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From Japanese society for quantitative biology
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=== 研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ ===
 
=== 研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ ===
==== <span style="color: red">New!! </span>第27回CDBミーティング Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces のお知らせ====
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==== <span style="color: red">New!! </span>案内:3 Days Exploration of Reinforcement Learning & Biological Intelligence====
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テーマ: Reinforcement Learning & Biological Intelligence <br />
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内容:レクチャー(5,6日)、ワークショップ(7日)
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日時: 2019年3月5日(火)~7日(木) <br />
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場所: 東京大学理学部(5-6日)、駒場生産研(7日) <br />
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言語: 英語 <br />
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参加費: 無料 <br />
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参加申し込み: ホームページより事前申し込み <br />
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URL:http://http://symposium.crmind.net/RL2019/ <br />
  
【開催日】
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内容・概要: 本企画は、生体システムの知的行動や情報処理を、強化学習などの学習理論の枠組みで捉えるアプローチについて、広く学び、また議論することを目的としております。
2016年11月14日(月)、15日(火)
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必ずしも脳科学だけには限定せず、温度走性、細胞遊走、飛翔行動、免疫などより広範なカテゴリーの生体情報処理に対し、学習理論を活用してその設計原理を探求する問題に主眼をおいています。
  
【開催地】
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特に今回、イタリアトリエステの国際理論物理学センターより、物理学者でもあり生体の環境感知戦略への学習理論の応用に関する研究において第一線で活躍されているAntonio Celani主任( https://scholar.google.fr/citations?user=a5JvBbgAAAAJ&hl=ja )を招聘し、彼による強化学習のレクチャーおよびワークショップを企画しました。
理化学研究所 多細胞システム形成研究センター (RIKEN CDB)
 
  
【URL】
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5-6日は東大本郷にて強化学習のレクチャー、7日は東大駒場にてワークショップという3日間のスケジュールとなっております。
http://www.cdb.riken.jp/skin2016/
 
  
【参加・演題〆切】 
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プログラムの詳細、講演者、講演内容、会場などは上記のHPを参照いただけると幸いです。
2016年9月9日(金)
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参加費用は無料ですのでぜひご参加ください。
  
【参加費】
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なお、会場の収容可能人数の関係上、参加人数を把握するために参加登録をお願いしております。お手数ですが、上記HPから参加登録をお願いします。
無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)
 
・昼食代 2,000円(2日間)
 
・懇親会費 一般5,000円/学生1,000円一般:4,000円
 
  
【言語】
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皆様の参加をお待ちいたしております。
英語
 
  
【基調講演】
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==== <span style="color: red">New!! </span>BDRシンポジウム2019参加者募集中!====
Yann Barrandon (École Polytechnique Fédérale de Lausanne, Switzerland)
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テーマ: Control and Design of Biosystems <br />
Cheng-Ming Chuong (University of Southern California, USA)
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日時: 2019年3月25日(月)~27日(水) <br />
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場所: 理化学研究所 生命機能科学研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド) <br />
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言語: 英語 <br />
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参加費: 無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途) <br />
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昼食代: 3,000円(3日間) <br />
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懇親会費: 一般5,000円/学生1,000円 <br />
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参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み <br />
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締め切り: 2018年12月14日(金) <br />
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URL:https://www2.bdr.riken.jp/sympo/2019/ <br />
  
【概要】
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内容・概要:
本会議では、体表を「数ある器官の一つ」として見るのではなく、生命体と環境との境界をなす「スーパーバイオインターフェース」として捉え、体表を構成す る多種多様な細胞の間の相互作用が、多機能性と多様性を兼ね備えた器官のマクロな構造や機能を創発的に生み出す「体表戦略」について議論いたします。会議 での議論を通して、生命の体表戦略の本質的理解に迫るとともに、これまで治療法が確立されて来なかった難治性皮膚疾患の克服や、皮膚の完全再生に向けた戦 略についての新たな洞察が得られることを期待しております。
+
生命システムとは種々の構成要素の相互作用によって成立する動的なネットワークです。近年、複雑な生命システムの時空間的制御や要素間の協調的な動作機構の理解が急速に進展したことにより、様々な生物学的スケール(分子、細胞、組織、器官、個体等)における生命機能の「操作とデザイン」を目指す研究が盛んになりつつあります。例えば、人工的な細胞合成、胚様体やミニ臓器(オルガノイド)の作成、老化や生殖などのライフイベントへの介入や再構成、理論的あるいは工学的手法を融合させたアプローチなどの新しい試みが始まっています。これら「操作とデザイン」によるアプローチは生命の根源的理解に貢献するのみならず、医療分野に新しい領域を生む基盤となることが期待されています。
  
トピックスとしては以下のものを予定しております。
+
トピックスとしては、以下のものを予定しています。
(1) Epithelial formation
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(1) Making artificial embryos and organs
(2) Functional unit formation
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(2) Engineering approaches toward making artificial cells
(3) Maintenance and regeneration
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(3) Artificial control of the life cycle
(4) Evo-devo
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(4) Theoretical analysis for identifying/controlling biosystems
(5) New technologies
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(5) Cutting-edge technology for artificial control of biosystem
(6) Dysfunction and therapeutics
 
  
組織間の相互作用を横糸に、生物種間の多様性を縦糸にすることで、これまで繋がることが少なかった学問分野間の融合的な議論を誘発し、新たな視点で体表の高次機能と機能発現の理解を目指します。
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本シンポジウムでは、世界的な研究者たちと次世代の研究を切り開く若手研究者や学生が一堂に会して議論を深めることにより、新たな知見を生み出し人的交流が促進されることを期待しております。
  
本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、複数の演題には口頭発表をお願いする予定です。若手研究者や大学院生を含む、国内外からの多数のご応募をお待ちいたしております。
+
本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、一部の演題には口頭発表をお願いする予定です。また、海外からの参加者(大学院生、研究員)を対象としたTravel Fellowshipを用意し、国内外からの多数の参加申込をお待ちいたしております。 <br />
  
【お問い合わせ】
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連絡先:
CDBミーティング事務局
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BDRシンポジウム2019事務局
多細胞システム形成研究センター 研究推進室内
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国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター
〒650-0047神戸市中央区港島南町2-2-3
+
〒650-0047 神戸市中央区港島南町2-2-3  E-mail: bdr-sympo2019@ml.riken.jp
E-mail: skin2016@cdb.riken.jp
 
 
 
 
 
==== <span style="color: red">New!! </span>CDB Symposium 2016: Registration is now open!====
 
 
 
We are pleased to announce that the CDB Symposium 2016 will be held as follows:
 
 
 
Theme: Size in Development: Growth, Shape and Allometry
 
Date: March 28 (Mon.) – 30 (Wed.), 2016
 
Venue: RIKEN Center for Developmental Biology (CDB), Kobe, Japan
 
Registration deadline: Friday, December 11, 2015
 
Participation fee: FREE (Lunch and Banquet fee required separately - optional)
 
Lunch: 3,000 JPY (3 days)
 
Banquet: 5,000 JPY (General) / 1,000 JPY (Student)
 
URL: http://www.cdb.riken.jp/sympo2016/
 
 
 
For the CDB Symposium 2016, we plan to discuss the question of organismal size control. The size of animals and plants varies greatly among species, and sometimes within species as well. Despite this variability, individuals maintain remarkably constant shapes through the poorly understood process of scaling, and deviations in shape control often lead to pathological conditions. Furthermore, allometric conversion of organ shapes is a major driver of evolutionary diversification. Recent advances in the study of growth control and morphogen functions, as well as quantitative approaches of tissue shape control have brought us a fresh opportunity to revisit these long-standing questions.
 
 
 
The program of the 2016 CDB Symposium will feature presentations covering a broad range of topics, including (1) Growth Control, (2) Organ Size and Shape, (3) Scaling and Morphogenesis, (4) Evolution of Allometry.
 
 
 
We encourage the submission of abstracts for the poster session from many scientists to increase opportunities for lively and informative exchange of views. A small number of poster abstracts will be selected for oral presentations. A limited number of travel fellowships for graduate students and post-docs traveling to Japan will also be available.
 
 
 
We look forward to seeing you in Kobe, Japan in March 2016.
 
 
 
Contact:
 
RIKEN Center for Developmental Biology (CDB)
 
CDB Meeting Coordinators
 
2-2-3, Minatojima-minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan
 
TEL:+81-78-306-3010 / FAX:+81-78-306-3090
 
E-MAIL:sympo2016@cdb.riken.jp
 
  
 
====これまでに掲載したお知らせ====
 
====これまでに掲載したお知らせ====
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*CDBシンポジウム2018のご案内
 +
*4th International Workshop on Quantitative Biology (IWQB2017) Registration Open
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*CDBシンポジウム2017参加者募集中!
 +
*第28回CDBミーティング “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”開催のご案内
 +
*The 28th CDB Meeting “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions” Call for Application and Abstract Submission!
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*第27回CDBミーティング Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces のお知らせ
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*The 27th CDB Meeting. Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces
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*CDBシンポジウム2016/CDB Symposium 2016 参加者募集中!
 
*第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内
 
*第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内
 
* CDBシンポジウム2015案内
 
* CDBシンポジウム2015案内
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=== 求人情報のお知らせ ===
 
=== 求人情報のお知らせ ===
 
==== <span style="color: red">New!! </span>明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募====
 
 
業務内容: JST CESTプロジェクト「細胞間接着・骨格の秩序形成メカニズムの解明と上皮バリア操作技術の開発」の趣旨にそって、実験との共同研究のもと、上皮細胞系の細胞構造の形成過程、およびin vitro構成系実験の数理モデリングと解析を行う。研究内容の詳細に関しては、本研究課題に関する内容で、応募者の専門分野等を考慮して議論の上で決定致します。詳細は石原(shuji@meiji.ac.jp)までお問い合わせください。物理学,統計科学,数理生物学などの関連分野の専門性をもつ方で、生命科学分野において理論と実験との共同研究をとおした新規分野の開拓に興味があるかたのご応募をお待ちします。なお、本プロジェクトは研究代表者である月田早智子研究室(大阪大学•in vivo実験)、分担研究者である大岩和弘研究室(NICT•構成系実験)との共同研究です。
 
 
応募資格:着任時期までに博士号を取得していること。
 
 
着任時期は2015年10月以降。任期は年度毎更新で、評価によりプロジェクト終了(2018年3月末予定)まで再更新可能。適任者が決まり次第締め切ります。
 
 
件名に「PD募集」と明記し、以下の書類を添付して石原(shuji@meiji.ac.jp)までメールをしてください。
 
 
①履歴書
 
②主要な業績のリスト
 
③主要論文3本以内のPDF
 
④応募理由書 研究経歴や当研究課題で貢献できること (A4 2枚程度) 
 
⑤応募者について照会可能な研究者の方のemailアドレス
 
 
書類審査結果をメールでお知らせ致します。書類審査通過者に対しては、面接を実施致します。
 
 
==== <span style="color: red">New!! </span> 国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募 ====
 
募集職種:研究員または特別研究員 1名
 
 
職務内容:細胞生物学的手法、分子生物学的手法、免疫学的手法、シークエンス技術、光学顕微鏡、マイクロチップ技術、Bioinformaticsなどを基にして、単一細胞や少数
 
細胞、組織を対象にした(各種免疫系細胞、腸内細菌など)新しい定量計測法の
 
開発を行います。また、開発した方法を用いて、医科学的に重要な試料を測定
 
し、新しい切り口でサイエンスや医科学に貢献することを目指します。
 
 
勤務地:独立行政法人理化学研究所 統合生命医科学研究センター 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
 
 
着任時期:応相談
 
 
研究内容についての問合せ先:
 
国立研究開発法人理化学研究所統合生命医科学研究センター
 
オミクス研究ラボ  城口克之
 
E-mail: katsuyuki.shiroguchi [at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてくだ
 
さい。
 
 
公募の詳細:
 
http://www.riken.jp/careers/researchers/20150909/
 
 
==== <span style="color: red">New!! </span>Seeking Research Scientist or Postdoctoral Researcher, Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences====
 
 
Available Positions: Research Scientist or Postdoctoral Researcher, one person, full-time.
 
 
Job Descriptions: A successful candidate will develop new method(s) to measure parameters quantitatively from single cells, a few cells, or cells from tissues (immunological cells, microbiome, etc) based on techniques of cell
 
biology, molecular biology, immunology, sequencing, optical microscope,
 
microchip, and/or bioinfomatics. Using the developed method(s), she/he
 
will measure cells which are medically significant, and intend to contribute to science and medical science from a novel point of view.
 
 
Work location: RIKEN Center for Integrative Medical Sciences. 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama-shi, Kanagawa 230-0045 Japan
 
 
Start of Employment: Negotiable
 
 
Inquiries for research contents
 
Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical
 
Sciences
 
Katsuyuki Shiroguchi
 
Email: katsuyuki.shiroguchi[at]riken.jp
 
 
Details:http://www.riken.jp/en/careers/researchers/20150909/
 
  
 
====これまでに掲載したお知らせ====
 
====これまでに掲載したお知らせ====
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*京大「大規模脳神経3次元回路抽出から計算論的神経科学へ」研究員募集
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*国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募
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*Seeking Research Scientist or Postdoctoral Researcher, Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
 +
*明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募
 
*ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)
 
*ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)
 
*JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト研究員募集
 
*JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト研究員募集

Revision as of 23:12, 8 February 2019

News

定量生物学に関わる研究者間の情報交換を促進するために、新しく News page を設けました。

情報掲載に関する問い合わせ先

当ページへの情報の掲載を希望される方は、ご所属、連絡先、掲載内容及びいつまでに情報を掲載してほしいかを明記の上、下記メールアドレスまでご連絡頂きますようよろしくお願い致します。世話人が掲載手続きを進めさせて頂きます。尚、定量生物学の会のメンバーでなくても情報の掲載を受け付けますので、ぜひ積極的にご活用下さい。

連絡先:q.biology at gmail.com (迷惑メール対策のため@をatと表示しています。at を @ に置換してください)

研究費などのお知らせ

これまでに掲載したお知らせ

  • JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度研究提案の募集(第1期)について
  • JST戦略的創造研究推進事業(CREST、さきがけ)平成27年度CREST・さきがけ研究提案募集(第1期)の予告及び説明会の開催について
  • CREST「生命動態」領域 H26年度領域説明会の御案内
  • 「統合データベース講習会」受入れ機関募集のお知らせ
  • ライフサイエンスデータベース統合推進事業「統合データ解析トライアル」平成25年度研究開発提案募集
  • 戦略的創造研究推進事業 (CREST、さきがけ)  平成25年度研究提案の募集開始
  • 独立行政法人科学技術振興機構(JST) 平成25年度CREST・さきがけ研究提案募集説明会のご案内

研究会やセミナー,特別講義などのお知らせ

New!! 案内:3 Days Exploration of Reinforcement Learning & Biological Intelligence

テーマ: Reinforcement Learning & Biological Intelligence
内容:レクチャー(5,6日)、ワークショップ(7日) 日時: 2019年3月5日(火)~7日(木)
場所: 東京大学理学部(5-6日)、駒場生産研(7日)
言語: 英語
参加費: 無料
参加申し込み: ホームページより事前申し込み
URL:http://http://symposium.crmind.net/RL2019/

内容・概要: 本企画は、生体システムの知的行動や情報処理を、強化学習などの学習理論の枠組みで捉えるアプローチについて、広く学び、また議論することを目的としております。 必ずしも脳科学だけには限定せず、温度走性、細胞遊走、飛翔行動、免疫などより広範なカテゴリーの生体情報処理に対し、学習理論を活用してその設計原理を探求する問題に主眼をおいています。

特に今回、イタリアトリエステの国際理論物理学センターより、物理学者でもあり生体の環境感知戦略への学習理論の応用に関する研究において第一線で活躍されているAntonio Celani主任( https://scholar.google.fr/citations?user=a5JvBbgAAAAJ&hl=ja )を招聘し、彼による強化学習のレクチャーおよびワークショップを企画しました。

5-6日は東大本郷にて強化学習のレクチャー、7日は東大駒場にてワークショップという3日間のスケジュールとなっております。

プログラムの詳細、講演者、講演内容、会場などは上記のHPを参照いただけると幸いです。 参加費用は無料ですのでぜひご参加ください。

なお、会場の収容可能人数の関係上、参加人数を把握するために参加登録をお願いしております。お手数ですが、上記HPから参加登録をお願いします。

皆様の参加をお待ちいたしております。

New!! BDRシンポジウム2019参加者募集中!

テーマ: Control and Design of Biosystems
日時: 2019年3月25日(月)~27日(水)
場所: 理化学研究所 生命機能科学研究センター(兵庫県神戸市ポートアイランド)
言語: 英語
参加費: 無料(希望者のみ昼食代、懇親会費別途)
昼食代: 3,000円(3日間)
懇親会費: 一般5,000円/学生1,000円
参加申し込み・演題提出: ホームページより事前申し込み
締め切り: 2018年12月14日(金)
URL:https://www2.bdr.riken.jp/sympo/2019/

内容・概要: 生命システムとは種々の構成要素の相互作用によって成立する動的なネットワークです。近年、複雑な生命システムの時空間的制御や要素間の協調的な動作機構の理解が急速に進展したことにより、様々な生物学的スケール(分子、細胞、組織、器官、個体等)における生命機能の「操作とデザイン」を目指す研究が盛んになりつつあります。例えば、人工的な細胞合成、胚様体やミニ臓器(オルガノイド)の作成、老化や生殖などのライフイベントへの介入や再構成、理論的あるいは工学的手法を融合させたアプローチなどの新しい試みが始まっています。これら「操作とデザイン」によるアプローチは生命の根源的理解に貢献するのみならず、医療分野に新しい領域を生む基盤となることが期待されています。

トピックスとしては、以下のものを予定しています。 (1) Making artificial embryos and organs (2) Engineering approaches toward making artificial cells (3) Artificial control of the life cycle (4) Theoretical analysis for identifying/controlling biosystems (5) Cutting-edge technology for artificial control of biosystem

本シンポジウムでは、世界的な研究者たちと次世代の研究を切り開く若手研究者や学生が一堂に会して議論を深めることにより、新たな知見を生み出し人的交流が促進されることを期待しております。

本会を活発な情報交換の場とするため、一般参加者によるポスター発表を募り、一部の演題には口頭発表をお願いする予定です。また、海外からの参加者(大学院生、研究員)を対象としたTravel Fellowshipを用意し、国内外からの多数の参加申込をお待ちいたしております。

連絡先: BDRシンポジウム2019事務局 国立研究開発法人 理化学研究所 生命機能科学研究センター 〒650-0047 神戸市中央区港島南町2-2-3 E-mail: bdr-sympo2019@ml.riken.jp

これまでに掲載したお知らせ

  • CDBシンポジウム2018のご案内
  • 4th International Workshop on Quantitative Biology (IWQB2017) Registration Open
  • CDBシンポジウム2017参加者募集中!
  • 第28回CDBミーティング “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions”開催のご案内
  • The 28th CDB Meeting “Cilia and Centrosomes: Current Advances and Future Directions” Call for Application and Abstract Submission!
  • 第27回CDBミーティング Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces のお知らせ
  • The 27th CDB Meeting. Body Surface Tactics: Cellular crosstalk for the generation of super-biointerfaces
  • CDBシンポジウム2016/CDB Symposium 2016 参加者募集中!
  • 第26回CDBミーティング Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization開催のご案内
  • CDBシンポジウム2015案内
  • 2015年度「統合データベース講習会」受入れ機関募集
  • バイオイメージデータ解析の公開講座のご案内
  • 数理生物学サマーレクチャーコース第2回~データ解析入門~」のお知らせ
  • 京都大学生命科学研究科特別講義のお知らせ
  • 光イメージング若手研究会「光塾」のお知らせ

求人情報のお知らせ

これまでに掲載したお知らせ

  • 京大「大規模脳神経3次元回路抽出から計算論的神経科学へ」研究員募集
  • 国立研究開発法人理化学研究所、統合生命医科学研究センターオミクス研究ラボ 研究員または特別研究員 公募
  • Seeking Research Scientist or Postdoctoral Researcher, Laboratory for Quantitative Omics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
  • 明治大学理工学部石原研究室・生命現象の数理モデリングと理論解析を行う博士研究員の公募
  • ヘルシンキ大学研究員募集 (20141010)
  • JST・ERATO 佐藤ライブ予測制御プロジェクト研究員募集
  • JST CRESTプロジェクト「細胞間接着・骨格の秩序形成メカニズムの解明と上皮バリア操作技術の開発」研究員募集
  • 京大情・論理生命学研・研究員募集
  • 独立行政法人理化学研究所、統合生命医科学研究センター統合ゲノミクスグループ 研究員または特別研究員の公募
  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任研究員の公募
  • 沖縄科学技術大学院大学学園(OIST)バイオインフォマティシャンの求人の募集
  • 「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域の「時間情報コードによる細胞制御システムの解明」(代表者:黒田真也(東京大学))研究員の募集
  • 自然科学研究機構新分野創成センター特任助教等の公募
  • 東京大学黒田研 特任助教募集募集
  • Biology/Genetics/Evolution Postdoctoral Fellow Position, Fred Hutchinson Cancer Research Center (091006)