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From Japanese society for quantitative biology
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=== 研究費などのお知らせ ===
 
=== 研究費などのお知らせ ===
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==== <span style="color: red">New!! </span>2020年度 CREST・さきがけ・ACT-X公募スケジュールについて====
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公募のスケジュール
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JSTは、戦略目標の達成に向けた研究領域及び研究総括を選定し、以下のスケジュールで戦略的創造研究推進事業(CREST・さきがけ・ACT-X)の2020年度研究課題の公募・選定等を行う予定です。
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2020年度の研究課題の公募・選定は、2018年度、2019年度に発足した研究領域(以下、「既存研究領域」と称します)と2020年度に発足する新規研究領域(以下、「新規研究領域」と称します)とで、期間を2回に分けて行います。
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なお、本研究提案募集の予告は、国会における令和2年度政府予算の成立を前提として行っています。
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<第1期(既存研究領域)スケジュール>
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 ・3月下旬~5月中旬 研究課題の公募
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 ・5月下旬~9月中旬 研究課題の選定
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 ・10月1日(予定)  研究の開始
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<第2期(新規研究領域)スケジュール>
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 ・4月中旬~6月中旬 研究課題の公募
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 ・6月下旬~11月中旬 研究課題の選定
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 ・12月1日(予定)  研究の開始
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(注)以上のスケジュールは現時点での予定であり予告無く変更することがありますので、予めご了承ください。
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公募に関する情報は下記webページで随時更新しておりますのでご覧ください。
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https://www.jst.go.jp/kisoken/boshuu/teian.html
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●問合せ先
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 国立研究開発法人科学技術振興機構 戦略研究推進部[募集専用]
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 E-mail:rp-info@jst.go.jp 問合せは必ず左記メールアドレスにお願い致します。
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 電話番号:03-3512-3530(受付時間:10:00~12:00/13:00~17:00)
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  ※土曜日、日曜日、祝日を除く
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電話でご質問いただいた場合でも、電子メールでの対応をお願いすることがあります
  
 
==== これまでに掲載したお知らせ====
 
==== これまでに掲載したお知らせ====
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=== 研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ ===
 
=== 研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ ===
==== <span style="color: red">New!! </span>BDRシンポジウム2019参加者募集中!====
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==== <span style="color: red">New!! </span>案内:The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -:国際シンポジウム参加者およびポスター発表者の募集 ====
テーマ: Control and Design of Biosystems <br />
+
・テーマ: The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -<br/>
日時: 2019年3月25日(月)~27日(水) <br />
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・日時:  2020年2月27日(木)~28日(金)<br/>
場所: 理化学研究所 生命機能科学研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド) <br />
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・場所:  (株)国際電気通信基礎技術研究所(ATR)京都府相楽郡精華町光台二丁目2-2(けいはんな学研都市)<br/>
言語: 英語 <br />
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・言語:  英語<br/>
参加費: 無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途) <br />
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・参加費:  アカデミック参加者 無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)<br/>
昼食代: 3,000円(3日間) <br />
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・昼食代:  1,000円(28日のみ)<br/>
懇親会費: 一般5,000円/学生1,000円 <br />
+
・懇親会費:  7,000円<br/>
参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み <br />
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・参加申し込み・ポスター演題提出: ホームページより事前申し込み<br/>
締め切り: 2018年12月14日(金) <br />
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・締め切り:  2020年2月13日(木)<br/>
URL:https://www2.bdr.riken.jp/sympo/2019/ <br />
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・URL: https://human-informatix.atr.jp/ <br/>
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・内容
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近年の生命科学の分野は、従来のバイオや医学のみの概念や手法だけではなく、数理科学、計算科学、情報科学、工学、物理学などの概念や手法を取り入れ、全身全細胞全遺伝子レベルで統合的にとらえる研究が活発に行われている。
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また、これらの異分野融合的なアプローチにより、破壊的技術革新による新たな医療産業が生まれようとしている。そこで、本シンポジウムは、国内外よりシステムバイオロジー、バイオインフォマティクス、機械学習の分野で活躍するトップレベルの研究者を演者として招聘し、関連分野の最先端の研究を発表していただく。
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それにより、国内外の産官学の機関で研究開発や事業に携わる方々に当該分野の勉強および分野を超えた交流の場を提供する。さらに、本研究分野は(特に国内)現状、女性研究者が極度のUnderrepresentedである。したがって、招待講演者の半分を女性のトップレベル研究者にすることで、この分野における女性研究者の活性化(特に国内)を促進する。本シンポジウムではV-iCliniXに関連する発表を中心にプログラムを構成し、2日目にはERATO佐藤ライブ予測制御プロジェクトの最終成果を含め、様々な情報を社会に発信し報告する機会を設ける。<br/>
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・連絡先 シンポジウム事務局:tns-sec@atr.jp<br/>
  
内容・概要:
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==== <span style="color: red">New!! </span>案内:BDRシンポジウム2020:参加・演題申し込み募集中! ====
生命システムとは種々の構成要素の相互作用によって成立する動的なネットワークです。近年、複雑な生命システムの時空間的制御や要素間の協調的な動作機構の理解が急速に進展したことにより、様々な生物学的スケール(分子、細胞、組織、器官、個体等)における生命機能の「操作とデザイン」を目指す研究が盛んになりつつあります。例えば、人工的な細胞合成、胚様体やミニ臓器(オルガノイド)の作成、老化や生殖などのライフイベントへの介入や再構成、理論的あるいは工学的手法を融合させたアプローチなどの新しい試みが始まっています。これら「操作とデザイン」によるアプローチは生命の根源的理解に貢献するのみならず、医療分野に新しい領域を生む基盤となることが期待されています。
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・テーマ: Emergence in Biosystems<br/>
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・日時:  2020年3月2日(月)~4日(水)<br/>
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・場所:  理化学研究所 生命機能科学研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド)<br/>
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・言語:  英語<br/>
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・参加費:  無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)<br/>
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・昼食代:  3,000円(3日間)<br/>
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・懇親会費:  一般5,000円/学生1,000円<br/>
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・参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み<br/>
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・締め切り:  2019年12月6日(金)<br/>
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・URL: https://www2.bdr.riken.jp/sympo/2020/ <br/>
  
トピックスとしては、以下のものを予定しています。
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・トピックス:<br/>
(1) Making artificial embryos and organs
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(i) Origin of life<br/>
(2) Engineering approaches toward making artificial cells
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(ii) Protein/RNA self-assembly<br/>
(3) Artificial control of the life cycle
+
(iii) Intracellular organelle formation<br/>
(4) Theoretical analysis for identifying/controlling biosystems
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(iv) Cell assembly and organ formation<br/>
(5) Cutting-edge technology for artificial control of biosystem
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(v) Brain function and its underlying principle<br/>
  
本シンポジウムでは、世界的な研究者たちと次世代の研究を切り開く若手研究者や学生が一堂に会して議論を深めることにより、新たな知見を生み出し人的交流が促進されることを期待しております。
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本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、一部の演題には口頭発表をお願いする予定です。また、海外からの参加者(大学院生、研究員)を対象としたTravel Fellowshipを用意し、国内外からの多数の参加申込をお待ちいたしております。
  
本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、一部の演題には口頭発表をお願いする予定です。また、海外からの参加者(大学院生、研究員)を対象としたTravel Fellowshipを用意し、国内外からの多数の参加申込をお待ちいたしております。 <br />
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また、本シンポジウムに引き続き、シンシナティ小児病院オルガノイド医学研究センター(CuSTOM)との合同シンポジウム2020 RIKEN BDR-CuSTOM Joint Symposium "Integrated organoid science: Stem cells, Engineering, Medicine”を開催いたしますので、是非こちらにもあわせてご参加ください。
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https://www2.bdr.riken.jp/joint-organoid/2020/
  
連絡先:
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お問い合わせ:
BDRシンポジウム2019事務局
 
 
国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター
 
国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター
〒650-0047 神戸市中央区港島南町2-2-3  E-mail: bdr-sympo2019@ml.riken.jp
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センター長室(学術集会担当)
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E-mail: bdr-sympo2020@ml.riken.jp
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==== <span style="color: red">New!! </span>案内:RIKEN BDR-CuSTOM Joint Symposium: 参加・演題申し込み募集中!====
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・テーマ: Integrated organoid science: Stem cells, Engineering, Medicine<br/>
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・日時:  2020年3月4日(水)~5日(木)<br/>
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・場所:  理化学研究所 生命機能科学研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド)<br/>
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・言語:  英語<br/>
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・参加費:  無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)<br/>
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・昼食代: 1,000円(3月5日(木)分のみ)<br/>
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・懇親会費: 一般5,000円/学生1,000円<br/>
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・参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み<br/>
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・締め切り:  2019年12月6日(金)<br/>
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・URL: https://www2.bdr.riken.jp/joint-organoid/2020/<br/>
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・キーノードスピーカー:<br/>
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Jurgen Knoblich (Institute of Molecular Biotechnology, Austria)
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Masayo Takahashi (Vision Care Inc./ RIKEN BDR, Japan)<br/>
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・トピックス:<br/>
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(1)幹細胞の自己組織化、(2)発生、再生、疾患モデル、(3)工学アプローチ、(4)新技術によるアプローチ、(5)脳オルガノイド (笹井芳樹メモリアルセッション)<br/>
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若手研究者にも発表の機会を提供いたします。本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、複数の演題には口頭発表をお願いする予定です。
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本シンポジウムは、2020年3月2日(月)~4日(水)に同じ会場で開催いたしますBDRシンポジウム「Emergence in biosystems」に続けて開催いたします。両シンポジウムのご参加を是非ご検討ください。
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https://www2.bdr.riken.jp/sympo/2020/
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多数のご参加をお待ちいたしております。
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・お問い合わせ:
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国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター
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センター長室(学術集会担当)
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E-mail: bdrcustom2020@ml.riken.jp
  
 
====これまでに掲載したお知らせ====
 
====これまでに掲載したお知らせ====
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*3 Days Exploration of Reinforcement Learning & Biological Intelligence
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*BDRシンポジウム2019参加者募集中!
 
*CDBシンポジウム2018のご案内
 
*CDBシンポジウム2018のご案内
 
*4th International Workshop on Quantitative Biology (IWQB2017) Registration Open
 
*4th International Workshop on Quantitative Biology (IWQB2017) Registration Open
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=== 求人情報のお知らせ ===
 
=== 求人情報のお知らせ ===
 +
==== <span style="color: red">Updated!! </span> Systems Human Biology and Medicine, Several Postdoctoral Fellows and Senior Scientists Positions Available====
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The Thomas N. Sato BioMEC-X Laboratories, Advanced Telecommunications Research Institute International, Kyoto, JAPAN<br/>
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Website:http://www.tnsl.atr.jp/en/index.html <br/>
  
==== <span style="color: red">New!! </span> 京大「大規模脳神経3次元回路抽出から計算論的神経科学へ」研究員募集 ====
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We take integrative approaches toward deciphering human body homeostasis, diseases and longevity. We combine molecular/cellular biology and genomics approaches with informatics, machine learning, mathematics and computer sciences using both animal models (mouse and zebrafish) and clinical subjects/data. Using these inter-disciplinary methods and concepts, we aim to understand how human physiology works and how human disease onset, progression and also longevity is regulated. We also conduct multiple large-scale multi-feature (multi-omics, physiology, clinical) studies with both healthy and disease human subjects. <br/>
京都大学 大学院情報学研究科 論理生命学分野では博士研究員を募集しております。
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Our ultimate goal is to develop mathematical models capturing the human’s whole-body level comprehensive physiology and disease and aging processes in the computer. <br/>
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We are looking for several self-motivated and interdisciplinary-minded scientists who are willing to take challenges to tackle ambitious projects by joining our international and inter-disciplinary team. <br/>
  
(1)CREST「光の特性を活用した生命機能の時空間制御技術の開発と応用」
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'''Preferred backgrounds and skills:'''<br/>
大規模脳画像から3次元神経回路の抽出を行い、神経回路シミュレーションにより記憶にかかわる神経回路メカニズムを解明することを目的としたプロジェクトにご参加いただける方を募集いたします。当プロジェクトでは、第一に東京大学医学部河西研究室と共同で神経画像を取得し、3次元画像処理により神経回路の抽出を試みます。したがって、[1]三次元画像処理、[2]神経回路シミュレーション、[3]神経生理/分子生物学のうち、[1]を専門とされる方で[2]や[3]に挑戦したい方、あるいは[2]や[3]を専門とされる方で[1]に一定のスキルを有される方を希望いたします。非常に野心的、かつ最先端の研究に挑まれる気概のある方の募集をお待ちしております!
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PhD, MD, or MD/PhD in informatics, mathematics, data sciences, physics, computer sciences, biological sciences, medical sciences, or other related areas. (Some BS or MS levels are also considered for engineers or programmers positions that are also available in our lab) <br/>
  
(2)「人工知能・脳神経系シミュレーション」
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'''Applications:'''<br/>
人工知能・脳神経系シミュレーション・ハイパフォーマンスコンピューティング、あるいは関連分野に専門性を持つかたのご応募をお待ちいたしております。スーパーコンピューターを用いたハイパフォーマンス・コンピューティングによる脳神経系大規模画像データの処理、あるいは人の脳の柔軟な機能を模倣する脳型人工知能の計算機実装を対象とし、創造力と協調性を持って研究を進めていただける方を希望いたします。
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Please send/email CV (including the publication list) to:
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Thomas N. Sato, Ph.D.
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The Thomas N. Sato BioMEC-X Laboratories, ATR
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2-2-2 Hikaridai, Seika-cho, Soraku-gun, Kyoto, Japan 619-0288
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Email: island1005@gmail.com<br/>
  
皆様の身の回りに適任者がおられましたらぜひ声をおかけください!
+
'''References:'''<br/>
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T. Akanuma, C. Chen, T. Sato, R.M.H. Merks, T.N. Sato (2016) Memory of cell shape biases stochastic fate decision-making despite mitotic rounding. Nature Communications, 7:11963. <br/>
  
●プロジェクト:
+
S. Kozawa, T. Akanuma, T. Sato, Y.D. Sato, K. Ikeda, T.N. Sato (2016) Read-time prediction of cell division timing in developing zebrafish embryo. Scientific Reports, 6:32962. <br/>
(1)平成28年度~33年度 戦略的創造研究推進事業(CREST)
 
研究領域:「光の特性を活用した生命機能の時空間制御技術の開発と応用」
 
河西春郎 代表「記憶構造を解明する新しい光操作・画像法の開発」
 
http://www.jst.go.jp/kisoken/crest/news/2016/160916/160916.html
 
  
(2)文部科学省「ポスト「京」で重点的に取り組むべき社会的・科学的課題に関するアプリケーション開発・研究開発」萌芽的課題
+
N. Takada, M. Omae, F. Sagawa, N.C. Chi, S. Endo, S. Kozawa, T.N. Sato (2017) Re-evaluating the functional landscape of the cardiovascular system during development. Biology Open, 6: 1756-1770.<br/>
「脳のビッグデータ解析、全脳シミュレーションと脳型人工知能アーキテクチャ」
 
(沖縄科学技術大学院大学、京都大学、理化学研究所、電気通信大学、東京大学の共同プロジェクト)
 
  
平成28年10月1日から平成30年3月31日まで(調査研究・準備研究フェイズ)
+
S. Kozawa, R. Ueda, K. Urayama, F. Sagawa, S. Endo, K. Shizaki, H. Kurosu, G. Almeida, S.M. Hasan, K. Nakazato, S. Ozaki, Y. Yamashita, M. Kuro-o, T.N. Sato (2018). The body-wide transcriptome landscape of disease models. iScience (Cell Press), 2, 238-268.<br/>
プロジェクトの審査により、さらに、
 
平成30年4月1日から平成32年3月31日まで(本格実施フェイズ)
 
  
●給与:
+
S. Kozawa, F. Sagawa, S.  Endo, G. M. De Almeida, Y. Mitsuishi, T. N.Sato (2020) Predicting Human Clinical Outcomes using Mouse Multi−Organ Transcriptome. iScience (Cell Press) doi: 10.1016/j.isci.2019.100791<br/>
京都大学特定研究員の規定によります。
 
(年俸制。年俸は経験、職務などを考慮決定)
 
詳細は担当までお問い合わせ下さい。
 
  
●勤務形態:
+
==== 理化学研究所細胞システム動態予測研究チーム研究員募集 ====
常勤(任期あり)
+
国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター
裁量労働制で週38時間45分相当
+
細胞システム動態予測研究チーム(PI:城口克之)
任期1年、更新可(最長上記プロジェクト完了まで)
 
  
●人数:若干名
+
募集職種:
 +
研究員 1名
  
●着任時期;
+
研究室の概要:
プロジェクト1:平成29年4月1日
+
当研究室では、細胞システム動態の理解、予測、制御を目指し、新しい計測システムを構築することで、これまでに知られていない生命現象の発見、解明を試みています。特に、顕微鏡観察、オミックス計測(網羅的遺伝子発現解析など)などを組み合わせて、各細胞の特徴や内部状態を同定し、それらの細胞がシステム全体にどのような影響を与えるかなどについて研究しています。また、これらの研究により医科学への貢献も目指しています。
プロジェクト2:平成28年11月1日以降のなるべく早い時期
 
ただし、着任時期については相談にのりますのでお申し出ください。
 
  
●ご応募方法:
+
参考URL
・履歴書(写真貼り付け、電子メールアドレスを明記)
+
http://www.bdr.riken.jp/jp/research/labs/shiroguchi-k/
・研究業績リスト
 
・主要論文のコピー(最大3件程度まで、各一部)
 
・これまでの研究の要約(A4用紙1枚~2枚程度)
 
プロジェクト1:プロジェクトに関係するスキル・実績に関する自己アピールを含めてください。
 
プロジェクト2:プログラミングやソフトウェア開発のスキル・実績に関する自己アピールを含めてください。
 
  
・応募者についての意見を伺える方1~2名のご氏名と連絡先
+
職務内容:
以上を電子ファイルの形で添付したE-mailを
+
顕微鏡観察、1細胞操作、遺伝子配列・発現解析(次世代シークエンサ)、画像解析、機械・深層学習などに関連した技術や装置を開発・改良しながら、免疫、発生、再生、老化研究など(のいずれか)を実施する。
kanae [at] sys.i.kyoto-u.ac.jpまでお送りください。
 
  
もしくは、郵送にてのご応募を希望される方は
+
勤務地:
石井 信 〒606-8501京都市左京区吉田本町36-1工学部1号館421号室
+
国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 大阪府吹田市古江台6-2-3
まで博士研究員応募書類在中と明記した封筒をお送りください。
 
  
●お問い合わせ:
+
着任時期:
kanae [at] sys.i.kyoto-u.ac.jp
+
早目(応相談)
までお気軽にお問合せください。
 
  
●募集期間と選考方法:
+
研究内容についての問合せ先:
募集期間は ** 平成28年12月18日 ** とします。
+
国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター
書類選考のうえ、面接により選考を行います。詳細は別途連絡したします。
+
城口克之
適任者が決まり次第、募集を終了いたします。
+
E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ
 +
さい。
 +
お気軽にご相談ください。
  
==============
+
公募の詳細:
 +
https://www.riken.jp/careers/researchers/20190603/
  
当研究室には、平成28年4月現在、
+
==== Seeking a Research Scientist, Laboratory for Prediction of Cell Systems Dynamics (PI: Katsuyuki Shiroguchi), RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research====
石井 信(数理工学)
+
Available Position:
大羽成征(バイオインフォマティクス、統計科学)
+
Research Scientist, one person, full-time.
前田新一(情報理論、機械学習)、
 
浦久保秀俊 (計算神経科学)
 
近藤洋平(数理生物学)
 
ヘンリク・スキッべ(画像情報学)
 
中江 健(統計科学、計算神経科学)
 
村上 陽平(システム生物学)
 
川瀬貴士(生物画像処理)
 
メシギ・クーロシ(画像工学、人工知能)
 
トーステン・ブルマン(計算神経科学)
 
の各研究者が在籍し、数理工学から脳神経科学、システム生物学、ブレインマシンインターフェースなどへの融合領域への研究展開を、沖縄科学技術大学院 (OIST)、ATR認知機構研究所、理化学研究所脳科 学総合研究センターなどの研究機関との連携の下で実施しております。
 
  
研究室のホームページ
+
Our lab:
http://ishiilab.jp
+
We want to develop new techniques to "see" something unknown, in order
京都大学情報学研究科システム科学専攻のホームページ
+
to understand biological systems and to contribute to medical science
http://www.sys.i.kyoto-u.ac.jp/index.html
+
and our understanding of diseases. Especially, we are focusing on
 +
visualizing the distribution of cell states by accurate system-wide
 +
measurements with single molecule and/or single cell resolution. We are
 +
also developing a new system to study cell systems dynamics and to
 +
predict the cell fate by live imaging, cell manipulation, sequencing,
 +
etc. Biological targets may be development, differentiation,
 +
regeneration, immune system, etc.
  
 +
Reference:
 +
http://www.bdr.riken.jp/en/research/labs/shiroguchi-k/index.html
  
==== <span style="color: red">New!! </span> 国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募 ====
+
Job Descriptions:
募集職種:研究員または特別研究員 1名
+
A successful candidate will develop new method(s), including
 +
instruments, to measure parameters quantitatively from single cells, a
 +
few cells, or cells from tissues based on techniques of optical
 +
microscope, microfluidics, cell biology, and/or molecular biology,
 +
bioinformatics, machine learning, and will measure samples which are
 +
important in biology and medical sciences. Biological targets may be
 +
organoids, tissues, immune cells, etc, to study development,
 +
differentiation, regeneration, aging, immune system, etc.
  
職務内容:細胞生物学的手法、分子生物学的手法、免疫学的手法、シークエンス技術、光学顕微鏡、マイクロチップ技術、Bioinformaticsなどを基にして、単一細胞や少数
+
Work location:
細胞、組織を対象にした(各種免疫系細胞、腸内細菌など)新しい定量計測法の
+
RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, 6-2-3 Furuedai Suita Osaka 565-0874 Japan
開発を行います。また、開発した方法を用いて、医科学的に重要な試料を測定
 
し、新しい切り口でサイエンスや医科学に貢献することを目指します。
 
  
勤務地:独立行政法人理化学研究所 統合生命医科学研究センター 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
+
Start of Employment:
 +
Earlier is better (Negotiable)
  
着任時期:応相談
+
Inquiries for research contents
 +
Katsuyuki Shiroguchi
 +
Email: katsuyuki.shiroguchi[at]riken.jp
 +
Laboratory for Prediction of Cell Systems Dynamics
 +
RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research
  
研究内容についての問合せ先:
+
Details:https://www.riken.jp/en/careers/researchers/20190603/
国立研究開発法人理化学研究所統合生命医科学研究センター
 
オミクス研究ラボ  城口克之
 
E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ
 
さい。
 
 
 
公募の詳細:
 
http://www.riken.jp/careers/researchers/20150909/
 
  
 
====これまでに掲載したお知らせ====
 
====これまでに掲載したお知らせ====
 +
*京大「大規模脳神経3次元回路抽出から計算論的神経科学へ」研究員募集
 +
*国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募
 +
*Seeking Research Scientist or Postdoctoral Researcher, Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
 
*明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募
 
*明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募
 
*ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)
 
*ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)

Revision as of 08:02, 19 February 2020

News

定量生物学に関わる研究者間の情報交換を促進するために、新しく News page を設けました。

情報掲載に関する問い合わせ先

当ページへの情報の掲載を希望される方は、ご所属、連絡先、掲載内容及びいつまでに情報を掲載してほしいかを明記の上、下記メールアドレスまでご連絡頂きますようよろしくお願い致します。世話人が掲載手続きを進めさせて頂きます。尚、定量生物学の会のメンバーでなくても情報の掲載を受け付けますので、ぜひ積極的にご活用下さい。

連絡先:q.biology at gmail.com (迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください)

研究費などのお知らせ

New!! 2020年度 CREST・さきがけ・ACT-X公募スケジュールについて

公募のスケジュール JSTは、戦略目標の達成に向けた研究領域及び研究総括を選定し、以下のスケジュールで戦略的創造研究推進事業(CREST・さきがけ・ACT-X)の2020年度研究課題の公募・選定等を行う予定です。 2020年度の研究課題の公募・選定は、2018年度、2019年度に発足した研究領域(以下、「既存研究領域」と称します)と2020年度に発足する新規研究領域(以下、「新規研究領域」と称します)とで、期間を2回に分けて行います。 なお、本研究提案募集の予告は、国会における令和2年度政府予算の成立を前提として行っています。

<第1期(既存研究領域)スケジュール>  ・3月下旬~5月中旬 研究課題の公募  ・5月下旬~9月中旬 研究課題の選定  ・10月1日(予定) 研究の開始

<第2期(新規研究領域)スケジュール>  ・4月中旬~6月中旬 研究課題の公募  ・6月下旬~11月中旬 研究課題の選定  ・12月1日(予定) 研究の開始

(注)以上のスケジュールは現時点での予定であり予告無く変更することがありますので、予めご了承ください。

公募に関する情報は下記webページで随時更新しておりますのでご覧ください。 https://www.jst.go.jp/kisoken/boshuu/teian.html

●問合せ先  国立研究開発法人科学技術振興機構 戦略研究推進部[募集専用]  E-mail:rp-info@jst.go.jp 問合せは必ず左記メールアドレスにお願い致します。  電話番号:03-3512-3530(受付時間:10:00~12:00/13:00~17:00)   ※土曜日、日曜日、祝日を除く 電話でご質問いただいた場合でも、電子メールでの対応をお願いすることがあります

これまでに掲載したお知らせ

  • JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度研究提案の募集(第1期)について
  • JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度CREST・さきがけ研究提案募集(第1期)の予告及び説明会の開催について
  • CREST「生命動態」領域 H26年度領域説明会の御案内
  • 「統合データベース講習会」受入れ機関募集のお知らせ
  • ライフサイエンスデータベース統合推進事業「統合データ解析トライアル」平成25年度研究開発提案募集
  • 戦略的創造研究推進事業 (CREST、さきがけ)  平成25年度研究提案の募集開始
  • 独立行政法人科学技術振興機構(JST) 平成25年度CREST・さきがけ研究提案募集説明会のご案内

研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ

New!! 案内:The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -:国際シンポジウム参加者およびポスター発表者の募集

・テーマ: The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -
・日時:  2020年2月27日(木)~28日(金)
・場所:  (株)国際電気通信基礎技術研究所(ATR)京都府相楽郡精華町光台二丁目2-2(けいはんな学研都市)
・言語:  英語
・参加費:  アカデミック参加者 無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)
・昼食代:  1,000円(28日のみ)
・懇親会費:  7,000円
・参加申し込み・ポスター演題提出: ホームページより事前申し込み
・締め切り:  2020年2月13日(木)
・URL: https://human-informatix.atr.jp/
・内容 近年の生命科学の分野は、従来のバイオや医学のみの概念や手法だけではなく、数理科学、計算科学、情報科学、工学、物理学などの概念や手法を取り入れ、全身全細胞全遺伝子レベルで統合的にとらえる研究が活発に行われている。 また、これらの異分野融合的なアプローチにより、破壊的技術革新による新たな医療産業が生まれようとしている。そこで、本シンポジウムは、国内外よりシステムバイオロジー、バイオインフォマティクス、機械学習の分野で活躍するトップレベルの研究者を演者として招聘し、関連分野の最先端の研究を発表していただく。 それにより、国内外の産官学の機関で研究開発や事業に携わる方々に当該分野の勉強および分野を超えた交流の場を提供する。さらに、本研究分野は(特に国内)現状、女性研究者が極度のUnderrepresentedである。したがって、招待講演者の半分を女性のトップレベル研究者にすることで、この分野における女性研究者の活性化(特に国内)を促進する。本シンポジウムではV-iCliniXに関連する発表を中心にプログラムを構成し、2日目にはERATO佐藤ライブ予測制御プロジェクトの最終成果を含め、様々な情報を社会に発信し報告する機会を設ける。
・連絡先 シンポジウム事務局:tns-sec@atr.jp

New!! 案内:BDRシンポジウム2020:参加・演題申し込み募集中!

・テーマ: Emergence in Biosystems
・日時:  2020年3月2日(月)~4日(水)
・場所:  理化学研究所 生命機能科学研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド)
・言語:  英語
・参加費:  無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)
・昼食代:  3,000円(3日間)
・懇親会費:  一般5,000円/学生1,000円
・参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み
・締め切り:  2019年12月6日(金)
・URL: https://www2.bdr.riken.jp/sympo/2020/

・トピックス:
(i) Origin of life
(ii) Protein/RNA self-assembly
(iii) Intracellular organelle formation
(iv) Cell assembly and organ formation
(v) Brain function and its underlying principle

本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、一部の演題には口頭発表をお願いする予定です。また、海外からの参加者(大学院生、研究員)を対象としたTravel Fellowshipを用意し、国内外からの多数の参加申込をお待ちいたしております。

また、本シンポジウムに引き続き、シンシナティ小児病院オルガノイド医学研究センター(CuSTOM)との合同シンポジウム2020 RIKEN BDR-CuSTOM Joint Symposium "Integrated organoid science: Stem cells, Engineering, Medicine”を開催いたしますので、是非こちらにもあわせてご参加ください。 https://www2.bdr.riken.jp/joint-organoid/2020/

お問い合わせ: 国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター センター長室(学術集会担当) E-mail: bdr-sympo2020@ml.riken.jp


New!! 案内:RIKEN BDR-CuSTOM Joint Symposium: 参加・演題申し込み募集中!

・テーマ: Integrated organoid science: Stem cells, Engineering, Medicine
・日時:  2020年3月4日(水)~5日(木)
・場所:  理化学研究所 生命機能科学研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド)
・言語:  英語
・参加費:  無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)
・昼食代: 1,000円(3月5日(木)分のみ)
・懇親会費: 一般5,000円/学生1,000円
・参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み
・締め切り:  2019年12月6日(金)
・URL: https://www2.bdr.riken.jp/joint-organoid/2020/

・キーノードスピーカー:
Jurgen Knoblich (Institute of Molecular Biotechnology, Austria) Masayo Takahashi (Vision Care Inc./ RIKEN BDR, Japan)

・トピックス:
(1)幹細胞の自己組織化、(2)発生、再生、疾患モデル、(3)工学アプローチ、(4)新技術によるアプローチ、(5)脳オルガノイド (笹井芳樹メモリアルセッション)

若手研究者にも発表の機会を提供いたします。本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、複数の演題には口頭発表をお願いする予定です。

本シンポジウムは、2020年3月2日(月)~4日(水)に同じ会場で開催いたしますBDRシンポジウム「Emergence in biosystems」に続けて開催いたします。両シンポジウムのご参加を是非ご検討ください。 https://www2.bdr.riken.jp/sympo/2020/

多数のご参加をお待ちいたしております。

・お問い合わせ: 国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター センター長室(学術集会担当) E-mail: bdrcustom2020@ml.riken.jp

これまでに掲載したお知らせ

  • 3 Days Exploration of Reinforcement Learning & Biological Intelligence
  • BDRシンポジウム2019参加者募集中!
  • CDBシンポジウム2018のご案内
  • 4th International Workshop on Quantitative Biology (IWQB2017) Registration Open
  • CDBシンポジウム2017参加者募集中!
  • 第28回CDBミーティング “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”開催のご案内
  • The 28th CDB Meeting “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions” Call for Application and Abstract Submission!
  • 第27回CDBミーティング Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces のお知らせ
  • The 27th CDB Meeting. Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces
  • CDBシンポジウム2016/CDB Symposium 2016 参加者募集中!
  • 第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内
  • CDBシンポジウム2015案内
  • 2015年度「統合データベース講習会」受入れ機関募集
  • バイオイメージデータ解析の公開講座のご案内
  • 数理生物学サマーレクチャーコース第2回~データ解析入門~」のお知らせ
  • 京都大学生命科学研究科特別講義のお知らせ
  • 光イメージング若手研究会「光塾」のお知らせ

求人情報のお知らせ

Updated!! Systems Human Biology and Medicine, Several Postdoctoral Fellows and Senior Scientists Positions Available

The Thomas N. Sato BioMEC-X Laboratories, Advanced Telecommunications Research Institute International, Kyoto, JAPAN
Website:http://www.tnsl.atr.jp/en/index.html

We take integrative approaches toward deciphering human body homeostasis, diseases and longevity. We combine molecular/cellular biology and genomics approaches with informatics, machine learning, mathematics and computer sciences using both animal models (mouse and zebrafish) and clinical subjects/data. Using these inter-disciplinary methods and concepts, we aim to understand how human physiology works and how human disease onset, progression and also longevity is regulated. We also conduct multiple large-scale multi-feature (multi-omics, physiology, clinical) studies with both healthy and disease human subjects.
Our ultimate goal is to develop mathematical models capturing the human’s whole-body level comprehensive physiology and disease and aging processes in the computer.
We are looking for several self-motivated and interdisciplinary-minded scientists who are willing to take challenges to tackle ambitious projects by joining our international and inter-disciplinary team.

Preferred backgrounds and skills:
PhD, MD, or MD/PhD in informatics, mathematics, data sciences, physics, computer sciences, biological sciences, medical sciences, or other related areas. (Some BS or MS levels are also considered for engineers or programmers positions that are also available in our lab)

Applications:
Please send/email CV (including the publication list) to: Thomas N. Sato, Ph.D. The Thomas N. Sato BioMEC-X Laboratories, ATR 2-2-2 Hikaridai, Seika-cho, Soraku-gun, Kyoto, Japan 619-0288 Email: island1005@gmail.com

References:
T. Akanuma, C. Chen, T. Sato, R.M.H. Merks, T.N. Sato (2016) Memory of cell shape biases stochastic fate decision-making despite mitotic rounding. Nature Communications, 7:11963.

S. Kozawa, T. Akanuma, T. Sato, Y.D. Sato, K. Ikeda, T.N. Sato (2016) Read-time prediction of cell division timing in developing zebrafish embryo. Scientific Reports, 6:32962.

N. Takada, M. Omae, F. Sagawa, N.C. Chi, S. Endo, S. Kozawa, T.N. Sato (2017) Re-evaluating the functional landscape of the cardiovascular system during development. Biology Open, 6: 1756-1770.

S. Kozawa, R. Ueda, K. Urayama, F. Sagawa, S. Endo, K. Shizaki, H. Kurosu, G. Almeida, S.M. Hasan, K. Nakazato, S. Ozaki, Y. Yamashita, M. Kuro-o, T.N. Sato (2018). The body-wide transcriptome landscape of disease models. iScience (Cell Press), 2, 238-268.

S. Kozawa, F. Sagawa, S. Endo, G. M. De Almeida, Y. Mitsuishi, T. N.Sato (2020) Predicting Human Clinical Outcomes using Mouse Multi−Organ Transcriptome. iScience (Cell Press) doi: 10.1016/j.isci.2019.100791

理化学研究所細胞システム動態予測研究チーム研究員募集

国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 細胞システム動態予測研究チーム(PI:城口克之)

募集職種: 研究員 1名

研究室の概要: 当研究室では、細胞システム動態の理解、予測、制御を目指し、新しい計測システムを構築することで、これまでに知られていない生命現象の発見、解明を試みています。特に、顕微鏡観察、オミックス計測(網羅的遺伝子発現解析など)などを組み合わせて、各細胞の特徴や内部状態を同定し、それらの細胞がシステム全体にどのような影響を与えるかなどについて研究しています。また、これらの研究により医科学への貢献も目指しています。

参考URL http://www.bdr.riken.jp/jp/research/labs/shiroguchi-k/

職務内容: 顕微鏡観察、1細胞操作、遺伝子配列・発現解析(次世代シークエンサ)、画像解析、機械・深層学習などに関連した技術や装置を開発・改良しながら、免疫、発生、再生、老化研究など(のいずれか)を実施する。

勤務地: 国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 大阪府吹田市古江台6-2-3

着任時期: 早目(応相談)

研究内容についての問合せ先: 国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター 城口克之 E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ さい。 お気軽にご相談ください。

公募の詳細: https://www.riken.jp/careers/researchers/20190603/

Seeking a Research Scientist, Laboratory for Prediction of Cell Systems Dynamics (PI: Katsuyuki Shiroguchi), RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research

Available Position: Research Scientist, one person, full-time.

Our lab: We want to develop new techniques to "see" something unknown, in order to understand biological systems and to contribute to medical science and our understanding of diseases. Especially, we are focusing on visualizing the distribution of cell states by accurate system-wide measurements with single molecule and/or single cell resolution. We are also developing a new system to study cell systems dynamics and to predict the cell fate by live imaging, cell manipulation, sequencing, etc. Biological targets may be development, differentiation, regeneration, immune system, etc.

Reference: http://www.bdr.riken.jp/en/research/labs/shiroguchi-k/index.html

Job Descriptions: A successful candidate will develop new method(s), including instruments, to measure parameters quantitatively from single cells, a few cells, or cells from tissues based on techniques of optical microscope, microfluidics, cell biology, and/or molecular biology, bioinformatics, machine learning, and will measure samples which are important in biology and medical sciences. Biological targets may be organoids, tissues, immune cells, etc, to study development, differentiation, regeneration, aging, immune system, etc.

Work location: RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, 6-2-3 Furuedai Suita Osaka 565-0874 Japan

Start of Employment: Earlier is better (Negotiable)

Inquiries for research contents Katsuyuki Shiroguchi Email: katsuyuki.shiroguchi[at]riken.jp Laboratory for Prediction of Cell Systems Dynamics RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research

Details:https://www.riken.jp/en/careers/researchers/20190603/

これまでに掲載したお知らせ

  • 京大「大規模脳神経3次元回路抽出から計算論的神経科学へ」研究員募集
  • 国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募
  • Seeking Research Scientist or Postdoctoral Researcher, Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
  • 明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募
  • ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)
  • JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト研究員募集
  • JST CRESTプロジェクト「細胞間接着・骨格の秩序形成メカニズムの解明と上皮バリア操作技術の開発」研究員募集
  • 京大情・論理生命学研・研究員募集
  • 独立行政法人理化学研究所、統合生命医科学研究センター統合ゲノミクスグループ 研究員または特別研究員の公募
  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任研究員の公募
  • 沖縄科学技術大学院大学学園(OIST)バイオインフォマティシャンの求人の募集
  • 「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域の「時間情報コードによる細胞制御システムの解明」(代表者:黒田真也(東京大学))研究員の募集
  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任助教等の公募
  • 東京大学黒田研 特任助教募集募集
  • Biology/Genetics/Evolution Postdoctoral Fellow Position, Fred Hutchinson Cancer Research Center (091006)