からサポートをうけています。

「遺伝情報場」は染色体やその周辺環境の動態・物性など新たな観点から遺伝情報制御を捉える研究を展開しており、関連分野での若手研究者の活躍を応援します。

「細胞コミュニティ」は、哺乳類初期発生を、細胞、分子をはじめとする様々な視点から解析する研究を進めています。哺乳類に特徴的な調節性に富んだ発生を理解する為にもライブイメージング、画像解析、数理解析などを積極的に取り入れていきます。特に若く柔軟な研究者の分野を超えた活躍に期待しています。

== 問い合わせ先 ==
Email:q.bio2010 at gmail.com
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定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-08-18T00:30:26Z

Akkimura: /* セッション（11月27日、28日開催） */

==定量生物学の会　年会最新情報 ==
* Home pageを作成しました。随時、情報を掲載していきます(100521)。

== 第三回年会の概要==
===目的===
第三回年会は、定量性を高く意識した生命科学研究にかかわる研究者、およびそのような新しい方向性を模索したいと考える研究者が、具体的な方法論や技術、そして分野の方向性などをオープンな雰囲気で議論することを目的としています。「定量的な生命科学のあり方」を模索するにあたり、参加者一人一人に情報を発信していただき、情報を相互に交換することを重視したいと考えています。そのため、原則的に、口頭発表もしくはポスター発表をお願いするという形式を採用します。

=== プログラム企画について ===
==== 【チュートリアル】====
====【セッション】====

==日時・場所・参加費・参加人数==
*日時：2010年11月26日(金)、11月27日(土)、11月28日(日)
*場所：東京大学生産技術研究所　[http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access/access.html] コンベンションホール
* 参加費： 1500-2500円程度を予定（懇親会での軽食代など実費）。確定次第、HP上でお知らせします。チュートリアルのみ参加の方は無料です。

* 参加上限人数
** チュートリアル：150人程度（会場の定員により）
** 年会: 120人+講演者約20名（ポスター会場のスペースにより）

== 企画プログラム ==
=== チュートリアル（11月26日開催） ===
*Do It Yourself: 環境制御、顕微鏡の構築と制御
**chair: 塚田祐基（名大）
**講演者: 五條理保（東大）、上原亮太（名大）、新井由之（北大）
*実験データの統計解析法基礎（仮）
**高木拓明（奈良医大）
*理論生物学基礎（仮）:非線形科学、情報論
**郡宏 · 伊藤浩史（お茶大）、小林徹也（東大）

=== セッション（11月27日、28日開催） ===
*工学技術と定量生物学
**chair: 木村啓志（東大）
**講演者: 津田行子（東大）、奥寛雅（東大）、竹本智子（理研）、安達泰治（京大）
*細胞メカニクスの定量生物学
**chair: 佐藤雅之（阪大）
**講演者: 上田昌宏（阪大）、谷本博一（東大）、水野大介（九大）、末次志郎（東大）
*大規模情報の定量生物学
**chair: 木村暁（遺伝研）
**講演者: 二階堂愛（理研CDB）、斉藤典子（熊大）
*時空間ダイナミクスの定量生物学
**chair: 広井賀子（慶大）
**講演者: 小林妙子（京大）、西丸広史（筑波大）、鈴木孝幸（東北大）・森下喜弘（九州大）、篠原恭介（大阪大）・高松敦子（早稲田大）

===ポスターセッション（11月27日、28日開催） ===

=== その他の企画（11月27日開催） ===
*ポスターガイド
** ポスターのセクション分けなどの説明
*懇親会
** ポスターセッション会場と併設。

==発表形式==
* 口頭発表
** 個別にご案内します。
* 一般参加者の発表
** 原則的に'''ポスター発表をお願いします'''。
** ポスター発表の目的は、参加者がお互いに何をやっているのか、もしくは、参加者のお互いの顔がわかるようにすることです。発表できるような結果が出ていない学生や、研究室の都合で詳細な内容を発表できない参加者も想定されますが、そのような場合は、自分が何をやりたいかを説明するようなポスター発表でも構いません。過去の年会においても研究提案中心のポスターがありましたし、ぜひ積極的にご参加ください。

== 第三回年会企画・運営 (あいうえお順)==
*木村　暁(遺伝研)
*黒澤　元(東京大学)
*小林徹也(東京大学)
*佐藤雅之(大阪大学)
*杉村　薫(理化学研究所)
*塚田祐基(名古屋大学)
*広井賀子(慶應義塾大学)
*舟橋　啓(慶應義塾大学)

== スポンサー==
本年会の開催費の一部は、文部科学省新学術領域研究「遺伝情報発現・収納・継承の時空間場（遺伝情報場）」と「哺乳類初期発生の細胞コミュニティー」からサポートをうけています。

「遺伝情報場」は染色体やその周辺環境の動態・物性など新たな観点から遺伝情報制御を捉える研究を展開しており、関連分野での若手研究者の活躍を応援します。

「細胞コミュニティ」は、哺乳類初期発生を、細胞、分子をはじめとする様々な視点から解析する研究を進めています。哺乳類に特徴的な調節性に富んだ発生を理解する為にもライブイメージング、画像解析、数理解析などを積極的に取り入れていきます。特に若く柔軟な研究者の分野を超えた活躍に期待しています。

== 問い合わせ先 ==
Email:q.bio2010 at gmail.com
（迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください）

定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-08-08T14:28:27Z

Akkimura: /* セッション（11月27日、28日開催） */

==定量生物学の会　年会最新情報 ==
* Home pageを作成しました。随時、情報を掲載していきます(100521)。

== 第三回年会の概要==
===目的===
第三回年会は、定量性を高く意識した生命科学研究にかかわる研究者、およびそのような新しい方向性を模索したいと考える研究者が、具体的な方法論や技術、そして分野の方向性などをオープンな雰囲気で議論することを目的としています。「定量的な生命科学のあり方」を模索するにあたり、参加者一人一人に情報を発信していただき、情報を相互に交換することを重視したいと考えています。そのため、原則的に、口頭発表もしくはポスター発表をお願いするという形式を採用します。

=== プログラム企画について ===
==== 【チュートリアル】====
====【セッション】====

==日時・場所・参加費・参加人数==
*日時：2010年11月26日(金)、11月27日(土)、11月28日(日)
*場所：東京大学生産技術研究所　[http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access/access.html] コンベンションホール
* 参加費： 1500-2500円程度を予定（懇親会での軽食代など実費）。確定次第、HP上でお知らせします。チュートリアルのみ参加の方は無料です。

* 参加上限人数
** チュートリアル：150人程度（会場の定員により）
** 年会: 120人+講演者約20名（ポスター会場のスペースにより）

== 企画プログラム ==
=== チュートリアル（11月26日開催） ===
*Do It Yourself: 環境制御、顕微鏡の構築と制御
**chair: 塚田祐基（名大）
**講演者: 五條理保（東大）、上原亮太（名大）、新井由之（北大）
*実験データの統計解析法基礎（仮）
**高木拓明（奈良医大）
*理論生物学基礎（仮）:非線形科学、情報論
**郡宏 · 伊藤浩史（お茶大）、小林徹也（東大）

=== セッション（11月27日、28日開催） ===
*工学技術と定量生物学
**chair: 木村啓志（東大）
**講演者: 津田行子（東大）、奥寛雅（東大）、竹本智子（理研）、安達泰治（京大）
*細胞メカニクスの定量生物学
**chair: 佐藤雅之（阪大）
**講演者: 谷本博一（東大）、水野大介（九大）、末次志郎（東大）、TBA
*大規模情報の定量生物学
**chair: 木村暁（遺伝研）
**講演者: 二階堂愛（理研CDB）、斉藤典子（熊大）
*時空間ダイナミクスの定量生物学
**chair: 広井賀子（慶大）
**講演者: 小林妙子（京大）、西丸広史（筑波大）、鈴木孝幸（東北大）・森下喜弘（九州大）、篠原恭介（大阪大）・高松敦子（早稲田大）

===ポスターセッション（11月27日、28日開催） ===

=== その他の企画（11月27日開催） ===
*ポスターガイド
** ポスターのセクション分けなどの説明
*懇親会
** ポスターセッション会場と併設。

==発表形式==
* 口頭発表
** 個別にご案内します。
* 一般参加者の発表
** 原則的に'''ポスター発表をお願いします'''。
** ポスター発表の目的は、参加者がお互いに何をやっているのか、もしくは、参加者のお互いの顔がわかるようにすることです。発表できるような結果が出ていない学生や、研究室の都合で詳細な内容を発表できない参加者も想定されますが、そのような場合は、自分が何をやりたいかを説明するようなポスター発表でも構いません。過去の年会においても研究提案中心のポスターがありましたし、ぜひ積極的にご参加ください。

== 第三回年会企画・運営 (あいうえお順)==
*木村　暁(遺伝研)
*黒澤　元(東京大学)
*小林徹也(東京大学)
*佐藤雅之(大阪大学)
*杉村　薫(理化学研究所)
*塚田祐基(名古屋大学)
*広井賀子(慶應義塾大学)
*舟橋　啓(慶應義塾大学)

== スポンサー==
本年会の開催費の一部は、文部科学省新学術領域研究「遺伝情報発現・収納・継承の時空間場（遺伝情報場）」と「哺乳類初期発生の細胞コミュニティー」からサポートをうけています。

「遺伝情報場」は染色体やその周辺環境の動態・物性など新たな観点から遺伝情報制御を捉える研究を展開しており、関連分野での若手研究者の活躍を応援します。

「細胞コミュニティ」は、哺乳類初期発生を、細胞、分子をはじめとする様々な視点から解析する研究を進めています。哺乳類に特徴的な調節性に富んだ発生を理解する為にもライブイメージング、画像解析、数理解析などを積極的に取り入れていきます。特に若く柔軟な研究者の分野を超えた活躍に期待しています。

== 問い合わせ先 ==
Email:q.bio2010 at gmail.com
（迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください）

定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-08-06T04:27:16Z

Akkimura: /* スポンサー */

==定量生物学の会　年会最新情報 ==
* Home pageを作成しました。随時、情報を掲載していきます(100521)。

== 第三回年会の概要==
===目的===
第三回年会は、定量性を高く意識した生命科学研究にかかわる研究者、およびそのような新しい方向性を模索したいと考える研究者が、具体的な方法論や技術、そして分野の方向性などをオープンな雰囲気で議論することを目的としています。「定量的な生命科学のあり方」を模索するにあたり、参加者一人一人に情報を発信していただき、情報を相互に交換することを重視したいと考えています。そのため、原則的に、口頭発表もしくはポスター発表をお願いするという形式を採用します。

=== プログラム企画について ===
==== 【チュートリアル】====
====【セッション】====

==日時・場所・参加費・参加人数==
*日時：2010年11月26日(金)、11月27日(土)、11月28日(日)
*場所：東京大学生産技術研究所　[http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access/access.html] コンベンションホール
* 参加費： 1500-2500円程度を予定（懇親会での軽食代など実費）。確定次第、HP上でお知らせします。チュートリアルのみ参加の方は無料です。

* 参加上限人数
** チュートリアル：150人程度（会場の定員により）
** 年会: 120人+講演者約20名（ポスター会場のスペースにより）

== 企画プログラム ==
=== チュートリアル（11月26日開催） ===
*Do It Yourself: 環境制御、顕微鏡の構築と制御
**chair: 塚田祐基（名大）
**講演者: 五條理保（東大）、上原亮太（名大）、新井由之（北大）
*実験データの統計解析法基礎（仮）
**高木拓明（奈良医大）
*理論生物学基礎（仮）:非線形科学、情報論
**郡宏 · 伊藤浩史（お茶大）、小林徹也（東大）

=== セッション（11月27日、28日開催） ===
*工学技術と定量生物学
**chair: 木村啓志（東大）
**講演者: 津田行子（東大）、奥寛雅（東大）、竹本智子（理研）、安達泰治（京大）
*細胞メカニクスの定量生物学
**chair: 佐藤雅之（阪大）
**講演者: 谷本博一（東大）、水野大介（九大）、末次志郎（東大）、TBA
*大規模情報の定量生物学
**chair: 木村暁（遺伝研）
**講演者: 二階堂愛（理研CDB）、斉藤典子（熊大）
*時空間ダイナミクスの定量生物学
**chair: 広井賀子（慶大）
**講演者: 小林妙子（京大）、西丸広史（筑波大）、鈴木孝幸（東北大）・、篠原恭介（大阪大）・高松敦子（早稲田大）

===ポスターセッション（11月27日、28日開催） ===

=== その他の企画（11月27日開催） ===
*ポスターガイド
** ポスターのセクション分けなどの説明
*懇親会
** ポスターセッション会場と併設。

==発表形式==
* 口頭発表
** 個別にご案内します。
* 一般参加者の発表
** 原則的に'''ポスター発表をお願いします'''。
** ポスター発表の目的は、参加者がお互いに何をやっているのか、もしくは、参加者のお互いの顔がわかるようにすることです。発表できるような結果が出ていない学生や、研究室の都合で詳細な内容を発表できない参加者も想定されますが、そのような場合は、自分が何をやりたいかを説明するようなポスター発表でも構いません。過去の年会においても研究提案中心のポスターがありましたし、ぜひ積極的にご参加ください。

== 第三回年会企画・運営 (あいうえお順)==
*木村　暁(遺伝研)
*黒澤　元(東京大学)
*小林徹也(東京大学)
*佐藤雅之(大阪大学)
*杉村　薫(理化学研究所)
*塚田祐基(名古屋大学)
*広井賀子(慶應義塾大学)
*舟橋　啓(慶應義塾大学)

== スポンサー==
本年会の開催費の一部は、文部科学省新学術領域研究「遺伝情報発現・収納・継承の時空間場（遺伝情報場）」と「哺乳類初期発生の細胞コミュニティー」からサポートをうけています。

「遺伝情報場」は染色体やその周辺環境の動態・物性など新たな観点から遺伝情報制御を捉える研究を展開しており、関連分野での若手研究者の活躍を応援します。

「細胞コミュニティ」は、哺乳類初期発生を、細胞、分子をはじめとする様々な視点から解析する研究を進めています。哺乳類に特徴的な調節性に富んだ発生を理解する為にもライブイメージング、画像解析、数理解析などを積極的に取り入れていきます。特に若く柔軟な研究者の分野を超えた活躍に期待しています。

== 問い合わせ先 ==
Email:q.bio2010 at gmail.com
（迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください）

Main Page

2010-05-21T05:05:11Z

Akkimura: /* 最新情報 */

== 定量生物学の会へようこそ ==
定量生物学の会は、定量的な解析から生命システムの定性的な性質を明らかにする生命科学の方向性や解決すべき点などを具体的な問題設定のもとで議論する場です。さらに、領域横断的な研究体制や連携関係を、若手研究者（学生、PD、若手PI）を中心にボトムアップで模索することを目指しています。年齢や職位に関係なく、会の趣旨に賛同して下さったり、会の活動に興味を持って下さるみなさまの参加をお待ちしております。

== イベント情報 ==
[[events|過去のイベント情報はこちら]]

==最新情報 ==
*[[定量生物学の会第三回年会 (2010/11)]]は、2010年11月26-28日に東京大学生産技術研究所で行います。
*[[Documents|Documents page]]を更新しました。
*[[年会2010アンケート|第二回年会アンケート結果]]を掲載しました。
*年会の要旨登録をまだ済まされていない方は、なるべく早く、メールでお知らせした要旨登録フォームにて手続きを進めていただきますようよろしくお願い致します。
*[[第二回年会|第二回年会]]のポスター発表の要旨登録を開始しました。締め切りは12月15日です。
*第二回年会は定員を超えたため参加登録を締め切りました。
*[[第二回年会|第二回年会]]のレジストレーションを開始しました。
*[[News|News page]] を更新しました。。東京大学黒田研特任助教募集のお知らせ。
*[[News|News page]] を更新しました。Biology/Genetics/Evolution Postdoctoral Fellow Position (Fred Hutchinson Cancer Research Center)のお知らせ。
*第二回年会の企画プログラムの一部を掲載しました。[[第二回年会|第二回年会のページ]]
* [[日本バイオインフォマティクス学会、定量生物学の会　共催夏の学校2009]]のページを作成しました。
*[[News|News page]] を更新しました。京都大学生命科学研究科特別講義のお知らせ。
*[[News|News page]] を更新しました。東京大学黒田研博士研究員（ポスドク）募集のお知らせ。
*[[第二回年会]]のページを作成しました。随時、情報を掲載していきます。
*[[News|News page]] を更新しました。光イメージング若手研究会「光塾」のお知らせ。
*定量生物学に関わる研究者間の情報交換を促進するために、新しく [[News|News page]] を設けました。
*第１回年会の写真とアンケート結果を掲載しました。
*第１回キャラバン＠遺伝研のポスター発表申し込み受付期間を２／２７まで延長しました。なお、画像解析ケーススタディーのサンプル画像提供は締め切りました。
*第１回キャラバン＠遺伝研の情報を更新しました。発表申し込み方法も掲載されています。
*年会の要旨登録をまだ済まされていない方は、なるべく早く、要旨登録ページにて手続きを進めていただきますようよろしくお願い致します。
*年会の要旨登録を開始しました。締め切りは１２月１２日です。参加登録者のみなさんには改めてメールでお知らせします。
*'''申し訳ありませんが、年会・ワークショップ・チュートリアルは定員を超えたため参加登録を締め切りました。''
*'年会は定員まであと残りわずかです。年会参加を希望する方は登録をお急ぎください'
*第一回年会のレジストレーションを開始しました。
*ホームページをwww.q-bio.jp, q-bio.jpとして公開しました。
*ホームページのたたき台を作成しました。
*ホームページをアップしました。

定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-05-21T05:02:28Z

Akkimura: /* 日時・場所 */

==第三回年会の日時・場所 ==
*日時：2010年11月26日(金)、11月27日(土)、11月28日(日)
*場所：東京大学生産技術研究所　[http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access/access.html] コンベンションホール

定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-05-21T05:02:09Z

Akkimura: /* 定量生物学の会　年会最新情報 */

==日時・場所 ==
*日時：2010年11月26日(金)、11月27日(土)、11月28日(日)
*場所：東京大学生産技術研究所　[http://www.iis.u-tokyo.ac.jp/access/access.html] コンベンションホール

定量生物学の会第三回年会 (2010/11)

2010-05-21T04:52:50Z

Akkimura: Created page with '==定量生物学の会　年会最新情報 == *第三回年会のページを作成し、日時などを掲載しました。東京でお会いできることを楽しみに…'

==定量生物学の会　年会最新情報 ==
*第三回年会のページを作成し、日時などを掲載しました。東京でお会いできることを楽しみにしております（100521）。

Events

2010-05-21T04:51:00Z

Akkimura: /* 定量生物学の会主催の公式研究会 */

== 最新のイベント情報 ==
=== 定量生物学の会主催の公式研究会 ===
* [[定量生物学の会第三回年会 (2010/11)]]

=== 定量生物学の会のメンバー主催のイベント ===

== 過去の研究会情報 ==
=== 終了した定量生物学の会主催の公式研究会 ===
*定量生物学の会年会
** [[第一回年会|第一回年会(2009/1)]]
** [[第二回年会|第二回年会(2010/1)]]
*定量生物学の会キャラバン
** [[第一回キャラバン]] at 遺伝研
*定量生物学の会準備会
** [[第一回定量生物学の会準備会プログラム|第一回準備会]]
** [[第二回定量生物学の会準備会プログラム|第二回準備会]]
* その他の研究会・夏の学校
** [[日本バイオインフォマティクス学会、定量生物学の会　共催夏の学校2009]]

=== 終了した定量生物学の会のメンバー主催のイベント ===
* 生物数理モデル入門～生物への数理工学的アプローチ～
**小林徹也（東京大学生産技術研究所）
** １２月０４日（木）～１月１５日（木）:木曜日の１６：３０～１８：００
** 東京大学駒場キャンパス１号館１０６号室
** 詳細は[http://research.crmind.net/2008/11/post-9.php]をご覧ください。

*北海道大学理学院生命理学専攻および生命科学院　発生進化学特論
**杉村薫（理研）
**2008年10月30日1限目2限目
**1. 個体発生における力学過程の概論
**2. 上皮形態形成を支える機械的な力の研究ー実験と理論を融合させて生物システムを理解する

*東京大学農学生命情報科学特論II（アグリバイオインフォマティクスセミナー）
**舟橋啓、小林徹也
**システムバイオロジーの最前線：定量生物学から計算生物学まで
**10/23(木):15:00-18:45
**農学部２号館２階第１講義室（化１）
**http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/main_seminar.html

定量生物学の会第三回年会

2010-05-21T04:49:42Z

Akkimura: Created page with '==定量生物学の会　年会最新情報 == *第二回年会のページを作成し、日時などを掲載しました。東京でお会いできることを楽しみに…'

==定量生物学の会　年会最新情報 ==
*第二回年会のページを作成し、日時などを掲載しました。東京でお会いできることを楽しみにしております（100521）。

Events

2010-05-21T04:48:03Z

Akkimura: /* 定量生物学の会主催の公式研究会 */

== 最新のイベント情報 ==
=== 定量生物学の会主催の公式研究会 ===
* [[定量生物学の会第三回年会]]

=== 定量生物学の会のメンバー主催のイベント ===

== 過去の研究会情報 ==
=== 終了した定量生物学の会主催の公式研究会 ===
*定量生物学の会年会
** [[第一回年会|第一回年会(2009/1)]]
** [[第二回年会|第二回年会(2010/1)]]
*定量生物学の会キャラバン
** [[第一回キャラバン]] at 遺伝研
*定量生物学の会準備会
** [[第一回定量生物学の会準備会プログラム|第一回準備会]]
** [[第二回定量生物学の会準備会プログラム|第二回準備会]]
* その他の研究会・夏の学校
** [[日本バイオインフォマティクス学会、定量生物学の会　共催夏の学校2009]]

=== 終了した定量生物学の会のメンバー主催のイベント ===
* 生物数理モデル入門～生物への数理工学的アプローチ～
**小林徹也（東京大学生産技術研究所）
** １２月０４日（木）～１月１５日（木）:木曜日の１６：３０～１８：００
** 東京大学駒場キャンパス１号館１０６号室
** 詳細は[http://research.crmind.net/2008/11/post-9.php]をご覧ください。

*北海道大学理学院生命理学専攻および生命科学院　発生進化学特論
**杉村薫（理研）
**2008年10月30日1限目2限目
**1. 個体発生における力学過程の概論
**2. 上皮形態形成を支える機械的な力の研究ー実験と理論を融合させて生物システムを理解する

*東京大学農学生命情報科学特論II（アグリバイオインフォマティクスセミナー）
**舟橋啓、小林徹也
**システムバイオロジーの最前線：定量生物学から計算生物学まで
**10/23(木):15:00-18:45
**農学部２号館２階第１講義室（化１）
**http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/main_seminar.html

第一回キャラバン

2008-10-06T01:25:39Z

Akkimura: /* 日程・場所・参加費 */

== 第一回キャラバン at 遺伝研 ==
=== 概要と目的===
　「定量生物の会」のメンバーと開催研究機関の研究者を中心とした外部の研究者との議論を通じて、　「定量生物」学の更なる発展と共同研究の可能性を探る研究会です。

　「定量生物」学の最新の研究について報告・討論するとともに、　チュートリアルの部も設け、実験生物学者が物理的な思考や数理的な解析手法を取り入れるために必要な基礎的な知識を提供します。

　研究会の詳細な内容については随時このページを更新してお知らせします。

=== 日程・場所・参加費===
* 会場：国立遺伝学研究所（静岡県三島市）
* 開催日： 2009年3月13日(金)−14日(土)
* 参加費：無料（懇親会代は別）の予定です。
* 発表形式: 一般発表はすべてポスター発表とします。

=== 講演者（決定済み）===
*チュートリアル
**木村　暁（遺伝研）
**小林　徹也（東京大）
**柴田　達夫（広島大）
**杉村　薫（理研）
*講演
**荒田　幸信（理研CDB）
**小曽戸　陽一（理研CDB）
**柴田　達夫（広島大）
**鈴木　誉保（理研CDB）
**塚田　祐基（奈良先端大）
**若本　祐一（東京大）

=== 問い合わせ先===
*木村　暁（遺伝研） (akkimura at lab.nig.ac.jp)
*杉村　薫（理研） (kaolu.s at gmail.com )
　　（迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください）

第一回キャラバン

2008-10-06T01:25:18Z

Akkimura: /* 概要と目的 */

== 第一回キャラバン at 遺伝研 ==
=== 概要と目的===
　「定量生物の会」のメンバーと開催研究機関の研究者を中心とした外部の研究者との議論を通じて、　「定量生物」学の更なる発展と共同研究の可能性を探る研究会です。

　「定量生物」学の最新の研究について報告・討論するとともに、　チュートリアルの部も設け、実験生物学者が物理的な思考や数理的な解析手法を取り入れるために必要な基礎的な知識を提供します。

　研究会の詳細な内容については随時このページを更新してお知らせします。

=== 日程・場所・参加費===
* 会場：国立遺伝学研究所
* 開催日： 2009年3月13日(金)−14日(土)
* 参加費：無料（懇親会代は別）の予定です。
* 発表形式: 一般発表はすべてポスター発表とします。

=== 講演者（決定済み）===
*チュートリアル
**木村　暁（遺伝研）
**小林　徹也（東京大）
**柴田　達夫（広島大）
**杉村　薫（理研）
*講演
**荒田　幸信（理研CDB）
**小曽戸　陽一（理研CDB）
**柴田　達夫（広島大）
**鈴木　誉保（理研CDB）
**塚田　祐基（奈良先端大）
**若本　祐一（東京大）

=== 問い合わせ先===
*木村　暁（遺伝研） (akkimura at lab.nig.ac.jp)
*杉村　薫（理研） (kaolu.s at gmail.com )
　　（迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください）

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