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From Japanese society for quantitative biology
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=== 研究費などのお知らせ ===
 
=== 研究費などのお知らせ ===
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==== <span style="color: red">New!! </span>2020年度 CREST・さきがけ・ACT-X公募スケジュールについて====
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公募のスケジュール
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JSTは、戦略目標の達成に向けた研究領域及び研究総括を選定し、以下のスケジュールで戦略的創造研究推進事業(CREST・さきがけ・ACT-X)の2020年度研究課題の公募・選定等を行う予定です。
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2020年度の研究課題の公募・選定は、2018年度、2019年度に発足した研究領域(以下、「既存研究領域」と称します)と2020年度に発足する新規研究領域(以下、「新規研究領域」と称します)とで、期間を2回に分けて行います。
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なお、本研究提案募集の予告は、国会における令和2年度政府予算の成立を前提として行っています。
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<第1期(既存研究領域)スケジュール>
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 ・3月下旬~5月中旬 研究課題の公募
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 ・5月下旬~9月中旬 研究課題の選定
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 ・10月1日(予定)  研究の開始
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<第2期(新規研究領域)スケジュール>
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 ・4月中旬~6月中旬 研究課題の公募
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 ・6月下旬~11月中旬 研究課題の選定
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 ・12月1日(予定)  研究の開始
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(注)以上のスケジュールは現時点での予定であり予告無く変更することがありますので、予めご了承ください。
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公募に関する情報は下記webページで随時更新しておりますのでご覧ください。
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https://www.jst.go.jp/kisoken/boshuu/teian.html
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●問合せ先
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 国立研究開発法人科学技術振興機構 戦略研究推進部[募集専用]
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 E-mail:rp-info@jst.go.jp 問合せは必ず左記メールアドレスにお願い致します。
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 電話番号:03-3512-3530(受付時間:10:00~12:00/13:00~17:00)
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  ※土曜日、日曜日、祝日を除く
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電話でご質問いただいた場合でも、電子メールでの対応をお願いすることがあります
  
 
==== これまでに掲載したお知らせ====
 
==== これまでに掲載したお知らせ====
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=== 研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ ===
 
=== 研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ ===
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==== <span style="color: red">New!! </span>案内:The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -:国際シンポジウム参加者およびポスター発表者の募集 ====
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・テーマ: The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -<br/>
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・日時:  2020年2月27日(木)~28日(金)<br/>
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・場所:  (株)国際電気通信基礎技術研究所(ATR)京都府相楽郡精華町光台二丁目2-2(けいはんな学研都市)<br/>
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・言語:  英語<br/>
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・参加費:  アカデミック参加者 無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)<br/>
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・昼食代:  1,000円(28日のみ)<br/>
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・懇親会費:  7,000円<br/>
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・参加申し込み・ポスター演題提出: ホームページより事前申し込み<br/>
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・締め切り:  2020年2月13日(木)<br/>
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・URL: https://human-informatix.atr.jp/ <br/>
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・内容
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近年の生命科学の分野は、従来のバイオや医学のみの概念や手法だけではなく、数理科学、計算科学、情報科学、工学、物理学などの概念や手法を取り入れ、全身全細胞全遺伝子レベルで統合的にとらえる研究が活発に行われている。
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また、これらの異分野融合的なアプローチにより、破壊的技術革新による新たな医療産業が生まれようとしている。そこで、本シンポジウムは、国内外よりシステムバイオロジー、バイオインフォマティクス、機械学習の分野で活躍するトップレベルの研究者を演者として招聘し、関連分野の最先端の研究を発表していただく。
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それにより、国内外の産官学の機関で研究開発や事業に携わる方々に当該分野の勉強および分野を超えた交流の場を提供する。さらに、本研究分野は(特に国内)現状、女性研究者が極度のUnderrepresentedである。したがって、招待講演者の半分を女性のトップレベル研究者にすることで、この分野における女性研究者の活性化(特に国内)を促進する。本シンポジウムではV-iCliniXに関連する発表を中心にプログラムを構成し、2日目にはERATO佐藤ライブ予測制御プロジェクトの最終成果を含め、様々な情報を社会に発信し報告する機会を設ける。<br/>
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・連絡先 シンポジウム事務局:tns-sec@atr.jp<br/>
  
==== <span style="color: red">New!! </span>第28回CDBミーティング “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”開催のご案内====
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==== <span style="color: red">New!! </span>案内:BDRシンポジウム2020:参加・演題申し込み募集中! ====
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・テーマ: Emergence in Biosystems<br/>
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・日時:  2020年3月2日(月)~4日(水)<br/>
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・場所:  理化学研究所 生命機能科学研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド)<br/>
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・言語:  英語<br/>
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・参加費:  無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)<br/>
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・昼食代:  3,000円(3日間)<br/>
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・懇親会費:  一般5,000円/学生1,000円<br/>
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・参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み<br/>
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・締め切り:  2019年12月6日(金)<br/>
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・URL: https://www2.bdr.riken.jp/sympo/2020/ <br/>
  
主催団体名: 理化学研究所 多細胞システム形成研究センター(CDB)
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・トピックス:<br/>
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(i) Origin of life<br/>
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(ii) Protein/RNA self-assembly<br/>
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(iii) Intracellular organelle formation<br/>
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(iv) Cell assembly and organ formation<br/>
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(v) Brain function and its underlying principle<br/>
  
オーガナイザー: 吉川 雅英(東京大学)、松崎 文雄(理化学研究所CDB)
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本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、一部の演題には口頭発表をお願いする予定です。また、海外からの参加者(大学院生、研究員)を対象としたTravel Fellowshipを用意し、国内外からの多数の参加申込をお待ちいたしております。
  
・文部科学省科学研究費補助金 新学術領域研究(研究領域提案型)「シリア・中心体系による生体情報フローの制御」
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また、本シンポジウムに引き続き、シンシナティ小児病院オルガノイド医学研究センター(CuSTOM)との合同シンポジウム2020 RIKEN BDR-CuSTOM Joint Symposium "Integrated organoid science: Stem cells, Engineering, Medicine”を開催いたしますので、是非こちらにもあわせてご参加ください。
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https://www2.bdr.riken.jp/joint-organoid/2020/
  
日時: 2016年11月27日(日)~29日(火)
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お問い合わせ:
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国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター
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センター長室(学術集会担当)
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E-mail: bdr-sympo2020@ml.riken.jp
  
場所: 理化学研究所 多細胞システム形成研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド)
 
  
参加費: 無料 *昼食(11/27)希望者は1,000円、懇親会(11/28)希望者は3,000円が別途要
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==== <span style="color: red">New!! </span>案内:RIKEN BDR-CuSTOM Joint Symposium: 参加・演題申し込み募集中!====
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・テーマ: Integrated organoid science: Stem cells, Engineering, Medicine<br/>
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・日時:  2020年3月4日(水)~5日(木)<br/>
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・場所:  理化学研究所 生命機能科学研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド)<br/>
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・言語:  英語<br/>
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・参加費:  無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)<br/>
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・昼食代: 1,000円(3月5日(木)分のみ)<br/>
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・懇親会費: 一般5,000円/学生1,000円<br/>
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・参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み<br/>
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・締め切り:  2019年12月6日(金)<br/>
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・URL: https://www2.bdr.riken.jp/joint-organoid/2020/<br/>
  
参加申込・演題提出: 全員ホームページより事前申込要
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・キーノードスピーカー:<br/>
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Jurgen Knoblich (Institute of Molecular Biotechnology, Austria)
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Masayo Takahashi (Vision Care Inc./ RIKEN BDR, Japan)<br/>
  
締切: 2016年9月30日(金)
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・トピックス:<br/>
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(1)幹細胞の自己組織化、(2)発生、再生、疾患モデル、(3)工学アプローチ、(4)新技術によるアプローチ、(5)脳オルガノイド (笹井芳樹メモリアルセッション)<br/>
  
URL:http://www.cdb.riken.jp/cilia/2016/index.html
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若手研究者にも発表の機会を提供いたします。本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、複数の演題には口頭発表をお願いする予定です。
  
シリア-中心体系は様々な生化学シグナルや力学的シグナルの発生・伝達・応答に重要な役割を果たします。とりわけ、一次シリアは驚くほど多様な生理作用に関与し,その破綻は多彩な疾患・症状に結びつく事が爆発的なスピードで明らかにされつつあります。これまで、中心体は細胞分裂における役割から研究され,一方シリアは運動性やシグナル受容という働きに注目されて来ました。本会議の目的は、中心体とシリアという密接に関連する2つの細胞内小器官を、ダイナミックに変化する1つの細胞内小器官と捉え、その構造・形成機構・機能についての情報交換を行うことのできる場を提供することです。これまでシリア-中心体に関する研究をリードして来た海外・国内の研究者を交えて、活発な議論が行われることを期待します。本会議では、一般参加者によるポスター発表を募り、優秀な演題には口頭発表をお願いする予定です。使用言語は英語です。同時通訳はございませんので予めご了承ください。国内外からの多数のご参加をお待ちしております。
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本シンポジウムは、2020年3月2日(月)~4日(水)に同じ会場で開催いたしますBDRシンポジウム「Emergence in biosystems」に続けて開催いたします。両シンポジウムのご参加を是非ご検討ください。
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https://www2.bdr.riken.jp/sympo/2020/
  
連絡先:CDBミーティング事務局
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多数のご参加をお待ちいたしております。
  
理化学研究所 多細胞システム形成研究センター 多細胞システム形成研究推進室内、学術集会担当
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・お問い合わせ:
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国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター
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センター長室(学術集会担当)
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E-mail: bdrcustom2020@ml.riken.jp
  
〒650-0047 神戸市中央区港島南町2-2-3
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====これまでに掲載したお知らせ====
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*3 Days Exploration of Reinforcement Learning & Biological Intelligence
 +
*BDRシンポジウム2019参加者募集中!
 +
*CDBシンポジウム2018のご案内
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*4th International Workshop on Quantitative Biology (IWQB2017) Registration Open
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*CDBシンポジウム2017参加者募集中!
 +
*第28回CDBミーティング “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”開催のご案内
 +
*The 28th CDB Meeting “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions” Call for Application and Abstract Submission!
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*第27回CDBミーティング Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces のお知らせ
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*The 27th CDB Meeting. Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces
 +
*CDBシンポジウム2016/CDB Symposium 2016 参加者募集中!
 +
*第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内
 +
* CDBシンポジウム2015案内
 +
* 2015年度「統合データベース講習会」受入れ機関募集
 +
* バイオイメージデータ解析の公開講座のご案内
 +
* 数理生物学サマーレクチャーコース第2回~データ解析入門~」のお知らせ 
 +
* 京都大学生命科学研究科特別講義のお知らせ
 +
* 光イメージング若手研究会「光塾」のお知らせ
  
E-mail: cilia2016@cdb.riken.jp
+
=== 求人情報のお知らせ ===
 
+
==== <span style="color: red">Updated!! </span> Systems Human Biology and Medicine, Several Postdoctoral Fellows and Senior Scientists Positions Available====
==== <span style="color: red">New!! </span>The 28th CDB Meeting “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions” Call for Application and Abstract Submission!====
+
The Thomas N. Sato BioMEC-X Laboratories, Advanced Telecommunications Research Institute International, Kyoto, JAPAN<br/>
 
+
Website:http://www.tnsl.atr.jp/en/index.html <br/>
We are pleased to announce that the 28th CDB Meeting will be held as follows:
 
 
 
Title: The 28th CDB Meeting “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”
 
 
 
Date: November 27 (Sun.) – 29 (Tue.), 2016
 
 
 
Venue: RIKEN Center for Developmental Biology, Kobe, Japan
 
 
 
Application and Abstract submission deadline: Friday, September 30, 2016 (Japan time)
 
 
 
Participation fee: Free
 
 
 
Lunch fee (Nov. 28, Optional): 1,000 JPY
 
Banquet fee (Nov. 27, Optional): 3,000 JPY
 
 
 
URL: http://www.cdb.riken.jp/cilia/2016/index.html
 
 
 
Cilia form an apparatus that plays critical roles in the transmission of cell-to- cell signals and motility. The centrosome is a key organelle in mitosis; both cilia and the centrosome are constructed by the same complex: the centriole (basal body). In this MEXT-Cilia Club-CDB joint symposium, we seek to coordinate exchanges on cutting-edge research by prominent international scientists and the achievements of the MEXT group over a 5-year period, and to promote discussion of future directions in studies on cilia and centrosomes. The program will include both oral and poster sessions. A small number of poster abstracts will be selected by the organizing committee for oral presentations. We would be delighted to have your participation at the 28th CDB Meeting.
 
 
 
Sincerely,
 
 
 
Masahide Kikkawa (The University of Tokyo, Japan)
 
 
 
Fumio Matsuzaki (RIKEN CDB, Japan)
 
 
 
This meeting is co-hosted by cilia club and Grant-in- aid for Scientific Research on Innovative Areas Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (MEXT) “Cilium-centrosome system regulating biosignal flows&quot;.
 
 
 
-- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
 
 
 
Contact:
 
 
 
CDB Meeting Office
 
 
 
RIKEN Center for Developmental Biology (CDB)
 
 
 
Office for Research Communications
 
 
 
2-2- 3, Minatojima-minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan
 
 
 
E-MAIL:cilia2016@cdb.riken.jp
 
 
 
==== <span style="color: red">New!! </span>第27回CDBミーティング Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces のお知らせ====
 
 
 
【開催日】
 
2016年11月14日(月)、15日(火)
 
 
 
【開催地】
 
理化学研究所 多細胞システム形成研究センター (RIKEN CDB)
 
 
 
【URL】
 
http://www.cdb.riken.jp/skin2016/
 
 
 
【参加・演題〆切】 
 
2016年9月9日(金)
 
 
 
【参加費】
 
無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)
 
・昼食代 2,000円(2日間)
 
・懇親会費 一般5,000円/学生1,000円一般:4,000円
 
 
 
【言語】
 
英語
 
 
 
【基調講演】
 
Yann Barrandon (École Polytechnique Fédérale de Lausanne, Switzerland)
 
Cheng-Ming Chuong (University of Southern California, USA)
 
 
 
【概要】
 
本会議では、体表を「数ある器官の一つ」として見るのではなく、生命体と環境との境界をなす「スーパーバイオインターフェース」として捉え、体表を構成す る多種多様な細胞の間の相互作用が、多機能性と多様性を兼ね備えた器官のマクロな構造や機能を創発的に生み出す「体表戦略」について議論いたします。会議 での議論を通して、生命の体表戦略の本質的理解に迫るとともに、これまで治療法が確立されて来なかった難治性皮膚疾患の克服や、皮膚の完全再生に向けた戦 略についての新たな洞察が得られることを期待しております。
 
 
 
トピックスとしては以下のものを予定しております。
 
(1) Epithelial formation
 
(2) Functional unit formation
 
(3) Maintenance and regeneration
 
(4) Evo-devo
 
(5) New technologies
 
(6) Dysfunction and therapeutics
 
 
 
組織間の相互作用を横糸に、生物種間の多様性を縦糸にすることで、これまで繋がることが少なかった学問分野間の融合的な議論を誘発し、新たな視点で体表の高次機能と機能発現の理解を目指します。
 
 
 
本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、複数の演題には口頭発表をお願いする予定です。若手研究者や大学院生を含む、国内外からの多数のご応募をお待ちいたしております。
 
 
 
【お問い合わせ】
 
CDBミーティング事務局
 
多細胞システム形成研究センター 研究推進室内
 
〒650-0047神戸市中央区港島南町2-2-3
 
E-mail: skin2016@cdb.riken.jp
 
 
 
==== <span style="color: red">New!! </span>The 27th CDB Meeting. Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces ====
 
 
 
【Date】
 
November 14 (Mon), 15 (Tue), 2016
 
 
 
【Venue】
 
RIKEN Center for Developmental Biology (CDB), Kobe, Japan
 
 
 
【URL】
 
http://www.cdb.riken.jp/skin2016/
 
  
【Deadline for registration and abstract submission】
+
We take integrative approaches toward deciphering human body homeostasis, diseases and longevity. We combine molecular/cellular biology and genomics approaches with informatics, machine learning, mathematics and computer sciences using both animal models (mouse and zebrafish) and clinical subjects/data. Using these inter-disciplinary methods and concepts, we aim to understand how human physiology works and how human disease onset, progression and also longevity is regulated. We also conduct multiple large-scale multi-feature (multi-omics, physiology, clinical) studies with both healthy and disease human subjects. <br/>
September 9 (Fri), 2016
+
Our ultimate goal is to develop mathematical models capturing the human’s whole-body level comprehensive physiology and disease and aging processes in the computer. <br/>
 +
We are looking for several self-motivated and interdisciplinary-minded scientists who are willing to take challenges to tackle ambitious projects by joining our international and inter-disciplinary team. <br/>
  
【Participation Fee】
+
'''Preferred backgrounds and skills:'''<br/>
FREE (Lunch and Banquet fee required separately - optional)
+
PhD, MD, or MD/PhD in informatics, mathematics, data sciences, physics, computer sciences, biological sciences, medical sciences, or other related areas. (Some BS or MS levels are also considered for engineers or programmers positions that are also available in our lab) <br/>
Lunch: 2,000 JPY (2 days)
 
Banquet: 5,000 JPY (General) / 1,000 JPY (Student)
 
  
【Language】
+
'''Applications:'''<br/>
English
+
Please send/email CV (including the publication list) to:
 +
Thomas N. Sato, Ph.D.
 +
The Thomas N. Sato BioMEC-X Laboratories, ATR
 +
2-2-2 Hikaridai, Seika-cho, Soraku-gun, Kyoto, Japan 619-0288
 +
Email: island1005@gmail.com<br/>
  
【Keynote Speakers】
+
'''References:'''<br/>
Yann Barrandon (École Polytechnique Fédérale de Lausanne, Switzerland)
+
T. Akanuma, C. Chen, T. Sato, R.M.H. Merks, T.N. Sato (2016) Memory of cell shape biases stochastic fate decision-making despite mitotic rounding. Nature Communications, 7:11963. <br/>
Cheng-Ming Chuong (University of Southern California, USA)
 
  
【Outline】
+
S. Kozawa, T. Akanuma, T. Sato, Y.D. Sato, K. Ikeda, T.N. Sato (2016) Read-time prediction of cell division timing in developing zebrafish embryo. Scientific Reports, 6:32962. <br/>
The purpose of this meeting is to bring together scientists who are studying the body surface, or skin, in different disciplines, including cell and developmental biology, regenerative biology, vascular and neurobiology, immunology, evolution, mathematics and medicine, to decode the tactics adopted by the body surface to generate an organism’s super-biointerface.
 
  
Topics to be discussed will include
+
N. Takada, M. Omae, F. Sagawa, N.C. Chi, S. Endo, S. Kozawa, T.N. Sato (2017) Re-evaluating the functional landscape of the cardiovascular system during development. Biology Open, 6: 1756-1770.<br/>
(1) epithelial formation
 
(2) functional unit formation
 
(3) maintenance and regeneration
 
(4) evo-devo
 
(5) new technologies
 
(6) dysfunction and therapeutics.
 
  
The program will include both oral and poster sessions. We encourage the submission of abstracts for the poster session from scientists in various fields to increase opportunities for lively and exciting discussion. Several abstracts will be selected for oral presentations.
+
S. Kozawa, R. Ueda, K. Urayama, F. Sagawa, S. Endo, K. Shizaki, H. Kurosu, G. Almeida, S.M. Hasan, K. Nakazato, S. Ozaki, Y. Yamashita, M. Kuro-o, T.N. Sato (2018). The body-wide transcriptome landscape of disease models. iScience (Cell Press), 2, 238-268.<br/>
  
We look forward to welcoming you to Kobe and the RIKEN Center for Developmental Biology.
+
S. Kozawa, F. Sagawa, S.  Endo, G. M. De Almeida, Y. Mitsuishi, T. N.Sato (2020) Predicting Human Clinical Outcomes using Mouse Multi−Organ Transcriptome. iScience (Cell Press) doi: 10.1016/j.isci.2019.100791<br/>
  
【Contact】
+
==== 理化学研究所細胞システム動態予測研究チーム研究員募集 ====
CDB Meeting Office
+
国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター
RIKEN Center for Developmental Biology
+
細胞システム動態予測研究チーム(PI:城口克之)
2-2-3 Minatojima-minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan
 
E-mail: skin2016@cdb.riken.jp
 
  
====これまでに掲載したお知らせ====
+
募集職種:
*CDBシンポジウム2016/CDB Symposium 2016 参加者募集中!
+
研究員 1名
*第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内
 
* CDBシンポジウム2015案内
 
* 2015年度「統合データベース講習会」受入れ機関募集
 
* バイオイメージデータ解析の公開講座のご案内
 
* 数理生物学サマーレクチャーコース第2回~データ解析入門~」のお知らせ 
 
* 京都大学生命科学研究科特別講義のお知らせ
 
* 光イメージング若手研究会「光塾」のお知らせ
 
  
=== 求人情報のお知らせ ===
+
研究室の概要:
 +
当研究室では、細胞システム動態の理解、予測、制御を目指し、新しい計測システムを構築することで、これまでに知られていない生命現象の発見、解明を試みています。特に、顕微鏡観察、オミックス計測(網羅的遺伝子発現解析など)などを組み合わせて、各細胞の特徴や内部状態を同定し、それらの細胞がシステム全体にどのような影響を与えるかなどについて研究しています。また、これらの研究により医科学への貢献も目指しています。
  
==== <span style="color: red">New!! </span> 国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募 ====
+
参考URL
募集職種:研究員または特別研究員 1名
+
http://www.bdr.riken.jp/jp/research/labs/shiroguchi-k/
  
職務内容:細胞生物学的手法、分子生物学的手法、免疫学的手法、シークエンス技術、光学顕微鏡、マイクロチップ技術、Bioinformaticsなどを基にして、単一細胞や少数
+
職務内容:
細胞、組織を対象にした(各種免疫系細胞、腸内細菌など)新しい定量計測法の
+
顕微鏡観察、1細胞操作、遺伝子配列・発現解析(次世代シークエンサ)、画像解析、機械・深層学習などに関連した技術や装置を開発・改良しながら、免疫、発生、再生、老化研究など(のいずれか)を実施する。
開発を行います。また、開発した方法を用いて、医科学的に重要な試料を測定
 
し、新しい切り口でサイエンスや医科学に貢献することを目指します。
 
  
勤務地:独立行政法人理化学研究所 統合生命医科学研究センター 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
+
勤務地:
 +
国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 大阪府吹田市古江台6-2-3
  
着任時期:応相談
+
着任時期:
 +
早目(応相談)
  
 
研究内容についての問合せ先:
 
研究内容についての問合せ先:
国立研究開発法人理化学研究所統合生命医科学研究センター
+
国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター
オミクス研究ラボ  城口克之
+
城口克之
 
E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ
 
E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ
 
さい。
 
さい。
 +
お気軽にご相談ください。
  
 
公募の詳細:
 
公募の詳細:
http://www.riken.jp/careers/researchers/20150909/
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https://www.riken.jp/careers/researchers/20190603/
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==== Seeking a Research Scientist, Laboratory for Prediction of Cell Systems Dynamics (PI: Katsuyuki Shiroguchi), RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research====
 +
Available Position:
 +
Research Scientist, one person, full-time.
  
==== <span style="color: red">New!! </span>Seeking Research Scientist or Postdoctoral Researcher, Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences====
+
Our lab:
 +
We want to develop new techniques to "see" something unknown, in order
 +
to understand biological systems and to contribute to medical science
 +
and our understanding of diseases. Especially, we are focusing on
 +
visualizing the distribution of cell states by accurate system-wide
 +
measurements with single molecule and/or single cell resolution. We are
 +
also developing a new system to study cell systems dynamics and to
 +
predict the cell fate by live imaging, cell manipulation, sequencing,
 +
etc. Biological targets may be development, differentiation,
 +
regeneration, immune system, etc.
  
Available Positions: Research Scientist or Postdoctoral Researcher, one person, full-time.
+
Reference:
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http://www.bdr.riken.jp/en/research/labs/shiroguchi-k/index.html
  
Job Descriptions: A successful candidate will develop new method(s) to measure parameters quantitatively from single cells, a few cells, or cells from tissues (immunological cells, microbiome, etc) based on techniques of cell
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Job Descriptions:
biology, molecular biology, immunology, sequencing, optical microscope,
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A successful candidate will develop new method(s), including
microchip, and/or bioinfomatics. Using the developed method(s), she/he
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instruments, to measure parameters quantitatively from single cells, a
will measure cells which are medically significant, and intend to contribute to science and medical science from a novel point of view.
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few cells, or cells from tissues based on techniques of optical
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important in biology and medical sciences. Biological targets may be
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organoids, tissues, immune cells, etc, to study development,
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differentiation, regeneration, aging, immune system, etc.
  
Work location: RIKEN Center for Integrative Medical Sciences. 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama-shi, Kanagawa 230-0045 Japan
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RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, 6-2-3 Furuedai Suita Osaka 565-0874 Japan
  
Start of Employment: Negotiable
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Earlier is better (Negotiable)
  
 
Inquiries for research contents
 
Inquiries for research contents
Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical
 
Sciences
 
 
Katsuyuki Shiroguchi
 
Katsuyuki Shiroguchi
 
Email: katsuyuki.shiroguchi[at]riken.jp
 
Email: katsuyuki.shiroguchi[at]riken.jp
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Laboratory for Prediction of Cell Systems Dynamics
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RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research
  
Details:http://www.riken.jp/en/careers/researchers/20150909/
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Details:https://www.riken.jp/en/careers/researchers/20190603/
  
 
====これまでに掲載したお知らせ====
 
====これまでに掲載したお知らせ====
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*京大「大規模脳神経3次元回路抽出から計算論的神経科学へ」研究員募集
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*国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募
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*Seeking Research Scientist or Postdoctoral Researcher, Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
 
*明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募
 
*明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募
 
*ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)
 
*ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)

Revision as of 08:02, 19 February 2020

News

定量生物学に関わる研究者間の情報交換を促進するために、新しく News page を設けました。

情報掲載に関する問い合わせ先

当ページへの情報の掲載を希望される方は、ご所属、連絡先、掲載内容及びいつまでに情報を掲載してほしいかを明記の上、下記メールアドレスまでご連絡頂きますようよろしくお願い致します。世話人が掲載手続きを進めさせて頂きます。尚、定量生物学の会のメンバーでなくても情報の掲載を受け付けますので、ぜひ積極的にご活用下さい。

連絡先:q.biology at gmail.com (迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください)

研究費などのお知らせ

New!! 2020年度 CREST・さきがけ・ACT-X公募スケジュールについて

公募のスケジュール JSTは、戦略目標の達成に向けた研究領域及び研究総括を選定し、以下のスケジュールで戦略的創造研究推進事業(CREST・さきがけ・ACT-X)の2020年度研究課題の公募・選定等を行う予定です。 2020年度の研究課題の公募・選定は、2018年度、2019年度に発足した研究領域(以下、「既存研究領域」と称します)と2020年度に発足する新規研究領域(以下、「新規研究領域」と称します)とで、期間を2回に分けて行います。 なお、本研究提案募集の予告は、国会における令和2年度政府予算の成立を前提として行っています。

<第1期(既存研究領域)スケジュール>  ・3月下旬~5月中旬 研究課題の公募  ・5月下旬~9月中旬 研究課題の選定  ・10月1日(予定) 研究の開始

<第2期(新規研究領域)スケジュール>  ・4月中旬~6月中旬 研究課題の公募  ・6月下旬~11月中旬 研究課題の選定  ・12月1日(予定) 研究の開始

(注)以上のスケジュールは現時点での予定であり予告無く変更することがありますので、予めご了承ください。

公募に関する情報は下記webページで随時更新しておりますのでご覧ください。 https://www.jst.go.jp/kisoken/boshuu/teian.html

●問合せ先  国立研究開発法人科学技術振興機構 戦略研究推進部[募集専用]  E-mail:rp-info@jst.go.jp 問合せは必ず左記メールアドレスにお願い致します。  電話番号:03-3512-3530(受付時間:10:00~12:00/13:00~17:00)   ※土曜日、日曜日、祝日を除く 電話でご質問いただいた場合でも、電子メールでの対応をお願いすることがあります

これまでに掲載したお知らせ

  • JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度研究提案の募集(第1期)について
  • JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度CREST・さきがけ研究提案募集(第1期)の予告及び説明会の開催について
  • CREST「生命動態」領域 H26年度領域説明会の御案内
  • 「統合データベース講習会」受入れ機関募集のお知らせ
  • ライフサイエンスデータベース統合推進事業「統合データ解析トライアル」平成25年度研究開発提案募集
  • 戦略的創造研究推進事業 (CREST、さきがけ)  平成25年度研究提案の募集開始
  • 独立行政法人科学技術振興機構(JST) 平成25年度CREST・さきがけ研究提案募集説明会のご案内

研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ

New!! 案内:The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -:国際シンポジウム参加者およびポスター発表者の募集

・テーマ: The 1st International Symposium on Human InformatiX - X-Dimensional Human Informatics and Biology -
・日時:  2020年2月27日(木)~28日(金)
・場所:  (株)国際電気通信基礎技術研究所(ATR)京都府相楽郡精華町光台二丁目2-2(けいはんな学研都市)
・言語:  英語
・参加費:  アカデミック参加者 無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)
・昼食代:  1,000円(28日のみ)
・懇親会費:  7,000円
・参加申し込み・ポスター演題提出: ホームページより事前申し込み
・締め切り:  2020年2月13日(木)
・URL: https://human-informatix.atr.jp/
・内容 近年の生命科学の分野は、従来のバイオや医学のみの概念や手法だけではなく、数理科学、計算科学、情報科学、工学、物理学などの概念や手法を取り入れ、全身全細胞全遺伝子レベルで統合的にとらえる研究が活発に行われている。 また、これらの異分野融合的なアプローチにより、破壊的技術革新による新たな医療産業が生まれようとしている。そこで、本シンポジウムは、国内外よりシステムバイオロジー、バイオインフォマティクス、機械学習の分野で活躍するトップレベルの研究者を演者として招聘し、関連分野の最先端の研究を発表していただく。 それにより、国内外の産官学の機関で研究開発や事業に携わる方々に当該分野の勉強および分野を超えた交流の場を提供する。さらに、本研究分野は(特に国内)現状、女性研究者が極度のUnderrepresentedである。したがって、招待講演者の半分を女性のトップレベル研究者にすることで、この分野における女性研究者の活性化(特に国内)を促進する。本シンポジウムではV-iCliniXに関連する発表を中心にプログラムを構成し、2日目にはERATO佐藤ライブ予測制御プロジェクトの最終成果を含め、様々な情報を社会に発信し報告する機会を設ける。
・連絡先 シンポジウム事務局:tns-sec@atr.jp

New!! 案内:BDRシンポジウム2020:参加・演題申し込み募集中!

・テーマ: Emergence in Biosystems
・日時:  2020年3月2日(月)~4日(水)
・場所:  理化学研究所 生命機能科学研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド)
・言語:  英語
・参加費:  無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)
・昼食代:  3,000円(3日間)
・懇親会費:  一般5,000円/学生1,000円
・参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み
・締め切り:  2019年12月6日(金)
・URL: https://www2.bdr.riken.jp/sympo/2020/

・トピックス:
(i) Origin of life
(ii) Protein/RNA self-assembly
(iii) Intracellular organelle formation
(iv) Cell assembly and organ formation
(v) Brain function and its underlying principle

本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、一部の演題には口頭発表をお願いする予定です。また、海外からの参加者(大学院生、研究員)を対象としたTravel Fellowshipを用意し、国内外からの多数の参加申込をお待ちいたしております。

また、本シンポジウムに引き続き、シンシナティ小児病院オルガノイド医学研究センター(CuSTOM)との合同シンポジウム2020 RIKEN BDR-CuSTOM Joint Symposium "Integrated organoid science: Stem cells, Engineering, Medicine”を開催いたしますので、是非こちらにもあわせてご参加ください。 https://www2.bdr.riken.jp/joint-organoid/2020/

お問い合わせ: 国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター センター長室(学術集会担当) E-mail: bdr-sympo2020@ml.riken.jp


New!! 案内:RIKEN BDR-CuSTOM Joint Symposium: 参加・演題申し込み募集中!

・テーマ: Integrated organoid science: Stem cells, Engineering, Medicine
・日時:  2020年3月4日(水)~5日(木)
・場所:  理化学研究所 生命機能科学研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド)
・言語:  英語
・参加費:  無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)
・昼食代: 1,000円(3月5日(木)分のみ)
・懇親会費: 一般5,000円/学生1,000円
・参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み
・締め切り:  2019年12月6日(金)
・URL: https://www2.bdr.riken.jp/joint-organoid/2020/

・キーノードスピーカー:
Jurgen Knoblich (Institute of Molecular Biotechnology, Austria) Masayo Takahashi (Vision Care Inc./ RIKEN BDR, Japan)

・トピックス:
(1)幹細胞の自己組織化、(2)発生、再生、疾患モデル、(3)工学アプローチ、(4)新技術によるアプローチ、(5)脳オルガノイド (笹井芳樹メモリアルセッション)

若手研究者にも発表の機会を提供いたします。本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、複数の演題には口頭発表をお願いする予定です。

本シンポジウムは、2020年3月2日(月)~4日(水)に同じ会場で開催いたしますBDRシンポジウム「Emergence in biosystems」に続けて開催いたします。両シンポジウムのご参加を是非ご検討ください。 https://www2.bdr.riken.jp/sympo/2020/

多数のご参加をお待ちいたしております。

・お問い合わせ: 国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター センター長室(学術集会担当) E-mail: bdrcustom2020@ml.riken.jp

これまでに掲載したお知らせ

  • 3 Days Exploration of Reinforcement Learning & Biological Intelligence
  • BDRシンポジウム2019参加者募集中!
  • CDBシンポジウム2018のご案内
  • 4th International Workshop on Quantitative Biology (IWQB2017) Registration Open
  • CDBシンポジウム2017参加者募集中!
  • 第28回CDBミーティング “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”開催のご案内
  • The 28th CDB Meeting “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions” Call for Application and Abstract Submission!
  • 第27回CDBミーティング Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces のお知らせ
  • The 27th CDB Meeting. Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces
  • CDBシンポジウム2016/CDB Symposium 2016 参加者募集中!
  • 第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内
  • CDBシンポジウム2015案内
  • 2015年度「統合データベース講習会」受入れ機関募集
  • バイオイメージデータ解析の公開講座のご案内
  • 数理生物学サマーレクチャーコース第2回~データ解析入門~」のお知らせ
  • 京都大学生命科学研究科特別講義のお知らせ
  • 光イメージング若手研究会「光塾」のお知らせ

求人情報のお知らせ

Updated!! Systems Human Biology and Medicine, Several Postdoctoral Fellows and Senior Scientists Positions Available

The Thomas N. Sato BioMEC-X Laboratories, Advanced Telecommunications Research Institute International, Kyoto, JAPAN
Website:http://www.tnsl.atr.jp/en/index.html

We take integrative approaches toward deciphering human body homeostasis, diseases and longevity. We combine molecular/cellular biology and genomics approaches with informatics, machine learning, mathematics and computer sciences using both animal models (mouse and zebrafish) and clinical subjects/data. Using these inter-disciplinary methods and concepts, we aim to understand how human physiology works and how human disease onset, progression and also longevity is regulated. We also conduct multiple large-scale multi-feature (multi-omics, physiology, clinical) studies with both healthy and disease human subjects.
Our ultimate goal is to develop mathematical models capturing the human’s whole-body level comprehensive physiology and disease and aging processes in the computer.
We are looking for several self-motivated and interdisciplinary-minded scientists who are willing to take challenges to tackle ambitious projects by joining our international and inter-disciplinary team.

Preferred backgrounds and skills:
PhD, MD, or MD/PhD in informatics, mathematics, data sciences, physics, computer sciences, biological sciences, medical sciences, or other related areas. (Some BS or MS levels are also considered for engineers or programmers positions that are also available in our lab)

Applications:
Please send/email CV (including the publication list) to: Thomas N. Sato, Ph.D. The Thomas N. Sato BioMEC-X Laboratories, ATR 2-2-2 Hikaridai, Seika-cho, Soraku-gun, Kyoto, Japan 619-0288 Email: island1005@gmail.com

References:
T. Akanuma, C. Chen, T. Sato, R.M.H. Merks, T.N. Sato (2016) Memory of cell shape biases stochastic fate decision-making despite mitotic rounding. Nature Communications, 7:11963.

S. Kozawa, T. Akanuma, T. Sato, Y.D. Sato, K. Ikeda, T.N. Sato (2016) Read-time prediction of cell division timing in developing zebrafish embryo. Scientific Reports, 6:32962.

N. Takada, M. Omae, F. Sagawa, N.C. Chi, S. Endo, S. Kozawa, T.N. Sato (2017) Re-evaluating the functional landscape of the cardiovascular system during development. Biology Open, 6: 1756-1770.

S. Kozawa, R. Ueda, K. Urayama, F. Sagawa, S. Endo, K. Shizaki, H. Kurosu, G. Almeida, S.M. Hasan, K. Nakazato, S. Ozaki, Y. Yamashita, M. Kuro-o, T.N. Sato (2018). The body-wide transcriptome landscape of disease models. iScience (Cell Press), 2, 238-268.

S. Kozawa, F. Sagawa, S. Endo, G. M. De Almeida, Y. Mitsuishi, T. N.Sato (2020) Predicting Human Clinical Outcomes using Mouse Multi−Organ Transcriptome. iScience (Cell Press) doi: 10.1016/j.isci.2019.100791

理化学研究所細胞システム動態予測研究チーム研究員募集

国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 細胞システム動態予測研究チーム(PI:城口克之)

募集職種: 研究員 1名

研究室の概要: 当研究室では、細胞システム動態の理解、予測、制御を目指し、新しい計測システムを構築することで、これまでに知られていない生命現象の発見、解明を試みています。特に、顕微鏡観察、オミックス計測(網羅的遺伝子発現解析など)などを組み合わせて、各細胞の特徴や内部状態を同定し、それらの細胞がシステム全体にどのような影響を与えるかなどについて研究しています。また、これらの研究により医科学への貢献も目指しています。

参考URL http://www.bdr.riken.jp/jp/research/labs/shiroguchi-k/

職務内容: 顕微鏡観察、1細胞操作、遺伝子配列・発現解析(次世代シークエンサ)、画像解析、機械・深層学習などに関連した技術や装置を開発・改良しながら、免疫、発生、再生、老化研究など(のいずれか)を実施する。

勤務地: 国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 大阪府吹田市古江台6-2-3

着任時期: 早目(応相談)

研究内容についての問合せ先: 国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター 城口克之 E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ さい。 お気軽にご相談ください。

公募の詳細: https://www.riken.jp/careers/researchers/20190603/

Seeking a Research Scientist, Laboratory for Prediction of Cell Systems Dynamics (PI: Katsuyuki Shiroguchi), RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research

Available Position: Research Scientist, one person, full-time.

Our lab: We want to develop new techniques to "see" something unknown, in order to understand biological systems and to contribute to medical science and our understanding of diseases. Especially, we are focusing on visualizing the distribution of cell states by accurate system-wide measurements with single molecule and/or single cell resolution. We are also developing a new system to study cell systems dynamics and to predict the cell fate by live imaging, cell manipulation, sequencing, etc. Biological targets may be development, differentiation, regeneration, immune system, etc.

Reference: http://www.bdr.riken.jp/en/research/labs/shiroguchi-k/index.html

Job Descriptions: A successful candidate will develop new method(s), including instruments, to measure parameters quantitatively from single cells, a few cells, or cells from tissues based on techniques of optical microscope, microfluidics, cell biology, and/or molecular biology, bioinformatics, machine learning, and will measure samples which are important in biology and medical sciences. Biological targets may be organoids, tissues, immune cells, etc, to study development, differentiation, regeneration, aging, immune system, etc.

Work location: RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, 6-2-3 Furuedai Suita Osaka 565-0874 Japan

Start of Employment: Earlier is better (Negotiable)

Inquiries for research contents Katsuyuki Shiroguchi Email: katsuyuki.shiroguchi[at]riken.jp Laboratory for Prediction of Cell Systems Dynamics RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research

Details:https://www.riken.jp/en/careers/researchers/20190603/

これまでに掲載したお知らせ

  • 京大「大規模脳神経3次元回路抽出から計算論的神経科学へ」研究員募集
  • 国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募
  • Seeking Research Scientist or Postdoctoral Researcher, Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
  • 明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募
  • ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)
  • JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト研究員募集
  • JST CRESTプロジェクト「細胞間接着・骨格の秩序形成メカニズムの解明と上皮バリア操作技術の開発」研究員募集
  • 京大情・論理生命学研・研究員募集
  • 独立行政法人理化学研究所、統合生命医科学研究センター統合ゲノミクスグループ 研究員または特別研究員の公募
  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任研究員の公募
  • 沖縄科学技術大学院大学学園(OIST)バイオインフォマティシャンの求人の募集
  • 「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域の「時間情報コードによる細胞制御システムの解明」(代表者:黒田真也(東京大学))研究員の募集
  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任助教等の公募
  • 東京大学黒田研 特任助教募集募集
  • Biology/Genetics/Evolution Postdoctoral Fellow Position, Fred Hutchinson Cancer Research Center (091006)